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核内におけるイントロン分解とスプライシング因子のリサイクル機構の解明

核内におけるイントロン分解とスプライシング因子のリサイクル機構の解明
阐明细胞核内含子降解和剪接因子回收机制
批准号:
15030222
负责人:
片岡 直行
金额:
$3.78万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004

项目摘要

项目成果

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真核生物の核にコードされる遺伝子の多くは、イントロンと呼ばれる介在配列によって分断化されている。このことにより、核内で合成されたmRNA前駆体が、細胞質において蛋白質合成の鋳型として機能するためには、イントロンを取り除きエクソン同士を連結するRNAスプライシングが必須である。スプライシングにより切り出されたイントロンは核内にとどまり、スプライシング因子が除去された後、分解されると考えられている。ヒトではイントロンはmRNA前駆体の実に95%を占めている。またイントロン上にはsnoRNAやmicroRNAなどの遺伝子発現調節に関わるnon coding RNAがコードされていることからも、イントロンの代謝は高等真核生物において重要だと思われるが、ほとんど解析されていない。本研究では、核内でのイントロンの代謝とそれに伴うスプライシング因子のリサイクル機構を解明することを目的としている。そこでこれまでに同定されている二つの因子、hDBR1とhPRP43に注目した。hDBR1と複合体を形成している因子を同定するため、培養細胞でFlagタグを付けたhDBR1とその不活性化変異体を発現させ、Flagタグに対する抗体を用いて免疫沈降を行った。その結果、新規のタンパク質因子を同定した。またin vitroでの結合実験より、この因子はhDBR1と特異的に結合することを確認した。またheterokaryon実験により、hDBR1が核と細胞質を往復する活性があることがわかり、細胞質での機能が示唆された。またRNAヘリケース様タンパク質であるhPRP43のヘリケースモチーフに変異を導入し、変異体をin vitroスプライシング反応に用いたところ、切り出されたラリアット型イントロンが安定化し、変異体タンパク質とともに沈降するのがみられた。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1111/j.1365-2443.2004.00774.x
发表时间: 2004-10-01
期刊: GENES TO CELLS
影响因子: 2.1
作者: [Masuyama, K, Taniguchi, I, Ohno, M]
通讯作者: Ohno, M
片岡直行: "脊髄性筋萎縮症(SMA)の分子生物学"蛋白質核酸酵素・増刊「RNAの細胞生物学」. 48・4. 524-531 (2003)
片冈直之:“脊髓性肌萎缩症(SMA)的分子生物学”蛋白质核酸酶特别版“RNA的细胞生物学”48・4(2003年)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Kawano, T.: "Ce-Y14 and MAG-1, components of the exon-exon junction complex, are required for embryogenesis and germline sexual switching in C.elegans"Mechanism of Development. 1211・1. 27-35 (2004)
Kawano, T.:“Ce-Y14 和 MAG-1,外显子-外显子连接复合体的组成部分,是秀丽隐杆线虫胚胎发生和种系性别转换所必需的”发育机制 1211・1 (2004)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Kataoka, N.: "A simple whole-cell lysate system for in vitro splicing reveals a stepwise-assembly of the exon-exon junction complex."Journal of Biglogical Chemistry. 279・8. 7009-7013 (2004)
Kataoka, N.:“用于体外剪接的简单全细胞裂解物系统揭示了外显子-外显子连接复合物的逐步组装。”《大逻辑化学杂志》279·8 (2004)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
6
    代謝制御性アミノ酸シグナルによる転写後調節制御機構の解明
    • 批准号:
      23K26864
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $7.49万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      片岡 直行
    • 依托单位:
    Elucidation of post-transcriptional regulation mechanism regulated by amino-acid metabolic signal
    • 批准号:
      23H02171
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.98万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      片岡 直行
    • 依托单位:
    Establishment of a novel Developmental RNA Biology field under hypoxia by using dual fluorescent color based splicing reporters
    • 批准号:
      22K19239
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.16万
    • 财政年份:
      2022
    • 负责人:
      片岡 直行
    • 依托单位:
    転写と共役したDNA修復とmRNAスプライシングとの連携の解析
    • 批准号:
      19657051
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额:
      $2.24万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      片岡 直行
    • 依托单位:
    海外基金