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OLETFにおけるNIDDM原因遺伝子のポジショナルキャンディデートクローニング

OLETF 中 NIDDM 致病基因的位置候选克隆

基本信息

批准号：
16012229
负责人：
山田宜永
金额：
$ 3.2万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16012229/
关键词：
OLETF NIDDM 肥満ポジショナルキャンディデートクローニング QTL QTG QTN

项目摘要

・肥満QTLとして検出されたNidd6のポジショナルキャンディデートであるPnlip遺伝子については、〜9.8kbの5'上流隣接領域、〜13.1kbのエクソン/イントロン領域および〜3.6kbの3'下流隣接領域をOLETFとF344でダイレクトシーケンスし、多型について解析した。その結果、転写開始点の上流〜3.4kbの位置に、F344アリルに比べOLETFアリルにおいてサイズが長いVNTR多型が検出された。そこで、Nidd6 QTLで、OLETFとは異なるアリルを有することがQTL解析により判明しており、Pnlip遺伝子発現レベルがOLETFに比べ減少しているBNとLETOについても、上記多型部分のシーケンス解析を行った。その結果、OLETFより短くF344と同じサイズであり、Pnlip遺伝子についての発現レベルの増加がOLETF特異的であることに加えて、当該遺伝子のVNTR多型はOLETFに特異的な多型を示すことが明らかになった。Ins1遺伝子では、プロモーター領域に同様なVNTR多型が存在し、それが骨格筋、脂肪組織および膵での発現レベルに影響を及ぼすことで糖尿病発症につながっているらしいとの報告がなされており、今回の発見は興味深いものである。また、NIDDM QTLとして検出されたNidd2のポジショナルキャンディデートであるPgc1遺伝子についても、発現レベルの増加がOLETFにおいて観察されることに加えて、イントロン領域に多くのSNP多型が存在していることが明らかにされた。・Nidd6および2のゲノム領域内で組み換えが生じている(コンジェニックxF344)xコンジェニックのバッククロス交雑群からの雄選抜個体12匹およびサブコンジェニック11系統を用いることで、Nidd6については、D1Rat90とD1Rat225の間の2.3cMの領域にQTLをファインマッピングした。さらに、Nidd2については、D1Rat1とD1Rat3の間の1.2cMの領域に存在することが明らかにされた。・上記、新規組み換えバックスロス交雑個体を用いることで、ファインマッピングされたNidd6 QTLがPnlip遺伝子のVNTR多型および発現レベルの変化と共分離していることが明らかにされた。また、Nidd2のファインマッピングされた領域にPgc1遺伝子が存在することが明らかにされた。・これらの結果より、PnlipおよびPgc1遺伝子がNidd6およびNidd2 QTLの原因遺伝子であるかもしれないという状況証拠が得られた。

・Fei満QTLとして検出されたNidd6のポジショナルキャンディデートであるPnlip伝子については,~9.8kbの5'upper adjacent area,~13 .1kbのエクソン/イントロン区および~3.6kbの3'Indecent Adjacent DomainをOLETFとF344でダイレクトシーケンスし, multi-typeについてanalyticsした. The result of その, the upper stream of the writing start point ~ 3.4kb の position, F344アリルに比べOLETFアリルにおいてサイズが长いVNTR multi-typeが検出された.そこで、Nidd6 QTL で, OLETF とはdifferent なるアリルを有することがQTL analysis により clarification しており, Pnlip 伝子発 appearレベルがOLETFに than べ reduce しているBN とLETO についても, the above mentioned multi-type part のシーケンスanalytic を行った.そのRESULTS、OLETFより小くF344と同じサイズであり、Pnlip伝子についての発行レベルのincreased OLE TF's specific であることにadds えて, and when the legacy child's のVNTR polytype はOLETF's specific なmultitype をshows すことが明らかになった. Ins1 缝子では, プロモーター区に同様なVNTR polytype がexistent し, それがbone grid, adipose tissue および膵での発appear レベルにeffectを和ぼすことでdiabetes diseaseにつながっているらしいとのreportがなされており、This chapter’s meeting is interesting and interesting.また、NIDDM QTLとして検出されたNidd2のポジショナルキャンディデートであるPgc1伝子についても、発行レベルのincreasedがOLETFにおいて観草されることに加えて、イントロン collar There are many SNP polytypes in the domain.・Nidd6および2のゲノム within the field of group みchange えが生じている(コンジェニックx F344 )ブコンジェニック11 system いることで, Nidd6 については, D1Rat9 0とD1Rat225の间の2.3cMの区にQTLをファインマッピングした.さらに、Nidd2については、D1Rat1とD1Rat3の间の1.2cMの区にexistingすることが明らかにされた.・The above mentioned, the new rule group えバックスロス曑 Individual を用いることで, ファインマッピングされたNidd6 QTL がPnlip legacy 伝子のVNTR polytype および発 appear レベルの変化とCO-isolation していることが明らかにされた.また、Nidd2のファインマッピングされた地にPgc1缝子がexistentすることが明らかにされた.・これらのRESULTより、PnlipおよびPgc1伝子がNidd6およびNidd2 The reason for the QTL is that the status of the disease is confirmed.