RNAi依存的ヘテロクロマチン形成に重要なnon-coding RNA転写反応

非编码 RNA 转录反应对于 RNAi 依赖性异染色质形成很重要

• 批准号: 18055019
• 负责人: 村上 洋太
• 金额: $ 4.99万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18055019/
• 关键词: ヘテロクロマチン; RNAi; non-coding RNA; siRNA; 分裂酵母; サイレンシンク; RNAポリメラーゼII; 転写

分裂酵母のRNAi依存的ヘテロクロマチン形成において、RNAi経路が働く契機となるnon-coding RNAの転写はRNAポリメラーゼIIが行っている。さらにRNAポリメラーゼIIの2番目のサブユニットの変異rpb2-m203により、ncRNAの転写は起こるがその後のsiRNA合成がおきなることから、RNAポリメラーゼIIがRNAiによるncRNAからのsiRNA合成のステップに機能することがわかっていた。siRNA合成のどのステップでRNAポリメラーゼIIが機能するかをrpb2-m203変異株を用いて分子遺伝学的に解析したところ、ncRNAにArgonauteホモログを含むRITS複合体が結合するステップがこの変位により阻害されることがわかった。このことからRNAポリメラーゼIIが転写と共役してRITS複合体をncRNAに結合させていると考えられた。一方、このncRNAは転写後細胞質に輸送されず、クロマチン領域にとどまってRNAi関連因子群のプラットフォームとして機能することが予想されていたが、その証拠はなかった。ヒストンを標的とするRNA-クロマチン免疫沈降法を使い、実際ncRNAが転写後ヘテロクロマチンに結合していることを示した。この結合活性はヘテロクロマチンに依存せず、ヘテロクロマチン由来のncRNAが本来持つ性質であることが明らかになった。さらにこの結合がncRNAとDNAとのハイブリッド形成によることを示唆する、意外な結果を得ている。

RNAi-dependent RNA fragmentation in yeast, RNAi pathway formation, non-coding RNA transcription, RNA pathway II RNA RNA siRNA synthesis is characterized by the presence of RNA fragments and the presence of RITS complexes. This is the first time that RNA Polimera-II can be written and co-operated to bind the RITS complex to ncRNA. In one aspect, this ncRNA is intended for cytoplasmic transport and function in the RNAi domain. The target RNA was detected by immunoprecipitation method, and the target RNA was detected by immunoprecipitation method. This binding activity is dependent on the origin of the ncRNA. The combination of ncRNA and DNA can lead to unexpected results.

项目成果

Heterochromatin formation that depends on RNAi and non-coding RNA.

异染色质的形成依赖于 RNAi 和非编码 RNA。

• 发表时间: 2007
• 作者: Valencia-Burton;M.;Oki;M.;Johnson;J.;Seier;TA.;Kamakaka;R.;Haber;JE.;Hiromitsu Yamamoto;Maria Valencia-Burton;Akiko Tsumura;Tetsushi lida;Alexandra M Locovei;Maria A.Marchetti;Hiroaki Kato;Hidetsugu Kohzaki;沖昌也;沖昌也;中山潤一;中山潤一;沖昌也;沖昌也;中山潤一;村上洋太;中山潤一;中山潤一;中山潤一;沖昌也;沖昌也;沖昌也;沖 昌也;中山潤一;沖昌也;中山 潤一;村上洋太;村上洋太;村上洋太;村上洋太;村上洋太;村上洋太;村上洋太;沖昌也;沖 昌也;村上洋太;中山 潤一;沖 昌也;村上洋太;沖昌也;沖 昌也;中山潤一;中山 潤一;沖昌也;沖 昌也;村上洋太;中山潤一;中山 潤一;中山潤一;中山 潤一;沖 昌也;沖 昌也;中山潤一;中山 潤一;沖 昌也;村上洋太;沖 昌也;村上 洋太;中山 潤一;沖 昌也;沖 昌也;中山 潤一;村上 洋太
• 通讯作者: 村上 洋太

Transscription factor, Runxl recruits the polyomavirus replication origin to replication factories.

转录因子 Runxl 将多瘤病毒复制起点招募到复制工厂。

• 发表时间: 2007
• 期刊: J.Cell.Biochem 100
• 作者: Kato H.;et. al.;Kohzaki et al.;Murakami et al.
• 通讯作者: Murakami et al.

Runx3 expression during mouse tongue and palate development

• DOI: 10.1002/ar.a.20339
• 发表时间: 2006-07-01
• 期刊: ANATOMICAL RECORD PART A-DISCOVERIES IN MOLECULAR CELLULAR AND EVOLUTIONARY BIOLOGY
• 作者: Yamamoto, Hiromitsu;Ito, Kosei;Ito, Yoshiaki
• 通讯作者: Ito, Yoshiaki

Schizosaccharomyces pombe Orc5 plays multiple roles in the maintenance of genome stability throughout the cell

粟酒裂殖酵母 Orc5 在维持整个细胞的基因组稳定性方面发挥多种作用

• 发表时间: 2008
• 期刊: Cell Cycle (In press)
• 作者: Kato H.;et. al.
• 通讯作者: et. al.

The Cenp-B homolog, Abpl, interacts with the initiation protein Cdc23 and is required for efficient DNA replication in fission yeast.

Cenp-B 同源物 Abpl 与起始蛋白 Cdc23 相互作用，是裂殖酵母中有效 DNA 复制所必需的。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Cell Division 1
• 作者: Locovei;A. et al.
• 通讯作者: A. et al.