染色体バンド境界がハイリスク・ハイリターン領域である可能性の検証
验证染色体带边界是高风险/高回报区域的可能性
基本信息
- 批准号:13874101
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:2001
- 资助国家:日本
- 起止时间:2001 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
高等脊椎動物の複製は、200kb程度のレプリコンの単位で起き、数個から数十個のレプリコンがクラスターとして同調的に複製を開始する。このクラスターがバンド領域に対応しており、S期前半と後半のバンド間での複製時期の差は、複製開始時期の差を反映している。ヒト21番染色体長腕(35Mb)および11番長腕(80Mb)の全域を対象に、約450箇所のSTS部位の複製時期を塩基配列レベルで測定し、詳細な複製時期地図を作成した。11qおよび21qの解析から、GC含量の区分境界と複製時期の転換部位との間に密接な関係が存在しており、バンド境界の分子レベルでの要件をみたすことが判明した。複製時期の転換領域およびその周辺領域は、SNPの高頻度領域とも関係していた。S期前半から後半への複製時期の転換部位には腫瘍関連遺伝子や、家族性アルツハイマー病と関係したAPPや家族性ALSの原因遺伝子のSOD1、てんかん症と関係したGRIK1などの脳神経疾患遺伝子類が存在していた。11qおよび21qについて、マウスゲノムと比較し、染色体レベルで相同性の切り替わる部位を特定したところ、これらの部位は複製時期の転換領域またはその近傍に集中していた。複製時期の転換機構はヒトの疾患およびゲノム進化の分子機構と密接に関連しており、ゲノムに多様性をもたらす原因のひとつであると推定した。個体レベルで疾患を引き起こす可能性がある点ではハイリスク領域である。一方、進化的な視点に立てば、遺伝子コピーを増大させ、突然変異を起こし機能上の多様性の獲得を可能にすると考えられ、ハイリターン領域であるとのモデルを発表した(Human Molecular Genetics,11,13-21,2002)。また、我々のこのモデルはScience,294,2282(2001)にも紹介された。
Replication in higher vertebrates starts at 200kb and starts at dozens of sites. The difference between the first half and the second half of the S phase is reflected in the difference between the replication start period and the replication start period. A total of 21 chromosomes (35Mb) and 11 chromosomes (80Mb) were mapped, and the replication time of about 450 STS sites was determined. The analysis of 11q and 21q, the close relationship between the difference between the GC content and the replication time, and the elements of the molecular transformation of the GC content are identified. The frequency of SNP is higher than the frequency of SNP. In the first half of the S phase, there were three types of neurologic disease: SOD1, GRIK1, APP, familial ALS, and familial ALS. 11q The mechanism of change in replication period is related to the disease and molecular mechanism of evolution, and the cause of diversity is presumed. The possibility of individual illness is unknown in the field of health care. A party, evolutionary perspective, genetic diversity, growth, sudden change, acquisition of functional diversity, research, and development (Human Molecular Genetics,11,13- 21, 2002). This article is presented in Science,294,2282(2001).
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Y. Watanabe: "Chromosome-wide assessment of replication timing for human chromosomes 11q and 21q : disease-related genes in timing-switch regions"Human Molecular Genetics. 11. 13-21 (2002)
Y. Watanabe:“人类染色体 11q 和 21q 复制时序的全染色体评估:时序转换区域中的疾病相关基因”人类分子遗传学。
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- 发表时间:
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- 影响因子:0
- 作者:
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T. Fukagawa: "Creation and characterization of temperature-sensitive CENP-C mutants in vertebrate cells"Nucleic Acids Research. 29. 3796-3803 (2001)
T. Fukakawa:“脊椎动物细胞中温度敏感的 CENP-C 突变体的创建和表征”核酸研究。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
S.Kanaya: "Codon usage and tRNA genes in eukaryotes : correlation of codon usage diversity with translation efficiency and with CG-dinucleotide usage as assessed by multivariate analysis"J. Mol. Evol.. 53. 290-298 (2001)
S.Kanaya:“真核生物中的密码子使用和 tRNA 基因:密码子使用多样性与翻译效率以及通过多变量分析评估的 CG-二核苷酸使用的相关性”J.
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
T. Shina: "Genomic anatomy of a premier major histocompatibility complex paralogous region on chromosome 1q21-q22"Genome Research. 11. 789-802 (2001)
T. Shina:“染色体 1q21-q22 上首要主要组织相容性复合体旁系同源区域的基因组解剖”基因组研究。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
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- 作者:
- 通讯作者:
T. Fukagawa: "CENP-H, a constitutive centromere component, is required for centromere targeting of CENP-C in vertebrate cells"The EMBO Journal. 20. 4603-4617 (2001)
T. Fukakawa:“CENP-H 是一种组成性着丝粒成分,是脊椎动物细胞中 CENP-C 着丝粒靶向所必需的”EMBO 杂志。
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