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バクテリオファージゲノム及び遺伝子の共通性と多様性

バクテリオファージゲノム及び遺伝子の共通性と多様性
噬菌体基因组和基因的共性和多样性
批准号：
14015211
负责人：
有坂 文雄
金额：
$1.92万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2002 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14015211/
关键词：
感染機構バクテリオファージX線結晶解析超遠心分析分子集合リゾチームテイルリゾチーム収縮性尾部

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项目成果

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T4類縁ファージはT4ファージからの相同性の違いの度合いによって、Teven, Pseudo-Teven, Schizo-Teven, Exo-Tevenに分類される。最近、これらT4類縁ファージの全ゲノム配列が次々と決定されつつある。当研究室では、昨年テイルリゾチーム蛋白質(gp5)の結晶化・立体構造の解明に成功した。この蛋白質はN末端ドメイン、リゾチームドメイン、C末端ドメインの3つのドメインからなり、C末端ドメインは新規の3本鎖βヘリックス構造を形成している。このようなドメイン構造がT4ファージ類縁ファージの間でどのように保存されているかを調べた。その結果、RB69,RB49などPseudo-Tevenファージではβヘリックスの長さが若干異なるだけで構造も保存されていると考えられたが、Schizo-TevenファージであるKVP40ではリゾチームドメインが欠失していることが分かった。さらに、Exo-Tevenファージのspm2ではN末端ドメインだけが相同性が高く、リゾチームドメインもC末端ドメインも相同性が低く、3本鎖βヘリックスの存在も明らかではない。そこで、英国のMann博士より、spm2ファージのDNAを譲り受け、PCR法によって同ファージの遺伝子5をクローニングした。配列の確認も行ったがまだ大量発現には成功していない。他方、最近次々にファージの全ゲノム塩基配列が決定されつつある。そこで、これらのファージを検索し、69種、約7千五百のORFを収集した。これを国立遺伝研西川建教授の構築されたGTOPに登録し、同教授のご協力を得て網羅的な相互塩基配列比較を行うと共に、各ファージのゲノムの物理地図を作製している。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
金丸周司: "T4ファージの注射針複合体"生物物理. 43. 21-24 (2003)
Shuji Kanamaru：“T4 噬菌体针复合物”《生物物理学》43. 21-24 (2003)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Li ZHAO: "P15 and P3, the Tail Completion Proteins of Bacteriophage T4, Both Form Hexameric Rings"J.Bacteriol.. 185. 1693-1700 (2003)
赵丽：“噬菌体 T4 的尾部完成蛋白 P15 和 P3，均形成六聚环”J. Bacteriol.. 185. 1693-1700 (2003)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Shuji KANAMARU: "The Structure of the Bacteriophage T4 Cell-Puncuring Device"Nature. 415. 553-557 (2002)
Shuji KANAMARU：“噬菌体 T4 细胞穿刺装置的结构”自然。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
金丸周司: "T4ファージの構造生物学と感染のメカニズム"生化学. 74. 131-135 (2002)
Shuji Kanamaru：“T4 噬菌体的结构生物学和感染机制”生物化学 74. 131-135 (2002)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 6 条
    量子導線および蛍光ナノチューブを作成するためのナノリング蛋白質の合成制御
    • 批准号：
      09F09095
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.28万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      有坂 文雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    T4ファージの粒子形成に関わる分子間相互作用の解明
    • 批准号：
      16041213
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.84万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      有坂 文雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    T4ファージ収縮性尾部の分子間相互作用
    • 批准号：
      13033009
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $2.3万
    • 财政年份：
      2002
    • 负责人：
      有坂 文雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    T4ファージ収縮性尾部の分子間相互作用
    • 批准号：
      11169212
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
    • 资助金额：
      $1.79万
    • 财政年份：
      1999
    • 负责人：
      有坂 文雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    海外基金