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SAGE法による食道癌・胃癌特異的遺伝子の探索とその意義に関する臨床疫学的研究

利用SAGE方法寻找食管癌和胃癌特异基因及其意义的临床流行病学研究

基本信息

批准号：
16024213
负责人：
安井弥
金额：
$ 4.54万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16024213/
关键词：
胃癌 SAGE法 MIA GW112 カアスタムアレイ臨床疫学 CLDN18

项目摘要

SAGE法により、世界最大のSAGEライブラリーを完成し(GEO accession no. GSE545)、胃癌の発生・進展に関与する多くの遺伝子を同定してきた。胃癌SAGEライブラリーとデータベース中の主要な12種類の正常臓器のライブラリーとの比較から、癌特異的発現遺伝子候補をリストアップし、定量的RT-PCR法による実際の胃癌と正常臓器における発現解析により、少なくとも8遺伝子が特異的に発現することを見い出した。この中にはMIA(melanoma inhibitory activity)とGW112という既知の遺伝子が含まれていた。胃癌についての定量的RT-PCR法では、進行癌症例で有意に発現レベルが高く、MIA陽性例は陰性例に比較して有意に予後不良であった。ELISAにて測定した血中MIA値は、高度進行胃癌症例で高値であった。GW112は、胃癌の58%(29/50)において過剰発現(T/N>2)しており、悪性度と相関していた。SAGEで抽出した164の特異的遺伝子に既知の遺伝子を加えたオリゴDNAカスタムアレイを用いて、20例の胃がん組織について遺伝子発現を解析し、T grade、N grade、Histologyなどを判別する有意な遺伝子群を抽出した。また、SAGEライブラリーの比較から胃癌において発現が抑制されている遺伝子としてCLDN18を同定した。RT-PCR法によって胃癌では65%にCLDN18の発現低下が認められた。さらに、5'UTRにG/AのSNPの存在が見い出され、胃癌症例対照研究から、A/G及びG/G genotypeが胃がんの発生リスクに関連する可能性が示唆された。

SAGE method, the world's largest "SAGE", "complete" (GEO accession no. GSE545), the progression of gastric cancer and the progression of gastric cancer are the same as those of gastric cancer. In the study of gastric cancer SAGE, there is no significant difference between the two groups in the detection of gastric cancer. In this study, 12 of the major types of normal gastric cancer, the detection of cancer-specific phenotypes, the detection of cancer-specific phenotypes, the quantitative RT-PCR assay, the detection of gastric cancer, the detection of There is a MIA (melanoma inhibitory activity) GW112 child that is known to contain a few words in the box. The RT-PCR method for quantitative analysis of gastric cancer, the high incidence of cancer in patients with cancer, and the incidence of MIA in patients with sex were higher than those in patients who were not good at later. ELISA was used to determine the level of MIA in blood and highly advanced gastric cancer. 58% of patients with GW112 and 58% of patients with gastric cancer (29ap50) were diagnosed with severe hepatitis, and their sexual properties were similar. The results of SAGE analysis, T grade, N grade and Histology analysis showed that the samples of 20 patients with gastric cancer were detected by RT-PCR, T-PCR, N-PCR and Histology-PCR. The results showed that the inhibition rate of gastric cancer was higher than that of SAGE, and that of gastric cancer was similar to that of gastric cancer. RT-PCR method was used to detect gastric cancer. 65% of CLDN18 showed a low level of gastric cancer. The presence of gastric cancer, 5 'UTRG genotype A