λファージCro蛋白質の2量体間S-S結合架橋変異体の立体構造解析
λファージCro蛋白質の2量体間S-S結合架橋変異体の立体構造解析
批准号:
07780574
负责人:
白川 昌宏
金额:
$0.64万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1995
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1995 至 --
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大腸菌バクテリオファージλ初期オペロンの遺伝子転写制御蛋白質であるCro蛋白質のVal55をCysに換えた点突然変異体の核磁気共鳴法(NMR)による構造解析を行った。このCroV55C変異体は(1)Cro蛋白質2量体の2つのサブユニット間にCys間のS-S結合が形成され、2つのサブユニットが架橋されていること、(2)野生型と比べて大きく熱安定化していること、(3)特異的DNA配列への結合能が数分の一に減少していること、などの性質を持つ。このCroV55C変異体についてCBCA(CO)NH,CBCANH,HNCO,HN(CA)CO,C(CO)NH,HBHA(CBCACO)NHなどの3重共鳴3次元NMRスペクトルの測定を行い、主鎖、側鎖のほぼ全ての^1H,^<15>N,^<13>C核の帰属を行った。またその過程で、蛋白質の^<15>N,^<13>C,^2Hによる同位体ラベルも行い、重水素ラベルと重水素デカップリングを利用してHN(CA)NH実験に大きな改良を施すことに成功した。この手法は分子量の大きな蛋白質の主鎖のシグナルの帰属に大変有用であると期待される。λCro蛋白質野生型のNMRシグナルの帰属は既に完了しているので、化学シフト値の比較をすることによって立体構造の差異を見積もったところ、野生型、V55C変異体間に立体構造の差異は殆ど無いことが示された。従って、サブユニット間のS-S結合は立体構造を換えないことが判った。
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白川昌宏: "The use of heteronuclear cross polarization for backbone assignment of 2H,15N and 13C-labeled proteins:A pulse scheme for triple resonance 4D correlation of sequential amide proton and nitrogen-15" Journal of biomolecular NMR. 5. 323-326 (1995)
Masahiro Shirakawa:“使用异核交叉极化进行 2H、15N 和 13C 标记蛋白质的主链分配:连续酰胺质子和氮 15 的三重共振 4D 关联的脉冲方案”《生物分子 NMR 杂志》5. 323-326。 (1995)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
森田勇人: "Structure of the Oct-3 POU-homeodomain in Solution,as Determined by Triple Resonance Heteronuclear Multidimensional NMR Spectroscopy." Protein Science. 4. 729-739 (1995)
Hayato Morita:“通过三重共振异核多维 NMR 光谱测定溶液中 Oct-3 POU 同源结构域的结构。蛋白质科学”4. 729-739。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
田栄浩: "Solution Structure of the Activator Contact Domain of the RNA Polymerase a Subunit." Science. 270. 1495-1497 (1995)
Eihiro Ta:“RNA 聚合酶亚基激活剂接触域的溶液结构”,《科学》270。1495-1497。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
松尾浩: "Backbone Dynamics of the λ-Cro Repressor Protein Determined by 15N Relaxation Measurements-Application of an Efficient Method for Calcuation of Dynamics Parameters." Journal of Molecular Spectroscopy. (印刷中).
Hiroshi Matsuo:“通过 15N 弛豫测量确定 λ-Cro 阻遏蛋白的骨架动力学 - 计算动力学参数的有效方法的应用”。分子光谱学杂志(正在出版)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
上垣浩一: "Secondary structure and folding topology of the DNA binding domain of interferon regulatory factor 2 as reveraled by NMR spectroscopy." FEBS letters. 359. 184-188 (1995)
Koichi Uegaki:“NMR 光谱显示干扰素调节因子 2 的 DNA 结合结构域的二级结构和折叠拓扑。”359. 184-188 (1995)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Regulation mechanism of intra-nuclear reactions studied by nanoscale magnetic resonance
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批准号:23H00370
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$30.2万
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财政年份:2023
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
Investigation the functional expression mechanisms of intracellular liquid droplets using in-cell magnetic resonance methods
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批准号:20H00453
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$28.95万
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财政年份:2020
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
ヒトDNA修復因子XPAの損傷DNA結合ドメインの溶液中での立体構造解析
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批准号:09269218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1997
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
ヒト遺伝子修復蛋白質XPAの損傷DNA特異的結合ドメインの立体構造解析
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批准号:08280219
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1996
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
低分子量G蛋白質PhoとProtein kinase Nの複合体の立体構造解析
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批准号:08780655
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1996
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
真核生物の転写調節因子複合体の溶液中での立体構造解析
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批准号:08250218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1996
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
真核生物の転写調節因子の立体構造決定と制御配列DNA分子認識に関する構造=的研究
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批准号:07258213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.05万
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财政年份:1995
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
PEBP-2のDNA結合:ヘテロダイマー形成の構造学的研究
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批准号:06780534
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1994
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
インターフェロン遺伝子転写調節因子と制御配列DNAの分子認識に関する構造学的研究
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批准号:06266209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.05万
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财政年份:1994
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
インターフェロン遺伝子転写調節因子の高次構造と制御塩基配列認識機構の研究
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批准号:05273213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1993
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
組換えの際に生じるDNA構造と蛋白質による識別
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批准号:05255204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1993
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
マウスOct-3蛋白質のPOUドメインの立体構造とサブドメイン構造の解析
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批准号:05780480
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1993
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
ロイシンジッパーモチーフを持つ酵母pap1^+蛋白質の立体構造とDNAとの相互作用
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批准号:03780247
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1991
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
Zn-フィンガーDNA結合モチーフを持つ酵母GAL4蛋白質のDNA認識機構
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批准号:02780237
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1990
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
遺伝子発現調節タンパク質の構造と機能
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批准号:63790467
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1988
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
海外基金