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原子レベルでの病態解明に向けたハイスループットな分子間相互作用解析法の開発

原子レベルでの病態解明に向けたハイスループットな分子間相互作用解析法の開発
开发高通量分子相互作用分析方法以阐明原子水平的病理状况
批准号：
14013015
负责人：
嶋田 一夫
金额：
$3.33万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2002 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14013015/
关键词：
交差飽和法タンパク質複合体転移交差飽和法相互作用NMR

项目摘要

项目成果

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申請者の開発したNMRを用いた交差飽和法によるタンパク質複合体相互作用界面決定法は、複合体のNMRシグナルの観測を行うため、現実的な適用限界はタンパク質複合体の分子量が5万程度のものまでに限られていた。この場合、創薬のターゲットとなる可能性の高い膜タンパク質などの高分子量タンパク質複合体には適用が困難であった。そこで、その限界を打ち破るために、測定法の開発を行った。タンパク質複合体において、リガンドタンパク質を過剰量加えることにより、その分子について非結合状態と結合状態の交換系を作り出すことが可能となる。この交換が適当な頻度で起こっている場合、非結合状態の分子においても、結合状態で生じた交差飽和の影響を保持していると考えられる。よって、非結合状態由来のNMRシグナルを観測することにより、複合体そのもののNMRシグナルを観測せずに、複合体の相互作用界面に関する情報が得られると考えた(転移交差飽和法)。リガンド-タンパク質モル比、化学交換速度、溶媒の軽水/重水率、飽和方法・時間、等の探索を行なったところ、分子量164Kの複合体において界面の決定に成功した。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Noritaka Nishida: "Novel Collagen-Binding Mode of the VWA Domain Determined"Nature Struct.Biol.. (in press).
Noritaka Nishida：“确定了 VWA 结构域的新型胶原蛋白结合模式”Nature Struct.Biol..（正在出版）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Tamiji Nakanishi: "Determination of the Interface of a Large Protein Complex by Transferred"J.Mol.Biol. 318. 245-249 (2002)
Tamiji Nakanishi：“通过转移测定大蛋白复合物的界面”J.Mol.Biol。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Yoshimasa Kyogoku: "Structural Genomics of Membrane Proteins"Accounts.Chem.Res.. (in press).
Yoshimasa Kyogoku：“膜蛋白的结构基因组学”Accounts.Chem.Res..（正在出版）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Koh Takeuchi: "Solution Structure of ω-Grammotoxin SIA, a gating modifier of P/Q and N"J.Mol.Biol.. 321. 517-526 (2002)
Koh Takeuchi：“ω-Grammotoxin SIA 的溶液结构，P/Q 和 N 的门控修饰剂”J.Mol.Biol.. 321. 517-526 (2002)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 6 条
    NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
    • 批准号：
      15023216
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.07万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      嶋田 一夫
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    原子レベルでの病態解明に向けたハイスループットな分子間相互作用解析法の開発
    • 批准号：
      15012213
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.33万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      嶋田 一夫
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    HIV感染機構の解明:ケモカイン受容体・リガンド相互作用の構造生物学的研究
    • 批准号：
      15019020
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.52万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      嶋田 一夫
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析
    • 批准号：
      14026013
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $2.43万
    • 财政年份：
      2002
    • 负责人：
      嶋田 一夫
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    海外基金