無顎脊椎動物cDNAクローンの大量塩基配列決定

无颌脊椎动物 cDNA 克隆的大规模核苷酸测序

• 批准号: 12202019
• 负责人: 笠原 正典
• 金额: --
• 依托单位: The Graduate University for Advanced Studies
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12202019/
• 关键词: 無顎類; メクラウナギ; cDNA; シークエンス; ゲノム重複

ヌタウナギとヤツメウナギによって代表される無顎類は,系統発生上,脊椎動物に最も近い無脊椎動物である原索動物とヒトが属する有顎脊椎動物の中間に位置している.近年,われわれを含めた複数の研究グループにより,原索動物と無顎類の中間段階,および無顎類と有顎脊椎動物の中間段階で各1回のゲノム重複がおこった可能性が高いことが提唱されている.もし,この仮説が正しければ,グノム重複による遺伝子数の飛躍的な増加が原索動物から有顎脊椎動物への進化において,きわめて重要な役割を果たした可能性がある.本研究では,ヌタウナギcDNAクローンをランダムにシークエンシングすることにより,ゲノム重複仮説の妥当性を検証するとともに,系統発生上枢要な位置を占めているにもかかわらず,これまで十分に顧みられることのなかった無顎類から配列データを収集することを目的とした.(結果)メクラウナギの血球由来cDNAクローンをランダムに1000個シークエンスした.これらのクローンのうちで,有顎脊椎動物において複数のパラロガスコピーを有する遺伝子につき,分子系統解析をおこなった.さまざまな生物種からの配列情報が入手可能であり,分子系統解析が有用と考えられたのは,HMG(high mobility group)protein,SOS(son of sevenless),enolase,aldolaseなどの遺伝子群であった.これらの遺伝子群のいずれにおいても,メクラウナギ由来の配列は有顎脊椎動物の特定のパラログとオーソロガスな関係を示さなかった.以上の結果は,少なくとも1回のゲノム重複が無顎類と有顎脊椎動物の中間段階で起こった可能性を支持する.

The most closely related invertebrate species, the most closely related invertebrate In recent years, there have been many studies on the possibility of duplication between protochordates and middle stages of gnathless vertebrates, and between gnathless vertebrates and middle stages of gnathless vertebrates. In addition, the number of genes in the genome is increasing, and the number of genes in the genome is increasing. In addition, the number of genes in the genome is increasing. In this study, we found that the system generated an important position in the center of the system, and the system generated a set of important positions in the center of the system. (Results) 1000 cDNAs of origin of blood cells were found. The analysis of molecular systems of gnawed vertebrates is a key to the development of molecular systems. HMG(high mobility group)protein,SOS(son of seventeen),enolase,aldolase, etc. The origin of the species is related to the specific species of gnawed vertebrates. These results support the possibility of the mid-stage origin of gnathless and gnawed vertebrates.

项目成果

Yawata,M.: "Nucleotide sequence analysis of the 〜35-kb region containing interferon-γ-inducible mouse proteasome activator genes."Immunogenetics. 53(印刷中). (2001)

Yawata, M.：“含有干扰素 γ 诱导的小鼠蛋白酶体激活基因的 ~35-kb 区域的核苷酸序列分析。”免疫遗传学（2001 年）。

笠原正典:(分担執筆): "MHCクラスI分子.南山堂医学大辞典 改訂19版"南山堂,東京(印刷中). (2001)

Masanori Kasahara：（贡献者）：“MHC I 类分子。Nanzando 医学词典，第 19 版”Nanzando，东京（目前正在印刷）（2001 年）。

Kasahara,M.: "Genome paralogy : A new perspective on the organization and origin of the major histocompatibility complex."Curr.Top.Microbiol.Immunol.. 248. 53-66 (2000)

Kasahara, M.：“基因组平行学：主要组织相容性复合体的组织和起源的新视角。”Curr.Top.Microbiol.Immunol.. 248. 53-66 (2000)

Kasahara M.(ed.): "Major Histocompatibility Complex: Evolution, Structure, and Function"Springer-Verlag, Tokyo-Berlin-Heidelberg-New York. 561 (2000)

Kasahara M.（主编）：“主要组织相容性复合物：进化、结构和功能”Springer-Verlag，东京-柏林-海德堡-纽约。

Flajnik,M.F.: "MHC genomics : A current overview."Immunity. 14(印刷中). (2001)

Flajnik, M.F.：“MHC 基因组学：当前概述。”免疫 14（出版中）。