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植物遺伝子の新しい温度依存的発現制御機構

植物基因的新温度依赖性表达控制机制

基本信息

批准号：
13017215
负责人：
射場厚
金额：
$ 1.73万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13017215/
关键词：
イネ RFLP RNAポリメラーゼ葉緑体

项目摘要

(1)イネ核由来プラスチドRNA polymerase遺伝子の解析イネから、複数のプラスチド局在ファージ型RNA polymerase(NEP)遺伝子Osrpo Tpのクローンを単離し、それらの塩基配列を調べたところ、ORFの5'側に、367bpの欠失があるクローンが一定の割合で存在することを見出した。イネゲノムチーム(RGP)の完全長cDNAクローンと比較したところ、RGP由来のcDNAクローンの配列も同様の欠失を含んでいた。この欠失はフレームシフトを引き起こすため、活性のあるNEPは合成されないと考えられる。また、プラスチド局在型NEPに対する特異的ペプチド抗体を用いて、タンパク質レベルでのNEPの発現パターンを調べたところ、野生株においてはrpoBなど、NEPによって転写される遺伝子の転写パターンと一致していた。しかし、virescent変異株においては、葉の発生ステージ後期でrpoBのmRNA蓄積量が上昇するが、NEPタンパク量は逆に減少していた。このようなNEPの発現パターンはOsrpoTp mRNAの蓄積パターンと一致することから、NEPの翻訳後の活性化にvirescent遺伝子が関与することが示唆された。(2)イネvirescent遺伝子のクローニング(1)V_1遺伝子:遺伝子座近傍のAFLPをスクリーニングし、約1cMの距離にあるCAPSマーカーを見つけ、そこを基点に染色体歩行を進めている。(2)V_2遺伝子:V_2が座乗するBACクローンを同定し、V2の座乗領域を物理距離28kbpの範囲に絞り込んだ。アノテーションとcDNA検索の結果から、この領域上に2つの候補遺伝子を見いだし、その1つにアミノ酸置換を引き起こす点変異があることがわかった。(3)V_3遺伝子:第6染色体長腕側の約5.0cMの位置に存在する約40kbpの領域に絞り込んだ。アノテーションの結果から、この領域上に9個の候補遺伝子を見いだした。

(1) Origin of イネラスチドRNA polymerase 缝子のanalytic イネから, plural のプラスチドbureau in ファージ type RNA polymerase (NEP) 伝子 Osrpo Tpのクローンを単里し、それらの塩塩组组を动べたところ、ORFの5' sideに, 367bpの无码があるクローンがdeterminationのcut合でexistingすることを见出した. Complete length cDNA comparison of イネゲノムチーム(RGP)ろ, RGP originated from the cDNA sequence of the same sequence.このowed loss はフレームシフトをinduced きこすため, active のあるNEP は synthesized されないと卡えられる.また, プラスチド local type NEP に対する specific ペプチド antibody を use いて, タンパク性レベルでのNEPの発成パターンべたところ, wild strain においてはrpoBなど, NEP によって転WRITE される伝子の転WRITE パターンと unanimous していた.しかし、virescent変different strainsにおいては、叶の発生ステージ后でrp The amount of oB mRNA accumulation has increased, and the amount of NEP mRNA has reversed and decreased.このようなNEPの発成パターンはOsrpoTp The accumulation of mRNA is consistent, and the activation of NEP after translation is virescent. (2)イネvirescent弝子のクローニング(1)V_1弝子：弝子蝝子蝌のAFLPをスクリーニングし, about 1cM distance にあるCAPS マーカーを见つけ, そこをbase point にchromosome walk を advance めている. (2) V_2 弝子: V_2がseatrideするBACクローンを同定し, V2のseatride domainをphysical distance 28kbpのfan囲に炊込んだ.アノテーションとcDNA検取のRESULTSから、この区上に2つの candidate addendum 伝子を见いだし、その1つにアミノAcid replacement を lead ききこす点変ISO があることがわかった. (3) V_3 legacy: It exists in a position of approximately 5.0cM on the long wrist side of chromosome 6 and is located in a region of approximately 40kbp. The results of the アノテーションのから、この区上に9 candidate addendums 伝子を见いだした.