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高等動物ゲノム配列と染色体構造の統合をめざす複製タイミングの高精度地図作成

高等動物ゲノム配列と染色体構造の統合をめざす複製タイミングの高精度地図作成
高精度复制时间图谱旨在整合更高的动物基因组序列和染色体结构
批准号：
13202062
负责人：
池村 淑道
金额：
$3.84万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2001 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13202062/
关键词：
染色体バンドS期内複製時期GC含量SNPがん遺伝子遺伝子密度病因遺伝子複製時期の転換部位

项目摘要

项目成果

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染色体バンドに代表されるようなゲノム上の大規模な不均一性の実体やその機能を分子レベルで解明することは、今後のゲノム解析および医学研究において重要な基礎知見を与える。この目的を遂行するため、ヒト21番染色体長腕(35Mb)および11番染色体長腕(80Mb)の全域を対象に、約450箇所のSTS部位のS期内複製時期を塩基配列レベルで測定し、詳細な複製時期地図を作成した。11qおよび21qの解析から、GC含量の区分境界と複製時期の転換部位との間に密接な関係があることが判明した。S期前半から後半への複製時期の転換部位には腫瘍関連遺伝子や、家族性アルツハイマー病と関係した遺伝子であるAPPや家族性ALSの原因遺伝子のSOD1、てんかん症と関係したGRIK1などの脳神経疾患遺伝子類も存在していた。複製時期の転換領域およびその周辺領域は、SNPの高頻度領域とも関係していた。11qおよび21qについて、マウスゲノムと比較し、染色体レベルで相同性の切り替わる部位を特定したところ、これらの部位は複製時期の転換領域またはその近傍に集中していることが判明した。これらの結果から、複製時期の転換機構は、ヒトの疾患およびゲノム進化の分子機構と密接に関連しており、ゲノムに多様性をもたらす原因のひとつであると推定した。詳細については、Hum.Mol.Genet.(Watanabe et al., Vol.11, 13-21, 2002)に発表した。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
T. Fukagawa: "CENP-H, a constitutive centromere component, is required for centromere targeting of CENP-C in vertebrate cells"The EMBO Journal. 20. 4603-4617 (2001)
T. Fukakawa：“CENP-H 是一种组成性着丝粒成分，是脊椎动物细胞中 CENP-C 着丝粒靶向所必需的”EMBO 杂志。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Y. Watanabe: "Chromosome-wide assessment of replication timing for human chromosomes 11q and 21q : disease-related genes in timing-switch regions"Human Molecular Genetics. 11. 13-21 (2002)
Y. Watanabe：“人类染色体 11q 和 21q 复制时序的全染色体评估：时序转换区域中的疾病相关基因”人类分子遗传学。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
T. Fukagawa: "Creation and characterization of temperature-sensitive CENP-C mutants in vertebrate cells"Nucleic Acids Research. 29. 3796-3803 (2001)
T. Fukakawa：“脊椎动物细胞中温度敏感的 CENP-C 突变体的创建和表征”核酸研究。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
S.Kanaya: "Codon usage and tRNA genes in eukaryotes : correlation of codon usage diversity with translation efficiency and with CG-dinucleotide usage as assessed by multivariate analysis"J. Mol. Evol.. 53. 290-298 (2001)
S.Kanaya：“真核生物中的密码子使用和 tRNA 基因：密码子使用多样性与翻译效率以及通过多变量分析评估的 CG-二核苷酸使用的相关性”J.
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
全ゲノム情報に基づいた病原微生物と常在菌の多様性と病原遺伝子に関する情報学的研究
全ゲノム情報に基づいた病原微生物と常在菌の多様性と病原遺伝子に関する情報学的研究
  • 批准号：
    17019018
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $0.83万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    池村 淑道
  • 依托单位：
    The Graduate University for Advanced Studies
ゲノムに潜むシグナル・モチーフ部品の網羅的探索のための自己組織化地図
  • 批准号：
    16014225
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $2.3万
  • 财政年份：
    2004
  • 负责人：
    池村 淑道
  • 依托单位：
    The Graduate University for Advanced Studies
ゲノムに潜むシグナル・モチーフ部品の網羅的探索のための自己組織化地図
  • 批准号：
    15014231
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $2.24万
  • 财政年份：
    2003
  • 负责人：
    池村 淑道
  • 依托单位：
    National Institute of Genetics
海外基金