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脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の総合的解析

脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の総合的解析
脊椎动物基因组中旁系同源区域的综合分析
批准号：
15011217
负责人：
笠原 正典
金额：
$3.26万
依托单位：
The Graduate University for Advanced Studies
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2003 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15011217/
关键词：
パラロガス領域ゲノム重複MHC無顎類

项目摘要

项目成果

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われわれは、HLA (MHC)領域とパラロガスな領域がヒトゲノムに3箇所存在することを発見し、これらのパラロガス領域とHLA領域の原型が脊椎動物進化の初期におきたと想定される2回の大規模な染色体重複(おそらくはゲノム重複)によって形成された可能性が高いことを示してきた。今日では、本パラロガス群はヒトゲノムで同定された数多くのパラロガス領域のプロトタイプとしての地位を確立しつつある。しかしながら、パラロガス領域を生み出した重複の性質、回数、時期に関しては十分な理解が得られていないのが現状である。そこで、本研究では、系統発生的に2度の重複の直前、直後に位置すると考えられる無顎類(特に、ヌタヌナギ)に焦点を当てて研究を進め、以下の成果を得た。1)哺乳類とほぼ同じゲノムサイズをもつと推定されるヌタウナギのゲノムを3倍カバーするBACライブラリー(平均インサート長約100kb)を作製した。2)上記BACライブラリー(3倍ゲノムカバレッジ分)のスクリーニングを行い、7個のMHC前駆領域をカバーするBACクローンを同定し、その塩基配列を決定した。3)ヌタウナギ白血球由来cDNAライブラリーのランダム・シークエンスを行い、約12,000クローンの5'-end,3'-endの塩基配列を決定した。4)MHCパラロガス群に属するホヤ遺伝子を体系的に同定し、染色体重複後に生じたゲノム構造の変化を解析した。5)免疫グロブリンやT細胞抗原レセプターの祖先と推測される遺伝子群をヌタヌナギで同定し、AAR (ancestral antigen receptor)と命名した。
期刊论文(16)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Takahashi, T. et al.: "Natural killer cell receptors in the horse : evidence for the existence of multiple transcribed Ly49 genes."Eur.J.Immunol.. 34. 773-784 (2004)
Takahashi, T. 等人：“马中的自然杀伤细胞受体：存在多个转录 Ly49 基因的证据。”Eur.J.Immunol.. 34. 773-784 (2004)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Kasahara, M. et al.: "On the origins of the adaptive immune system : novel insights from protochordates and cold-blooded vertebrates."Trends Immunol.. 25. 105-111 (2004)
Kasahara, M. 等人：“关于适应性免疫系统的起源：来自原索动物和冷血脊椎动物的新见解。”趋势免疫学.. 25. 105-111 (2004)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Watanabe, Y. et al.: "Comparative genomics of the Mill family : a rapidly evolving MHC class I gene family."Eur.J.Immunol.. 34(印刷中). (2004)
Watanabe, Y. 等人：“Mill 家族的比较基因组学：快速进化的 MHC I 类基因家族。”Eur.J.Immunol.. 34（印刷中）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Kasahara, M.: "MHC genomics : from the proteasome to genome evolution. In : H. -G. Rammensee and R. Dawkins (eds.) : Antigen Processing - Mechanisms, Genomics and Evolution"Wiley-VCH(印刷中). (2004)
Kasahara, M.：“MHC 基因组学：从蛋白酶体到基因组进化。见：H. -G. Rammensee 和 R. Dawkins（编辑）：抗原加工 - 机制、基因组学和进化”Wiley-VCH（出版中）。 (2004)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 8 条
    新しい抗体試薬の開発と臨床検査への応用
    • 批准号：
      21659143
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.11万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      笠原 正典
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    無顎類のゲノムと免疫系
    • 批准号：
      20017001
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $6.27万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      笠原 正典
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    LRRを用いた抗原認識システムの開発
    • 批准号：
      19659120
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.11万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      笠原 正典
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    無顎類のゲノムと免疫系
    • 批准号：
      18017001
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.44万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      笠原 正典
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    海外基金