高等動物の染色体バンド領域の核内配置とその動態

高等动物染色体带区的核排列和动态

• 批准号: 10159215
• 负责人: 池村 淑道
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10159215/
• 关键词: 核内配置; non-B型構造; バンド境界; ポリプリン; ポリピリミジン配列; セントロメア; 複製タンミング; 超分子構造体; 三重鎖

DNA複製を行い、また遺伝子発現を活発に行っている分裂間期の核において、染色体DNAが高度に組織化された核内配置をとり、その配置自体が複製や遺伝子発現の制御に深く係わっている。高等動物染色体の高度に組織化された核内配置を決定する情報は、基本的には塩基配列に担われるが、その配列の実体と配置決定の分子機構は未知に残されている。三重鎖ならびにこの形成に伴って生じる単鎖は、生理条件下で他のDNA配列やRNAと配列特異的な対合を起こすことが可能であり、核内配置を決める機構として重要と考えられる。三重鎖形成能を持つポリプリン/ポリピリミジン配列、(AG/TC)nや(GAA/TTC)n等を蛍光プローブとして、ヒトの未変性間期核に対するin situ結合実験を行ったところ、配列特異的に特徴的なfoci状の結合像を得た。三重鎖に対する特異的モノクローナル抗体を用いて上記のfoci状シグナルとの位置関係を解析したところ、明瞭なcolocalizationが判明した。また、開期核内でのセントロメア部位との相対配置を解析したところ、ポリプリン/ポリピリミジン配列と同様に、三重鎖特異抗体もセントロメアの近傍部位に強いシグナルを与え、空間的には、三重鎖構造がセントロメアの近傍に集中して存在することが明らかになった。ヒトゲノム上に存在する大型のポリプリン/ポリピリミジン配列をプローブとしても同様な結果が得られた。染色体の種類によって、セントロメアに空間的に近接する三重鎖の配列が異なっていることが判明している。セントロメアおよびテロメアが、染色体の核内配置に重要な役割をはたすことは明らかであるが、染色体のバンド境界もランドマークをなす重要な部位と想定して研究を進めてきた。バンド境界は、複製時期の転換点やGC含量のモザイク境界として特定できると考えられる。X染色体のX不活化センターとその周辺、ならびにMHCとその周辺の非MHC領域を解析し、5ケ所のバンド境界が同定できた。いずれの境界にも大型のポリプリン/ポリピリミジン配列を含む特徴配列類が存在しており、その機能上の意味は興味深い。

Traces of DNA replication を い, ま た 伝 発 son now live を 発 に line っ て い る split interphase の nuclear に お い て, chromosome DNA が highly に organized さ れ た core configuration を と り, そ の configuration of autologous が copy や but 伝 発 is の suppression に deep く department わ っ て い る. Higher animals chromosomes の highly に organized さ れ た nuclear configuration を decision within す る intelligence は, basic に は salt base with column に bear わ れ る が, そ の match column の be body と configuration decided の molecular institutions は unknown に residual さ れ て い る. Triple lock な ら び に こ の form に with っ て raw じ る 単 は lock, physiological conditions で he の DNA with や RNA と with columns specific な us seaborne を up こ す こ と が may で あ り, nuclear configuration を definitely め る institutions と し て important と exam え ら れ る. Triple lock can form を hold つ ポ リ プ リ ン / ポ リ ピ リ ミ ジ ン column, (AG/TC) n や (the GAA/TTC) n を 蛍 light プ ロ ー ブ と し て, ヒ ト の not - sex interphase nuclei に す seaborne る in situ combined with be 験 を line っ た と こ ろ, listed specific に te 徴 な foci shaped の combination like を た. Triple lock に す seaborne る specific モ ノ ク ロ ー ナ を ル antibody with い て written の foci shaped シ グ ナ ル と masato is の position を parsing し た と こ ろ, clear な colocalization が.at し た. ま た, open phase within the nuclear で の セ ン ト ロ メ ア parts と の phase configuration seaborne を parsing し た と こ ろ, ポ リ プ リ ン / ポ リ ピ リ ミ ジ ン match column と with others に, triple lock specific antibodies も セ ン ト ロ メ ア の nearly alongside parts に strong い シ グ ナ ル を with え, space に は, triple lock structure が セ ン ト ロ メ ア の nearly alongside に concentrated し て exist す る こ と が Ming ら か に な Youdaoplaceholder0. ヒ ト ゲ ノ ム に exist on す る large の ポ リ プ リ ン / ポ リ ピ リ ミ ジ ン match column を プ ロ ー ブ と し て も with others な results ら が れ た. Types of chromosome の に よ っ て, セ ン ト ロ メ ア に space に nearly meet す る triple lock の match column が different な っ て い る こ と が.at し て い る. セ ン ト ロ メ ア お よ び テ ロ メ ア が, chromosome の core configuration に important cut を な service は た す こ と は Ming ら か で あ る が, chromosome の バ ン ド realm も ラ ン ド マ ー ク を な す important part な と scenarios し を て research into め て き た. バ ン ド realm は, copy の planning in some や GC content の モ ザ イ ク realm と し て specific で き る と exam え ら れ る. X chromosome の X not activate セ ン タ ー と そ の week 辺, な ら び に MHC と そ の weeks 辺 の of MHC fields を parsing し, 5 ケ の バ ン ド realm が with fixed で き た. Large い ず れ の realm に も の ポ リ プ リ ン / ポ リ ピ リ ミ ジ ン containing む 徴 especially with columns with column を が exist し て お り, そ の の mean は tumblers deep い on function.

项目成果

渡辺良久: "Borders of early and late replication zones are present in and around the human X-inactivation center(XIC): correlation with chromosome band zones." submitted.

Yoshihisa Watanabe：“早期和晚期复制区的边界存在于人类 X 失活中心 (XIC) 内和周围：已提交与染色体带区的相关性。”

大野みずき: "Non-B DNA structures spatially and sequence-specifically associated with individual centromeres in the human interphase nucleus." Chromosomes Today. 13(in press). (1999)

Mizuki Ohno：“非 B DNA 结构在空间和序列上与人类间期核中的单个着丝粒相关。”（1999 年出版）。

椎名崇: "Nucleotide sequencing analysis of the 146 kb segment around the IKBL and MICA genes at the centromeric end of the HLA class 1 region." Genomics. 47. 372-382 (1998)

Takashi Shiina：“HLA 1 类区域着丝粒末端 IKBL 和 MICA 基因周围 146 kb 片段的核苷酸测序分析。”47. 372-382 (1998)

池村淑道: "Genome and subnuclear organization of non-B forming DNAs in mammalian chromosomes." Cytogenet Cell Genet. 81. 101-102 (1998)

Yoshimichi Ikemura：“哺乳动物染色体中非 B 形成 DNA 的基因组和亚核组织。”Cytogenet Cell Genet。 81. 101-102 (1998)

大野 みずき: "Triplex-forming DNAs in the human interphase nucleus visualized in situ by polypurine/polypyrimidine DNA probes and anti-triplex antibodies. Triplex-forming DNAs are spatially and sequence-specifically associated with distinct centromeres." (subm

Mizuki Ohno：“通过多嘌呤/多嘧啶 DNA 探针和抗三链体抗体原位可视化人类间期核中的三链体形成 DNA。三链体形成 DNA 与不同的着丝粒在空间和序列上特异性相关。”