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NMRを用いた紫外線損傷DNAの構造生物学的研究

NMRを用いた紫外線損傷DNAの構造生物学的研究
使用 NMR 对紫外线损伤 DNA 进行结构生物学研究
批准号:
12213036
负责人:
嶋田 一夫
金额:
$2.24万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 --

项目摘要

项目成果

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本年度は安定同位体標識した紫外線損傷DNAを調製し,これを用いることで紫外線損傷DNAを認識・修復する高度好熱菌由来のCPD photolyaseの基質認識メカニズムの解明を行った.最少培地を用いて同位体標識した大腸菌DNAからヌクレオチド混合物を抽出・分離し,DNAポリメラーゼ反応を利用してTT配列を含む標識DNAオリゴマーを調製した.得られた標識DNAに紫外線を照射してシクロブタン型ピリミジンダイマー(CPD)を形成させ,相補鎖と組合せて二重鎖とした.多次元NMR法により,NMRシグナルの帰属を行った後,DNAの^<31>P-NMRシグナルを利用した解析から,CPDの認識にはDNAのリン酸基とphotolyaseの塩基性アミノ酸残基による静電相互作用が重要であることが判明した.またphotolyaseの変異体を用いた解析から,結合するDNAの配向を決定することができた.さらに,CPD部位はDNA二重らせんの外部に飛び出した(フリッブアウト)状態で,photolyaseの2つのクラスターにより形成されるキャビティー部分に結合することが明らかとなった.
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Kazuyasu Shindo: "Backbone ^1H,^<13>C, and ^<16>N resonance assignments of the anti-dansyl antibody Fv fragment"J.Biomol.NMR. 17. 357-358 (2000)
Kazuyasu Shindo:“抗丹磺酰抗体Fv片段的主链^1H、^13C和^16N共振归属”J.Biomol.NMR。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Matsuyoshi Masuda: "Pairing of oligosaccharides in the Fc region of immunoglobulin G"FEBS Lett.. 473. 349-357 (2000)
Matsuyoshi Masuda:“免疫球蛋白 G Fc 区寡糖的配对”FEBS Lett.. 473. 349-357 (2000)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Hideo Takahashi: "A Novel NMR Method for the Determination of the Interface of Large Protein-protein Complexes"Nature Struct.Biol. 7. 220-223 (2000)
Hideo Takahashi:“一种测定大蛋白质-蛋白质复合物界面的新型核磁共振方法”Nature Struct.Biol。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Koichi Kato: "Structural Basis of the Interaction between IgG and Fc Receptors"J.Mol.Biol.. 295. 213-224 (2000)
加藤浩一:“IgG 和 Fc 受体之间相互作用的结构基础”J.Mol.Biol.. 295. 213-224 (2000)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
6
    NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
    • 批准号:
      15023216
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.07万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      嶋田 一夫
    • 依托单位:
    原子レベルでの病態解明に向けたハイスループットな分子間相互作用解析法の開発
    • 批准号:
      15012213
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.33万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      嶋田 一夫
    • 依托单位:
    HIV感染機構の解明:ケモカイン受容体・リガンド相互作用の構造生物学的研究
    • 批准号:
      15019020
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.52万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      嶋田 一夫
    • 依托单位:
    NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
    • 批准号:
      14026013
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $2.43万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      嶋田 一夫
    • 依托单位:
    海外基金