OLETFにおけるNIDDM原因遺伝子のポジショナルキャンディデートクローニング

OLETF 中 NIDDM 致病基因的位置候选克隆

基本信息

  • 批准号:
    14013035
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 4.8万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 2003
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

・コンジェニック解析により、14個のNidd QTLの内、Nidd1、2、8、10および6の5個のQTLのみについて、OLETFアリルが劣性様式でNIDDMおよび肥満に影響すると確証された。それらのコンジェニックより、Nidd1と2、Nidd1と10およびNidd2と10のダブルコンジェニックを作製したが、QTL解析で検出されたエピスタシス効果は確証されなかった。また、Nidd10については、β細胞増殖能低下という表現型についてもQTLの確証がなされた。・ゲノムシフトアプローチにより得られたNidd1、2、6、8(Nidd10についてはCckar遺伝子が原因遺伝子であると推定された)における7個のポジショナルキャンディデート(Hnf4g、Nkx6a、Pnlip・Pnliprp1・Pnliprp2、およびCapn10・Neurod1遺伝子)のマッピング・変異・発現レベル解析、およびそのQTLゲノム領域に存在するラットUnigeneのマクロアレイ解析・competitive RT-PCR解析を行った。その結果、腸管からの脂肪吸収に関わるPnlipおよびPnliprp2遺伝子は、コード領域について変異は見られないものの、コントロールに比べOLETFで若齢時の膵における発現レベルが増加および減少しており、Nidd6の有望な候補となると考えられた。さらに、糖新生に関与しているPgc1遺伝子は、膵・肝・脂肪・筋肉組織において齢数時に関わらず、OLETF特異的な発現レベルの増加を示すことから、Nidd2の有望な候補となると考えられた。ラットゲノムTraceおよびHTGSデータベースを利用することで、Pnlip、Pnliprp2およびPgc1遺伝子のプロモーター領域およびイントロン領域を含めたラットゲノム配列についての検索を終了した。また、Niddlおよび8については、QTLゲノム領域に存在するラットUnigeneをプローブに、OLETF、F344およびコンジェニックの膵・肝・脂肪・筋肉組織からの経時的なRNAサンプルをターゲットとしたマクロアレイ解析を実行中である。・Nidd2および6については、そのゲノム領域内で組み換えが生じている(コンジェニック×F344)×コンジェニックのバッククロス交雑群での雄選抜個体が作製された。さらに、その個体を用いることで、当該形質が単純なメンデル遺伝様式に従って分離しており、当該QTLを単一遺伝子変異として扱うことができると明らかになったことから、QTLのファインマッピング、染色体位置の決定がなされた。
·Nidd QTL analysis was performed for 14 QTL, Nidd QTL for 1, 2, 8, 10, and 6 QTL, and OLETF analysis was performed for 5 QTL. QTL analysis was performed to detect the presence of Nidd1, Nidd2, and Nidd1 in response to the presence of Nidd1, Nidd1, and Nidd2. Nidd10, β-cell proliferation, phenotype and QTL identification Nidd1, 2, 6, 8 (Nidd10 (Hnf4g, Nkx6a, Pnlip, Pnliprp1, Pnliprp2, Capn10, Neurod1) were analyzed by PCR, and the results were analyzed by competitive RT-PCR. As a result, the fat absorption of the intestine is related to Pnlip and Pnliprp2, and the fat absorption of the intestine is related to Pnlip and Pnliprp2. The fat absorption of the intestine is related to Pnlip and Pnliprp 2. The fat absorption of the intestine is related to Pnlip and Pnliprp 2. Pgc1 gene, liver, fat, muscle tissue, number of genes, OLETF-specific gene, increase in gene expression, Nidd2 gene, candidate gene expression The use of Trace and HTGS data in the field of trace, Pnlip, Pnliprp2 and Pgc1 is complete. QTL analysis of RNA in liver, fat and muscle tissue is in progress. Nidd2 6 When the trait is pure, the chromosome is separated, when the QTL is a single gene, the chromosome is separated, and when the QTL is a single gene, the chromosome is separated, the QTL is separated, and the chromosome is located.

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Yamada, T.: "Genetic dissection of non-insulin-dependent diabetes mellitus in the OLETF rat"Reproductive Biotechnology. (in press).
Yamada, T.:“OLETF 大鼠非胰岛素依赖型糖尿病的基因解剖”生殖生物技术。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Nagata, Y.: "Differential display method used for the comparison of mRNA expression level among many samples"J.Anim.Genet.. 30. 3-10 (2002)
Nagata, Y.:“用于比较许多样品之间 mRNA 表达水平的差异显示方法”J.Anim.Genet.. 30. 3-10 (2002)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kose, H.: "Examination of OLETF-derived non-insulin-dependent diabetes mellitus QTL by construction of a series of congenic rats"Mamm.Genome. 13. 558-562 (2002)
Kose, H.:“通过构建一系列同源大鼠来检查 OLETF 衍生的非胰岛素依赖性糖尿病 QTL”Mamm.Genome。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Taniguchi, Y.: "Genomic structure and promoter analysis of the bovine leptin gene"IUBMB Life. 53. 131-135 (2002)
Taniguchi, Y.:“牛瘦素基因的基因组结构和启动子分析”IUBMB Life。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Tanomura, H.: "Detection of a quantitative trait locus for intramuscular fat accumulation using the OLETF rat"J.Vet.Med.Sci.. 64. 45-50 (2002)
Tanomura,H.:“使用 OLETF 大鼠检测肌内脂肪积累的数量性状位点”J.Vet.Med.Sci.. 64. 45-50 (2002)
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  • 发表时间:
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知道了