触媒抗体の触媒機能発現メカニズムの解明と活性向上を目指した改変
触媒抗体の触媒機能発現メカニズムの解明と活性向上を目指した改変
批准号:
11132206
负责人:
嶋田 一夫
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 --
中文摘要
触媒抗体7C8は,触媒抗体6D9と同じエステル加水分解反応を触媒することが知られている.しかしながら,その触媒メカニズムは6D9とは異なり,単なる遷移状態の安定化以外の因子が重要であることが指摘されている.反応速度に関して,6D9抗体では,pH変化に伴う速度変化が線形であることが特徴であるのに対し,7C8では中性付近ではpHで対し線形であるがpH9付近でプラトーに達するprofileとなる.これは,pH9付近にpKaをもつ解離性アミノ酸残基が触媒反応に関与していることを示しており,X線結晶構造解析から,これはTyr95(H)であると考えられている.今回,より広いpH領域における反応速度依存性を調べたところ,さらにpH4.5付近に変曲点があることが明らかとなった.そこで,7C8の触媒反応進行要因を探るため,NMRにより7C8の反応部位のミクロ環境の解析を行った.エステル中心の炭素を^<13>Cで標識した反応基質を作成し,7C8結合時における^<13>C化学シフトのpH滴定実験を行った.その結果,pKaが4.6を有する解離性アミノ酸残基が,反応部位に影響を与えていることが明らかとなった.一方,各種アミノ酸選択的安定同位体(^<15>N,^<13>C)標識7C8アナログを用いた解析により,pKaが4〜5を有するアミノ酸はHis92(L)であると考えられた.これらの事実は,抗体7C8による触媒反応がTyr95(H)とHis92(L)の解離性アミノ酸残基の相乗的な作用により推進されている事を意味する.現在,これらのアミノ酸残基が関与した反応機構を明らかにするため,反応中間体のリアルタイム検出を行っている.また,6D9,7C8の触媒機能の改変,および新規高活性触媒抗体の作成を目指した,大腸菌によるFv発現系の構築を行っており,現在,発現ベクターの作成が完了したところである.
英文摘要
触媒抗体7C8は,触媒抗体6D9と同じエステル加水分解反応を触媒することが知られている.しかしながら,その触媒メカニズムは6D9とは異なり,単なる遷移状態の安定化以外の因子が重要であることが指摘されている.反応速度に関して,6D9抗体では,pH変化に伴う速度変化が線形であることが特徴であるのに対し,7C8では中性付近ではpHで対し線形であるがpH9付近でプラトーに達するprofileとなる.これは,pH9付近にpKaをもつ解離性アミノ酸残基が触媒反応に関与していることを示しており,X線結晶構造解析から,これはTyr95(H)であると考えられている.今回,より広いpH領域における反応速度依存性を調べたところ,さらにpH4.5付近に変曲点があることが明らかとなった.そこで,7C8の触媒反応進行要因を探るため,NMRにより7C8の反応部位のミクロ環境の解析を行った.エステル中心の炭素を^<13>Cで標識した反応基質を作成し,7C8結合時における^<13>C化学シフトのpH滴定実験を行った.その結果,pKaが4.6を有する解離性アミノ酸残基が,反応部位に影響を与えていることが明らかとなった.一方,各種アミノ酸選択的安定同位体(^<15>N,^<13>C)標識7C8アナログを用いた解析により,pKaが4〜5を有するアミノ酸はHis92(L)であると考えられた.これらの事実は,抗体7C8による触媒反応がTyr95(H)とHis92(L)の解離性アミノ酸残基の相乗的な作用により推進されている事を意味する.現在,これらのアミノ酸残基が関与した反応機構を明らかにするため,反応中間体のリアルタイム検出を行っている.また,6D9,7C8の触媒機能の改変,および新規高活性触媒抗体の作成を目指した,大腸菌によるFv発現系の構築を行っており,現在,発現ベクターの作成が完了したところである.
