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マウスLRC相当領域のゲノム構造解析

小鼠LRC等效区基因组结构分析

基本信息

批准号：
12213046
负责人：
笠原正典
金额：
$ 1.92万
依托单位：
The Graduate University for Advanced Studies
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12213046/
关键词：
LRC NK細胞 KIR BACクローン Ly94

项目摘要

LRC(leukocyte receptor complex)として知られるヒト19q13.4領域には,NKリセプターとして機能するKIRの他に,KIRと類似した多くのIg様レセプター遺伝子(ILT,LAIRなど)が存在する.ILT,LAIRのなかには,MHCクラスI分子に結合する能力をもったものも存在することから,免疫制御において重要な役割を果たしている可能性がある.マウスでは,ILT,LAIRに相当する遺伝子群としてPIR-A,PIR-Bが同定されているが,KIRに相当する遺伝子はみいだされていない.したがって,ヒトとマウスのLRC領域には遺伝子構成という点で大きな差異が存在するものと予想される.そこで本研究では,BACクローンをもちいて,マウスLRC相当領域のゲノム構造を解明することを目的とした.(結果)1.Ly94遺伝子を含むBACクローンに,Tnnt1遺伝子,Tnni3遺伝子,Mbs85遺伝子,Flj20258遺伝子,Flj20510遺伝子,Gp6遺伝子を見出した.Tnni3,Tnnt1,Mbs85遺伝子はこの順に並んで存在し,また,Flj20510遺伝子とGp6遺伝子は並んで存在することが判った.ヒトでは,LY94遺伝子に隣接してFCAR遺伝子が存在するが,これまでのところ本遺伝子と相同と考えられる配列はBACクローン中に発見されていない.また,マウスのLy94遺伝子には,少なくとも7個のエクソンが存在することが判明した.2.Pir遺伝子を含むBAC contig中に少なくとも,3個のPirb遺伝子をみいだした.これらの遺伝子は既知のPirb遺伝子と同様なエクソン・イントロン構造をもっていた.既知のPirb遺伝子とは異なったIg様配列をもった配列が少なくとも2箇所で検出された.これが,偽遺伝子であるのか,新たなPir遺伝子であるのかは,検討中である.

LRC(leukocyte receptor complex) is known to exist in the domain of 19q13.4, and KIR functions in the domain of 19q13.4.ILT,LAIR, and similar Ig receptor complexes exist in the domain of 19q13.4.ILT,LAIR, and MHC molecules bind to each other. PIR-A,PIR-B and KIR are the same. There are many differences in the LRC domain. This study aims to clarify the structure of BAC and LRC. 1. Ly94, Tnt1, Tnni3, Mbs85, Flj20258, Flj20510, Gp6 genes were detected. Tnni3, Tnt1, Mbs85, Flj20510, Gp6 genes were detected. In addition,LY94 is a member of the FCAR family, and FCAR is a member of the FCAR family. 2. Pir gene is contained in BAC contig. 3 Pirb gene is contained in BAC contig. The structure of the structure. We know that the Pirb family is different from the Ig family.これが,伪遗伝子であるのか,新たなPir遗伝子であるのかは,検讨中である.