真核生物の転写調節因子複合体の溶液中での立体構造解析
真核生物の転写調節因子複合体の溶液中での立体構造解析
批准号:
08250218
负责人:
白川 昌宏
金额:
$1.41万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1996
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1996 至 --
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英文摘要
本研究の目的はカイコの発生に関わる制御するfushi tarazu遺伝子発現を制御するMBF1とFTZ-F1、ヒトの転写コアクチベータ-であるPC4などのDNA結合性、非結合性転写因子の溶液中での立体構造を決定し、遺伝子転写における転写因子間の蛋白質-蛋白質相互作用、転写因子の制御配列DNAの分子認識機構を立体構造的に明らかにすることである。手法としては核磁気共鳴法(NMR)を用いる遺伝研・上田均博士らとの共同研究として、昆虫の脱皮・変態に関わる転写因子FTZ-F1及び、そのメディエーターであるMBF1の立体構造解析を行った。MBF1のプロテアーゼによる限定分解により67-180の113残基からなるドメイン(MBF1コア)が溶液中で安定な立体構造を保持する構造ドメインを形成すること、またそのドメインがTBPと結合する活性を有することを明らかにした。多重共鳴多次元NMR法によりほぼ全ての原子核シグナルの帰属を終了した。得られた帰属を基に原子核間距離情報、角度情報を収集し、化学シフト値の情報と共に2次構造決定を行ったところ4つのヘリックスを持つことが判った。さらに溶液中での立体構造計算を行い、予備的な立体構造を得た。その結果、塩基性残基が多く見られるクレフトを持つヘリックスバンドル構造を持つことなどが示された。阪大・細胞生体工学センター大熊博士と共同研究を進めているヒトPC4についてもトリプシンによる限定分解とNMRスペクトル測定の結果、全長127アミノ酸残基中C末端の74残基の部分が安定な立体構造を溶液中で形成することが判明した。当該部分は少なくとも一本鎖DNAとの結合活性が有ることが知られている。これと他の転写因子との結合活性を調べると共に立体構造解析に向けてのNMR測定を進めている。
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Takahisa Ikegami: "An Efficient HN(CA)NH Pulse Scheme for Triple-Resonance 4D Correlation of Sequential Anade Protons and Nitrogen-15 in Deulerated Proteins." Journal of Magnetic Resonance B. 124. 214-217 (1997)
Takahisa Ikegami:“一种高效的 HN(CA)NH 脉冲方案,用于脱氢蛋白质中连续 Anade 质子和 Nitrogen-15 的三重共振 4D 相关性。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Hiroshi Matsuo: "Backbone Dynamics of the λ-Cro Repressor Protein Determined by 15N Relaxation Measurements-Application of an Efficient Method for Calculation of Dynamics Parameters." Journal of Molecular Structure. 379. 143-150 (1996)
Hiroshi Matsuo:“通过 15N 弛豫测量确定 λ-Cro 阻遏蛋白的骨架动力学 - 计算动力学参数的有效方法的应用。” 分子结构杂志 379. 143-150 (1996)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Hiroshi Imahori: "Linkage and Solvent Dependence of Photoinduced Electron Transfer in Zincporphyrin-C60 Dyads." Jouranal of the American Chemical Society. 118. 11771-11782 (1996)
Hiroshi Imahori:“锌卟啉-C60 二元体中光诱导电子转移的联系和溶剂依赖性。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
永田 恭介: "積み木細工の生物学 タンパク質と遺伝子の機能単位." 共立出版株式会社, 203 (1996)
永田恭介:“构件生物学:蛋白质和基因的功能单位。”共立出版有限公司,203 (1996)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Eugene H,Morita: "Implications of the zinc-finger motif found in the DNA-binding domain of the human XPA protein." Genes to Cells. 1. 437-442 (1996)
Eugene H,Morita:“在人类 XPA 蛋白 DNA 结合域中发现的锌指基序的含义。”
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 7 条
Regulation mechanism of intra-nuclear reactions studied by nanoscale magnetic resonance
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批准号:23H00370
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$30.2万
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财政年份:2023
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
Investigation the functional expression mechanisms of intracellular liquid droplets using in-cell magnetic resonance methods
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批准号:20H00453
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$28.95万
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财政年份:2020
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
ヒトDNA修復因子XPAの損傷DNA結合ドメインの溶液中での立体構造解析
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批准号:09269218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1997
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
ヒト遺伝子修復蛋白質XPAの損傷DNA特異的結合ドメインの立体構造解析
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批准号:08280219
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1996
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
低分子量G蛋白質PhoとProtein kinase Nの複合体の立体構造解析
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批准号:08780655
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1996
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
真核生物の転写調節因子の立体構造決定と制御配列DNA分子認識に関する構造=的研究
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批准号:07258213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.05万
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财政年份:1995
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
λファージCro蛋白質の2量体間S-S結合架橋変異体の立体構造解析
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批准号:07780574
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1995
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
PEBP-2のDNA結合:ヘテロダイマー形成の構造学的研究
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批准号:06780534
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1994
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
インターフェロン遺伝子転写調節因子と制御配列DNAの分子認識に関する構造学的研究
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批准号:06266209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.05万
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财政年份:1994
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
インターフェロン遺伝子転写調節因子の高次構造と制御塩基配列認識機構の研究
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批准号:05273213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1993
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
組換えの際に生じるDNA構造と蛋白質による識別
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批准号:05255204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1993
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
マウスOct-3蛋白質のPOUドメインの立体構造とサブドメイン構造の解析
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批准号:05780480
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1993
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
ロイシンジッパーモチーフを持つ酵母pap1^+蛋白質の立体構造とDNAとの相互作用
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批准号:03780247
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1991
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
Zn-フィンガーDNA結合モチーフを持つ酵母GAL4蛋白質のDNA認識機構
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批准号:02780237
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1990
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
遺伝子発現調節タンパク質の構造と機能
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批准号:63790467
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1988
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负责人:白川 昌宏
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依托单位:
海外基金