权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

高等動物ゲノム配列と染色体構造の統合をめざす複製タイミングの高精度地図作成

高精度复制时间图谱旨在整合更高的动物基因组序列和染色体结构

基本信息

批准号：
12202049
负责人：
池村淑道
金额：
--
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

高等脊椎動物の染色体バンド領域は、S期内の複製時期やGC%のMbレベルの区分構造に関係しており、遺伝子密度や発現様式を異にしたゲノムの機能ドメインと考えられるようになってきた。生物学的意味に富んだバンド領域と塩基配列とを直接的に関係づけ、統合的に理解することは、ゲノム研究の主要な課題の一つである。配列が解読されたヒト染色体を対象に、複製時期の高精度地図を作成し、GC%の解析と合わせて、ゲノム配列とバンド領域の統合的な理解をめざした。複製時期の測定法としては、ヒト培養細胞をブロモデオキシウリジンで標識した後、セルソーターを用いてS期を4分画した。各分画について、BrdU標識された新生鎖DNA断片を精製し、鋳型として用いて、着目のSTS部位について定量的PCRを行い、各S期分画についてバンドを定量した。解析を完了したヒト21番染色体において、複製時期の転換部位を9箇所塩基配列レベルで特定でき、GC%の変移部位との概略の一致をみた。この転換部位に、脳神経疾患やガンと関係した遺伝子類が存在するとの予想外の知見を得た。11番染色体の長腕全域の複製時期の測定も完了したが、この染色体においても複製時期の転換部位に、サイクリンD1を含む種々の疾患関係遺伝子が見い出された。複製時期の転換部位は、変異や組み換えが起こりやすい部位と考えられており、これらの領域に疾患関係遺伝子が存在することは興味深い。進化的には、複製時期の区分化が確立した後に、温血脊椎動物において、S期の早期に複製する領域がGCrichになり、GC%の巨大な区分構造が形成されたと推定されている。温血脊椎動物のバンド構造の分子レベルでの基盤である。比較ゲノム的な研究が興味深い。複製時期の転換部位やGC%の区分境界については、ゲノム配列レベルで限定でき、境界を特徴づけるシグナル群が存在する可能性が考えられる。

In higher vertebrates, the chromosome domain is divided into two parts: the replication period, GC%, Mb, and the differentiation structure. The relationship between chromosome density and development mode is different. Biological implications include the following areas: basic alignment, direct relationships, integrated understanding, and major research topics. A high precision mapping of chromosomes and replication time, analysis and integration of GC%, and an integrated understanding of chromosome alignment and replication time. The method for determining the replication period of cultured cells is described in detail below. For each phase, BrdU markers are used to refine DNA fragments, type them, and quantify PCR at STS sites. For each phase, PCR markers are used to quantify DNA fragments. The analysis of 21 chromosomes was completed, and the transition sites of 9 chromosomes were identified. The transition sites of GC% were identified. This is the first time that we've seen this phenomenon. 11. The determination of the replication period of the whole chromosome length is completed, and the chromosome length is changed to the replication period, and the disease relationship gene is found in the chromosome D1. Copy period change position, change group change position, change position, change group change position, change group change position, change position The evolution of GCrich, GC% and GCrich is presumed after the establishment of the division of the replication stage, the warm-blooded vertebrate, and the early replication stage. The molecular basis of the structure of warm-blooded vertebrates can be seen. The study of comparison is of great interest. Copy time, change position, GC%, boundary, boundary, characteristic, boundary, boundary, boundary