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染色体バンド境界の分子レベルでの特定とその機能探索

分子水平上染色体带边界的识别及其功能探索

基本信息

批准号：
11874110
负责人：
池村淑道
金额：
$ 1.15万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
1999
资助国家：
日本
起止时间：
1999 至 2000
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11874110/
关键词：
病因遺伝子 GC含量分布ガン関係遺伝子染色体バンド境界ヒト21番染色体複製時期の転換点 S期内の複製時期複製フォークの休止染色体バンド複製タイミング X染色体の不活性化 S期 XIST バンド境界遺伝子密度 GC含量

项目摘要

高等脊椎動物の染色体バンド領域は、S期内の複製時期やGC%のMbレベルの区分構造に関係しており、遺伝子密度や発現様式を異にしたゲノムの機能ドメインと考えられるようになってきた。バンド境界は複製タイミングのスイッチ点やGC含量のモザイク境界として、塩基配列レベルで特定できる可能性が高く、境界を特徴づけるシグナル群が存在する可能性が考えられる。ヒト21番染色体長腕の全域と、ヒト11番染色体の長腕の全域を対象に、詳細な複製時期地図をゲノム配列レベルで作成した。染色体11qおよび21qの両方において、S期前半と後半の複製領域がRとGバンド領域に対応することが判明し、複製時期がS期前半から後半に明瞭に転換している領域を約30箇所、塩基配列レベルで特定できた。GC含量の区分境界と複製時期の転換部位とが密接に関係することも明らかになり、これらの転換部位をバンド境界の構造上ならびに機能上の要件を満たす部位として塩基配列レベルで特定した。バンド境界に対応する複製時期の転換部位には病因遺伝子、特に脳神経疾患遺伝子および癌関係遺伝子が集中して存在するとの予想外の知見を得た。複製時期の転換領域では、DNA複製フォークの進行が休止する可能性が指摘されており、組み換え頻度が上昇していると予想されてきた。染色体転座や遺伝子増幅と関係した癌関係遺伝子が、この領域に局在することと関係すると考えられる。バンド領域は複製時期と関係するだけではなく、クロマチン構造の粗密度と関係することも知られている。従って、染色体バンド境界においてはクロマチン構造の粗密度が転換している可能性が考えられる。バンド境界の持つこれらの特殊事情が、病因と関係する可能性を考えている。今回の研究は、病因の分子機構を知る手がかりを与えるだけでなく、あらたな病因遺伝子を能率的に探索する方法としても発展すると予想している。

In higher vertebrates, the chromosome domain is divided into two parts: the replication period, GC%, Mb, and the differentiation structure. The relationship between chromosome density and development mode is different. The probability of the existence of a specific group is high, and the probability of the existence of a specific group is high. The whole region of chromosome 21 and chromosome 11 are mapped and replicated in detail. Due to the square of chromosomes 11q and 21q, it is clear that the replication fields in the first half and second half of the S period are opposite to the R and G fields, and the replication period is clear from the first half of the S period to the second half of the S period. There are about 30 different fields, and the basic arrangement is specific. The GC content is divided into two parts: the first part is closely related to the second part, the third part is structurally related to the third part, and the fourth part is functionally related to the third part. The results show that there is a concentration of pathogenic genes, especially neuropathic genes, and cancer related genes in the site of replication in the field, and that there is an unexpected knowledge of the existence of these genes. The frequency of DNA replication is expected to increase, and the frequency of DNA replication is expected to increase Chromosome loci, genetic relationships, cancer relationships, genetic relationships, domain relationships, genetic relationships In the field of manufacturing, there is a clear understanding of the period and relationship of replication, and the density and relationship of the chip structure. The possibility of the coarse density of the chromosome structure is examined. A study of the possibility of a particular event, cause, or relationship. The research on the molecular mechanism of the disease has been carried out to explore the method of development.