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新しく発見した短鎖ペプチド配列「触媒カセット」の性能評価と人工酵素の設計

新发现的短肽序列“催化盒”性能评价及人工酶设计

基本信息

批准号：
12875158
负责人：
宇田泰三
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Hiroshima Prefectural University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至 2001
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12875158/
关键词：
触媒酵素抗体アミノ酸残基三つ組み残基アミノ酸

项目摘要

「触媒カセット」の概念は抗体酵素の触媒三つ組み残基(Asp, His, Ser)の研究をして行く過程において生まれた。我々が作製した天然型抗体酵素の中であるものは、非常に短いアミノ酸配列(5残基)で触媒三つ組み残基様構造を持つことが判った。そしてその抗体の酵素活性部位はその5残基と推定された。そこで、我々はこの短い配列を「触媒カセット」と呼び、その化学的および免疫学的機能を検索している。触媒三つ組み残基は上記のような短い配列のなかにどの程度序在するのかを調べた。その結果、我々が新しく見出したいくつかの天然型抗体酵素の遺伝子解析、および分子モデリングから興味ある事実が判明した。連続した3,5,8,9残基のような短い配列で触媒三つ組み残基様構造が構成されてていた。(勿論、いくつかはかなり長い配列で立体的に触媒三つ組み残基様構造をしている。)通常、酵素の活性サイト(Asp, His, Ser残基からなる)は、こうした短い配列で出来上がるのではなくて、長い配列の中に。たまたま上記三残基が立体的に近い距離に来たときに出来るものである。今回、上記のペプチド(直鎖状:5mer)を合成し、そのペプチダーゼ活性を基質としては人工基質のBoc-Glu-Lys-Lys-MCAを用いて調べたが、酵素活性は認められなかった。この原因としては、直鎖だときっちりした立体構想が取れないこと、また、活性を発揮するための電荷リレーがうまく行かないなどが考えられる。従って、今後はこの点を考慮に入れながらペプチドを設計する必要があろう。

The concept of "catalyst" is to study the catalytic residues (Asp, His, Ser) of antibody enzymes in the process of development. I am working on a natural antibody enzyme, and I am very short of acid alignment (5 residues) and catalytic tri-residue structure. The active site of the antibody enzyme is estimated to be 5 residues. The chemical and immunological functions of the catalyst are discussed in detail. The catalyst residues are listed in the order of the degree of alignment. As a result, we found that the natural antibody enzyme gene was analyzed and the molecular protein was detected. The residues 3, 5, 8 and 9 are aligned in a short sequence, and the structure of the three groups of residues is composed. (Regardless of the structure of the residue of the catalyst three groups, the structure of the residue of the catalyst three groups and the structure of the catalyst three groups.) Usually, enzyme activity is divided into three groups: Asp, His, Ser residues, long residues and short residues. The three residues are close to each other In this paper, the synthesis and enzyme activity of Boc-Glu-Lys-MCA in artificial matrix were studied. The reason for this is that the three-dimensional conjecture is based on the following: In the future, it is necessary to consider the design of the project.