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線虫転写因子群の系統的遺伝子破壊株を用いた網羅的ゲノム機能解析

使用线虫转录因子的系统基因破坏菌株进行全面的基因组功能分析

基本信息

批准号：
12202048
负责人：
三谷昌平
金额：
--
依托单位：
Tokyo Women's Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12202048/
关键词：
線虫転写因子ゲノム遺伝子破壊株

项目摘要

<背景と目的>線虫C.elegansでは細胞系譜や形態の記載が完成しており、ゲノムやcDNAの塩基配列情報が整備されている。発現バターンやホモロジーなどの情報により着目する遺伝子の機能を逆遺伝学的手法を用いた解析することが有用と思われる。逆遺伝学的手法の代表的なものとしては、RNA干渉法と欠失変異体分離法とに分けられる。我々は、後者の手法を用いて、発生解析に供することができるような転写因子を中心とした変異体分離を進めている。<検討結果>(1)変異体分離:転写因子については、63遺伝子の変異体を分離済である。その他にも、共同研究および、国際的線虫遺伝子ノックアウトコンソーシアムの活動による変異体分離を行っており、累計113遺伝子に至っている。さらに、解凍待ち、およびSib-screening中の変異体後補が65遺伝子あり、近日中に分離できると期待される。(2)系統的表現型解析:転写因子群の中で、線虫で6個あるCutクラスホメオボックスに着目し、変異体分離と発現解析を行っている。初期胚で多数の細胞に発現し、後に少数のニューロンでの特異的発現に移行していくバターンが多い。今後、詳細な表現型解析を行う予定である。(3)神経系を中心に細胞標識を作成している。現在までに、発現細胞既知の26種類のプロモーターについての発現コントラクトができている。また、上述の転写因子等で特異的発現バターンの遺伝子について、正確な発現細胞の同定を行い、細胞標識や強制発現のツールに加えて行く予定である。<考察>線虫の欠失変異体分離は、極めて非効率的な実験であった。我々は、効率良く分離する技術を開発し、変異体分離を進めている。平成12年秋より、線虫遺伝子ノックアウトコンソーシアムに加盟しており、ノックアウトストレインを用いたゲノム機能解析全般に貢献したい。

<Background and Purpose> The cell lineage and morphology of C. elegans have been documented and the cDNA base alignment information has been prepared.発成バターンやホモロジーなどのinformationにより目する伝子のFunctional techniques are used to analyze and analyze them, and they are useful and thought-provoking. Typical techniques of reverse genetics include Nakoto, the RNA interference method, and the isolation method for isoforms. I 々は, the latter's technique is used いて, 発生analytic にsupply することができるような転write factor をcenter とした変variant separation を入めている. <Results of discussion> (1) Separation of allotypes: 転WRITE factor については, 63 缝子の変 allogene をSeparation 済である.そのTAにも, joint research および, international nematode legacy 伝子ノックアウトコンソーシアムのactivitiesによる変variant separationを行っており, a total of 113 remaining 伝子に to っている.さらに, thawing waiting ち, およびSib-screening in the の変 allogeneic backfill が65 伝子あり, recently separated in にできるとLooking forward to される. (2) Phenotypic analysis of the system: 転WRITE factor group の中で, nematode 6 あるCut クラスホメオボックスに目し, 剉variant separation と発行を行っている. There are many cells in the early stage of the embryo, and there are many cells in the later stages. From now on, detailed phenotype analysis will be carried out and determined. (3) The center of the God's system and the cell mark are created. At present, 26 types of までに and 発 appear cells are known.また, the above-mentioned の転WRITING factors and other specific 発appear バターンの缝子について, correct 発The current cells are determined by the same rules, and the cell labels are forced to appear by the same rules. <Investigation> Nematode nematodes lack the ability to separate different bodies and are extremely inefficient. I have high efficiency, good separation technology, high efficiency, and high efficiency separation technology. In the autumn of 2012, Toyo, Nematode's remaining child, Nanako, joined the team.り、ノックアウトストレインを Use the いたゲノム function to analyze all the contributions of したい.