バクテリオファージゲノム及び遺伝子の共通性と多様性

噬菌体基因组和基因的共性和多样性

• 批准号: 14015211
• 负责人: 有坂 文雄
• 金额: $ 1.92万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14015211/
• 关键词: 感染機構; バクテリオファージ; X線結晶解析; 超遠心分析; 分子集合; リゾチーム; テイルリゾチーム; 収縮性尾部

T4類縁ファージはT4ファージからの相同性の違いの度合いによって、Teven, Pseudo-Teven, Schizo-Teven, Exo-Tevenに分類される。最近、これらT4類縁ファージの全ゲノム配列が次々と決定されつつある。当研究室では、昨年テイルリゾチーム蛋白質(gp5)の結晶化・立体構造の解明に成功した。この蛋白質はN末端ドメイン、リゾチームドメイン、C末端ドメインの3つのドメインからなり、C末端ドメインは新規の3本鎖βヘリックス構造を形成している。このようなドメイン構造がT4ファージ類縁ファージの間でどのように保存されているかを調べた。その結果、RB69,RB49などPseudo-Tevenファージではβヘリックスの長さが若干異なるだけで構造も保存されていると考えられたが、Schizo-TevenファージであるKVP40ではリゾチームドメインが欠失していることが分かった。さらに、Exo-Tevenファージのspm2ではN末端ドメインだけが相同性が高く、リゾチームドメインもC末端ドメインも相同性が低く、3本鎖βヘリックスの存在も明らかではない。そこで、英国のMann博士より、spm2ファージのDNAを譲り受け、PCR法によって同ファージの遺伝子5をクローニングした。配列の確認も行ったがまだ大量発現には成功していない。他方、最近次々にファージの全ゲノム塩基配列が決定されつつある。そこで、これらのファージを検索し、69種、約7千五百のORFを収集した。これを国立遺伝研西川建教授の構築されたGTOPに登録し、同教授のご協力を得て網羅的な相互塩基配列比較を行うと共に、各ファージのゲノムの物理地図を作製している。

T4 Recently, the T4 category was selected for the full list of categories. The crystallization and three-dimensional structure of protein (gp5) were successfully elucidated in our laboratory. The protein forms a new 3-terminal, 3-terminal, and 3-terminal β-terminal structure. The structure of this paper is T4. The structure of this paper is T4. The structure of this paper is T4. Results, RB69,RB49, Pseudo-Teven, KVP40, Pseudo-Teven, KVP69, KVP69, KVP60, KVP69, KVP69, Exo-Teven spm2 has high identity, low identity and low identity. Exo-Teven spm2 has high identity and low identity. DNA-PCR, PCR and DNA sequencing A large number of successful cases were identified in the column. The other party, the most recent one, is determined by the base arrangement. A total of 69 species, about 7,500 ORFs, were collected. This is the first time that Professor Nishikawa of the National Institute of Technology has worked together to establish a framework for the study of the relationship between science and technology.

项目成果

金丸周司: "T4ファージの注射針複合体"生物物理. 43. 21-24 (2003)

Shuji Kanamaru：“T4 噬菌体针复合物”《生物物理学》43. 21-24 (2003)。

Li ZHAO: "P15 and P3, the Tail Completion Proteins of Bacteriophage T4, Both Form Hexameric Rings"J.Bacteriol.. 185. 1693-1700 (2003)

赵丽：“噬菌体 T4 的尾部完成蛋白 P15 和 P3，均形成六聚环”J. Bacteriol.. 185. 1693-1700 (2003)

Shuji KANAMARU: "The Structure of the Bacteriophage T4 Cell-Puncuring Device"Nature. 415. 553-557 (2002)

Shuji KANAMARU：“噬菌体 T4 细胞穿刺装置的结构”自然。

金丸周司: "T4ファージの構造生物学と感染のメカニズム"生化学. 74. 131-135 (2002)

Shuji Kanamaru：“T4 噬菌体的结构生物学和感染机制”生物化学 74. 131-135 (2002)。

Fumio ARISAKA: "The Tail Lysozyme Complex of Bacteriophage T4"The Int.J.Biochem.& Cell Biol.. 35. 16-21 (2003)

Fumio Arisaka：“噬菌体 T4 的尾部溶菌酶复合物”Int.J.Biochem。