獲得免疫系起源の研究

获得性免疫系统起源的研究

• 批准号: 20017005
• 负责人: 名川 文清
• 金额: $ 5.38万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20017005/
• 关键词: 遺伝子再編成; 抗原受容体遺伝子; VLR; 無顎類; 進化; 獲得免疫; 獲得免疫系; ゲノム再編成; VLR遺伝子再編成

本研究課題では、VLR遺伝子再編成がどの様に制御されているかについて調べるため、ヌタウナギのVLR遺伝子(VLR_A及びVLR_B)の再編成をsingle-cell PCRを用いて解析した。その結果、VLR遺伝子は、両方のalleleで再編成を起こすことが可能であること、また、遺伝子再編成によりdefectiveなVLR遺伝子が出来上がる場合があること、functionalな再編成が起こったときには更に再編成が起こらないようにするフィードバック制御が働いていることが示唆された。defectiveな遺伝子がたまたま作り上げられてしまったときには、もう一方のalleleでもう一度再編成を行っている可能性がある。また、ヌタウナギのゲノムの配列を明らかにするために、シークエンスキャプチャー法(Roche Diagnostics)を用いて、germline LRR遺伝子セグメント(VLR_A及びVLR_B合わせて推定約千種、aileleを区別すると2千種)の配列を濃縮し、それらの配列を明らかにすることを試みた。single-cell PCR解析で得られた、多数の再編成後のVLR遺伝子の配列を基に、キャプチャー用アレイを設計・作製し、これを用いてヌタウナギのgermline LRR遺伝子セグメントを濃縮した。用いたヌタウナギのゲノムDNAは上記のSingle-cell PCRで用いたものと同じ個体から抽出したものである。シークエンスキャプチャーによりgermline LRR遺伝子セグメントを約1000倍に濃縮した。キャプチャーされたDNAの配列を決定した。

This research topic is to analyze the reassembly of VLR genes by single-cell PCR. As a result, VLR heritage is reversed, and the allele of the square is reorganized. When it is possible, the VLR heritage is reorganized. When it is not functional, the VLR heritage is reorganized. When it is possible, the VLR heritage is reorganized. Defective Roche Diagnostics is used to extract and extract the information from the list of LRR genes (VLR_A and VLR_B are estimated to be about 1,000 species and 2,000 species of ailele). Single-cell PCR analysis was performed on the basis of the alignment of most reassembled VLR genes and the design, production and use of the germline LRR genes. A Single-cell PCR is used to extract DNA from the genome. The LRR gene is concentrated by about 1000 times. The sequence of DNA was determined.

项目成果

無顎類における抗原受容体遺伝子の再編成とその制御

无颌物种抗原受体基因重排及其调控

• 发表时间: 2009
• 作者: Kishishita;N.;名川文清
• 通讯作者: 名川文清

無顎類抗原受容体遺伝子における体細胞高頻度突然変異

颌抗原受体基因的体细胞超突变

• 发表时间: 2008
• 作者: Natsuko Kishishita;et al.;岸下奈津子;高場啓之
• 通讯作者: 高場啓之

Allelic regulation of antigen-receptor gene assembly in hagfish

盲鳗抗原受体基因组装的等位基因调控

• 发表时间: 2009
• 作者: Natsuko Kishishita;et al.
• 通讯作者: et al.

Regulation of antigen-receptor gene assembly in hagfish

• DOI: 10.1038/embor.2009.274
• 发表时间: 2010-02-01
• 期刊: EMBO REPORTS
• 影响因子: 7.7
• 作者: Kishishita, Natsuko;Matsuno, Tatsuya;Nagawa, Fumikiyo
• 通讯作者: Nagawa, Fumikiyo