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OLETFにおけるNIDDM原因遺伝子のポジショナルキャンディデートクローニング

OLETF 中 NIDDM 致病基因的位置候选克隆

基本信息

批准号：
15012233
负责人：
山田宜永
金额：
$ 3.33万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15012233/
关键词：
OLETF NIDDM 肥満ポジショナルキャンディデートクローニング QTL QTG QTN

项目摘要

・OLETFのNIDDM・肥満発症に関与することがコンジェニックにより確証されているNidd1、2、8、10および6のQTLのうち、Nidd6については、腸管からの脂肪吸収に関わるPnlipおよびPnliprp2遺伝子が、コード領域について変異は見られないものの、コントロールのF344に比べOLETFで若齢時離乳直後の膵における発現レベルが増加および減少しており、有望な候補となると考えられている。また、Nidd2については、糖新生に関与しているPgc1遺伝子が、膵・肝・脂肪・筋肉組織において齢数時に関わらず、OLETFで発現レベルの増加を示すことから、有望な候補となると考えられている。Pnlip遺伝子については、〜4kbの5'上流隣接領域および〜13.1kbのエクソン/イントロン領域をOLETFとF344でシーケンスし、多型について解析した。その結果、転写開始点の上流〜3.4kbの位置に、VNTR多型が、およびイントロン6上に、2つのSNP多型が検出された。Pnliprp2遺伝子についても、〜6.4kbの5'上流隣接領域および〜17.6kbのエクソン/イントロン領域を解析したところ、イントロン7、8、9および11上に、4つのSNP多型が検出された。そこで、Nidd6 QTLで、OLETFとは異なるアリルを有することがQTL解析により判明しているBNとLETOについても、当該遺伝子の発現レベル解析および上記多型部分のシーケンス解析を行った。その結果、両遺伝子についての発現レベルの変化はOLETF特異的であること、Pnlip遺伝子のVNTR多型のみがOLETFに特異的な多型であることが明らかになった。Ins1遺伝子では、プロモーター領域に同様なVNTR多型が存在し、それが骨格筋、脂肪組織および膵での発現レベルに影響を及ぼすことで糖尿病発症につながっているらしいとの報告がなされており、今回の発見は興味深い点である。また、Pgc1遺伝子についても、発現レベルの変化はOLETF特異的であり、イントロン領域にOLETF特異的なSNP多型が存在していることが明らかにされた。・Nidd6および2のゲノム領域内で組み換えが生じている(コンジェニック×F344)×コンジェニックのバッククロス交雑群からの雄選抜個体を用いることで、Nidd6については、D1Rat90より動原体側1.4cM(体重)および0.7cM(脂肪量)の位置に、Nidd2については、D1Rat1とD1Rat3の間の2.5cMの領域に存在することが明らかにされた。

·OLETF NIDDM fat development related to the first, second, eighth, tenth and sixth QTL detection, Nidd6, third, fourth and sixth QTL detection related to intestinal fat uptake, Pnlip detection, Pnliprp2, fourth and sixth QTL detection, fourth and sixth QTL detection, fourth QTL detection, fourth QTL detection, It is expected that the candidate will be selected. Pgc1 gene, liver, fat, muscle tissue, number of times, OLETF, occurrence, increase, expected candidate, etc. Pnlip Genome,~ 4kb and 5'upstream contiguous domain,~ 13.1kb and OLETF, F344 and polytype analysis. Results: ~ 3.4kb upstream of the start point, VNTR polymorphism, SNP polymorphism, and SNP polymorphism. Pnliprp2 gene is detected in ~ 6.4kb 5'upstream contiguous domain and ~ 17.6kb 5' upstream contiguous domain. QTL analysis was performed to identify BN and LETO, and to analyze the occurrence of the gene. As a result, the VNTR polymorphism of the Pnlip gene is different from that of the OLETF-specific gene. Ins1 gene expression is related to the presence of the same VNTR polymorphism in different domains, including bone, subcutaneous fat, and other factors affecting the development of diabetes. Pgc1 gene mutation, development and transformation of OLETF-specific SNP polymorphism in OLETF-specific domains Within the required domain of Nidd6 and 2, there are multiple combinations of components (CONENJIKEK ×F344)× CONENJIKEK and VAKIKOKROSU cross-species groups where male selected individuals can be used. Nidd6 is located at the position of 1.4cM(body weight) and 0.7cM(fat mass) on the rotor side of D1Rat90, Nidd2 is located at the position of 1.4cM(body weight) and 0.7cM(fat mass), and the 2.5cM domain between D1Rat1 and D1Rat3 is located at the position of 1.4cM(body weight) and 0.7cM(fat mass).