新しく発見した短鎖ペプチド配列「触媒カセット」の性能評価と人工酵素の設計

新发现的短肽序列“催化盒”性能评价及人工酶设计

基本信息

批准号：
12875158
负责人：
宇田泰三
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Hiroshima Prefectural University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至 2001
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12875158/
关键词：
触媒酵素抗体アミノ酸残基三つ組み残基アミノ酸

项目摘要

「触媒カセット」の概念は抗体酵素の触媒三つ組み残基(Asp, His, Ser)の研究をして行く過程において生まれた。我々が作製した天然型抗体酵素の中であるものは、非常に短いアミノ酸配列(5残基)で触媒三つ組み残基様構造を持つことが判った。そしてその抗体の酵素活性部位はその5残基と推定された。そこで、我々はこの短い配列を「触媒カセット」と呼び、その化学的および免疫学的機能を検索している。触媒三つ組み残基は上記のような短い配列のなかにどの程度序在するのかを調べた。その結果、我々が新しく見出したいくつかの天然型抗体酵素の遺伝子解析、および分子モデリングから興味ある事実が判明した。連続した3,5,8,9残基のような短い配列で触媒三つ組み残基様構造が構成されてていた。(勿論、いくつかはかなり長い配列で立体的に触媒三つ組み残基様構造をしている。)通常、酵素の活性サイト(Asp, His, Ser残基からなる)は、こうした短い配列で出来上がるのではなくて、長い配列の中に。たまたま上記三残基が立体的に近い距離に来たときに出来るものである。今回、上記のペプチド(直鎖状:5mer)を合成し、そのペプチダーゼ活性を基質としては人工基質のBoc-Glu-Lys-Lys-MCAを用いて調べたが、酵素活性は認められなかった。この原因としては、直鎖だときっちりした立体構想が取れないこと、また、活性を発揮するための電荷リレーがうまく行かないなどが考えられる。従って、今後はこの点を考慮に入れながらペプチドを設計する必要があろう。

“催化盒式”的概念是在研究抗体酶的催化三重残基（ASP，他的Ser）的过程中。在我们创建的天然抗体酶中，发现它具有非常短的氨基酸序列（5个残基）和催化三胞胎样结构。然后，抗体的活性位点估计为五个残基。因此，我们将此简短序列称为“催化盒”，并寻找其化学和免疫学功能。我们研究了如上所述的短序列中催化三重残基在短序列中的主要含义。结果揭示了我们一些新发现的天然抗体酶的遗传分析和分子建模的有趣事实。 3,5,8,9连续残基的短序列由催化三胞胎样结构组成。（当然，有些具有相当长的序列，在空间催化三胞胎状的结构中。）通常，酶的活性位点（由ASP，HIS，Ser残基组成）不会以这些短序列而最终以这些短序列而结束。这是当以上三个残基在空间上近距离距离时发生的情况。在本文中，合成了上述肽（线性链：5Mer），并使用人工底物BOC-GLU-LYS-LYS-MCA作为底物检查其肽酶活性，但未观察到酶活性。这可能是由于无法实现线性时实现坚实的三维概念而引起的，并且发挥其活性的电荷继电器无法正常工作。因此，将来有必要考虑到这一点。