マボヤ卵内遺伝情報の網羅的解析による比較ゲノムのための物理遺伝地図の作成

通过综合分析马博亚蛋的遗传信息，创建比较基因组的物理遗传图谱

• 批准号: 15011222
• 负责人: 真壁 和裕
• 金额: $ 3.84万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15011222/
• 关键词: ホヤ; 母性因子; RNA; EST; BAC; 発現

脊索動物であるにも関わらずゲノムの重複のないホヤは脊椎動物のゲノムの機能研究の優れたモデル生物だと考えられる。本研究では、実験発生学的知見の最も多いマボヤの母性cDNAの塩基配列及び初期発生過程での発現パターンの解析を行いつつ、その結果を利用してゲノム上に遺伝子をマッピングしていくことでマボヤゲノム全体を俯瞰し、カタユウレイボヤのゲノム構造や発現パターンなどとの比較を可能にすることを目的とする。マボヤ受精卵cDNAのアレイドライブラリーの両側約500bpずつの塩基配列を決定し、約2万5千クローンの塩基配列の解析によって8千以上の遺伝子が数えられた。ホヤゲノム中には16,000程度の遺伝子がコードされていると推定され、卵内にはその半数弱の遺伝子が発現していると推測されるので、当初の目的の成果を挙げたことになる。発現パターンの解析についても、独自に開発した多検体同時処理可能なWMISH法を駆使して、約4,000クローンの発現プロファイルを収集した。その結果、大多数のものは胚全体に分布するものの,胚前方に隔離されるRNA、主に表皮に分化する動物半球に隔離されていくRNA、動物半球でも前側の細胞だけに局在するRNAや、筋肉や前後軸の形成に関する決定因子のある胚の後極に局在する多数のRNA、逆に後極を含む植物極側後方の細胞以外の細胞に受け継がれていくRNAなどがそれぞれ多数あることが見出された。そこで今年度は原腸胚のEST解析を新たに立ち上げ、胚性に発現してくる遺伝子について解析を開始した。さらにマボヤ単個体の精子DNA由来のBACライブラリー(20ゲノムイクイバレントカバレージ)を3Dプール化したものを用いて、上述のクローンの配列によるマッピングをしつつある。

Chordate is the most important animal in the world. This study is the most important part of our understanding of biological development, and we hope that we can make use of the results of this study to analyze the gene alignment and early development of maternal cDNA. About 25,000 zygote cDNA fragments were analyzed for nucleotide sequence analysis, and more than 8,000 cDNA fragments were detected. The results of the study were as follows: 1. The results of the study were as follows: 16,000 genes were detected in the egg, half of them were detected in the egg, and the results of the study were as follows: About 4,000 samples were collected by WMISH method for simultaneous processing of multi-mode products. Most of the cells in the embryo are isolated in the anterior part of the embryo, and most of the cells in the anterior part of the embryo are isolated in the posterior part of the embryo. The reverse pole contains cells other than the plant pole. This year, the EST analysis of gastrula is new, the EST analysis of gastrula is new, and the EST analysis is new. The sperm DNA of a single individual is displayed in 3D format by BAC (20 ° C) and used in the alignment of the above-mentioned genes.

项目成果

Wang, C-P., Yagi, K.: "Identification of a gene encoding a typical carboxy-glutamic a domain in the tunicate Halocynthia roretzi."J.Thrombosis and Hemostasis. 1. 118-123 (2003)

Wang, C-P., Yagi, K.：“被囊动物 Halocynthia roretzi 中编码典型羧基谷氨酸结构域的基因的鉴定。”J.血栓形成和止血。

Nakamura, Y.: "Localization and expression pattern of type 1 postplasmic mR in embryos of the ascidian Halocynthia roretzi."Gene Exp.Patterns. 3. 71-75 (2003)

Nakamura, Y.：“海鞘类 Halocynthia roretzi 胚胎中 1 型后质 mR 的定位和表达模式。”Gene Exp.Patterns。

Shepherdley, C.A.: "An Ascidian Homolog of Vertebrate Iodothyronine Deiodinases."Endocrinology. 145. 1255-1268 (2004)

Shepherdley，C.A.：“脊椎动物碘甲腺原氨酸脱碘酶的海鞘同源物。”内分泌学。

Kauffman, J.S.: "Neural expression of the Huntington's desease gene as a chord evolutionary novelty"J.Exp.Zool.(Mol.Dev.Evol.). 297B. 57-64 (2003)

Kauffman, J.S.：“亨廷顿病基因的神经表达作为和弦进化的新颖性”J.Exp.Zool.(Mol.Dev.Evol.)。