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S. Kawaminami: "A Multinuclear NMR Study of the Active Site of an Endoglucanase from a Strain of Bacillus: Use of Trp Residues as Structural Probes"J. Biol. Chem.. 274. 19823-19828 (1999)
S. Kawaminami:“芽孢杆菌菌株内切葡聚糖酶活性位点的多核 NMR 研究:使用色氨酸残基作为结构探针”J。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
M. Nakasako: "The ph-dependent structural variation of complementarity-detemining region h3 in the crystal structure of the Fv fragment from an anti-dansyl monoclonal antibody"J. Mol. Biol.. 291. 117-134 (1999)
M. Nakasako:“抗丹磺酰单克隆抗体 Fv 片段晶体结构中互补决定区 h3 的 ph 依赖性结构变异”J.
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
K. Kato: "Structural Basis of the Interaction between IgG and Fc Receptors"J. Mol. Biol.. (in press). (2000)
K. Kato:“IgG 和 Fc 受体之间相互作用的结构基础”J。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
K. Masuda: "Post-translational modifications of immunoglobulin G: A mouse IgG variant that lacks the entire CH1 domain"Mol. Immunol.. (in press). (2000)
K. Masuda:“免疫球蛋白 G 的翻译后修饰:缺乏整个 CH1 结构域的小鼠 IgG 变体”Mol。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
T. Torizawa: "DNA-binding mode of the Fab Fragment of the Monoclonal antibody specific for cyclobutane thymine dimer"Nucleic Acid Research. (in press). (2000)
T. Torizawa:“环丁烷胸腺嘧啶二聚体特异性单克隆抗体 Fab 片段的 DNA 结合模式”核酸研究。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
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批准号:15023216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.07万
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财政年份:2003
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
原子レベルでの病態解明に向けたハイスループットな分子間相互作用解析法の開発
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批准号:15012213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2003
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
HIV感染機構の解明:ケモカイン受容体・リガンド相互作用の構造生物学的研究
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批准号:15019020
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.52万
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财政年份:2003
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
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批准号:14026013
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2002
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
原子レベルでの病態解明に向けたハイスループットな分子間相互作用解析法の開発
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批准号:14013015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2002
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
HIV感染機構の解明:ケモカイン受容体・リガンド相互作用の構造生物学的研究
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批准号:14021016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2002
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
HIV感染機構の解明:ケモカイン受容体・リガンド相互作用の構造生物学的研究
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批准号:13226011
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2001
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
原子レベルでの病態解明に向けたハイスループットなタンパク質相互作用解析法の開発
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批准号:13204018
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2001
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
NMRを用いた紫外線損傷DNAの構造生物学的解析
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批准号:13214024
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.82万
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财政年份:2001
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
NMRを用いた紫外線損傷DNAの構造生物学的研究
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批准号:12213036
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2000
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
触媒抗体の触媒機能発現メカニズムの解明と活性向上を目指した改変
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批准号:12019209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2000
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
がん診断治療を目指した免疫グロブリンFvフラグメントの構造生物学的研究
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批准号:11140220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1999
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
NMRを用いたタンパク質分子に内在するダイナミックスの研究
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批准号:07280202
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1995
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
糖脂質NMRZデーターベースの構築
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批准号:01780225
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1989
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
核磁気共鳴法による糖脂質と糖結合性蛋白質の相互作用の解明
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批准号:63780233
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1988
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负责人:嶋田 一夫
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依托单位:
国内基金
海外基金
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适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
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批准号:JCZRYB202500181
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
NMR-CRISPR体系的构建及在肝癌ctDNA及miRNA联合检测中的应
用
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:冯春凤
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依托单位:
基于 NMR 指纹特征图谱与代谢组学结合模式追踪土家药
血筒果实中抗类风湿关节炎的效应物质
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批准号:2024JJ6347
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:苏维
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依托单位:
基于ResNet-CNN和2D1H.13C HSQC NMR技术的多基原藏药'阿布卡'品质整合评控体系构建
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批准号:--
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:杜欢
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依托单位:
基于微流控-μNMR平台的一滴血检测技术在糖尿病免疫表型分析中的应用研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:15.0万元
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批准年份:2024
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负责人:PENG WENG KUNG
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依托单位:
NMR研究乳酸化TGIF1调控TGF-β/Smad信号转导通路的分子机制
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批准号:22374155
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:胡锐
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依托单位:
基于In-cell NMR策略对“舟楫之剂”桔梗中引经药效物质的快速发现研究
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批准号:82305053
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2023
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负责人:王丽明
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依托单位:
基于“Geo-marker新概念—HPLC-MS-SPE-NMR联用技术—RONUS-HSQC新方法”研究中药道地性的物质基础——以川芎为例
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批准号:82374152
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项目类别:面上项目
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资助金额:48万元
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批准年份:2023
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负责人:熊亮
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依托单位:
锌基复合金属氧化物催化CO2加氢反应的固体NMR谱学研究
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批准号:22372160
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:高攀
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依托单位:
超极化增强的固体NMR方法及在分子筛催化不饱和醛选择性加氢反应中的应用研究
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批准号:22372179
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:王伟宇
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依托单位: