ヒトDNA組換え装置サブユニットの高次構造と機能に関する研究
ヒトDNA組換え装置サブユニットの高次構造と機能に関する研究
批准号:
15770076
负责人:
胡桃坂 仁志
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
中文摘要
ゲノムDNAは細胞内において常に損傷を受けている。中でも二重鎖切断損傷は、染色体異常の直接的な原因となる。二重鎖切断は、相同組換えを経由したDNA修復経路によって速やかに修復されるが、そのメカニズムについては生化学的にも構造生物学的にも解析が進んでおらず、その分子機構の理解は不十分である。相同組換え反応の要の反応は相同的対合反応である。相同的対合反応の分子機構を明らかにするために、減数分裂期での相同対合反応の中心酵素であるヒトDmc1の立体構造解析をX線結晶回折法によって行い、Dmc1が8量体のリング構造を基本とする16量体のダブルリング構造を形成することを明らかにした。そして立体構造に立脚した変異体解析によって、Dmc1の16量体ダブルリングにおけるDNA結合部位を同定した。Dmc1ダブルリングの中央の穴は約30オングストロームの直径をもち、その中央の穴に糸を通すように二重鎖DNAを結合することが分かった。単鎖DNAは、ダブルリング構造の側面に存在する単鎖DNA専用の溝に結合することを変異体解析によって明らかにした。また、出芽酵母の遺伝学的解析より、Dmc1と機能的な相互作用が示唆されているTBPIP/Hop2に着目し、リコンビナントタンパク質として大量に精製する系を確立した。そして精製されたTBPIP/Hop2が、Dmc1によって触媒される相同的対合反応を著しく活性化することを見いだした。TBPIP/Hop2のドメイン解析を、欠失変異体作製法によって行った結果、TBPIP/Hop2はN末端領域にてDNAに結合するが、C末端領域はDmc1依存的な相同的対合反応の活性化に重要であることを明らかにした。
英文摘要
ゲノムDNAは細胞内において常に損傷を受けている。中でも二重鎖切断損傷は、染色体異常の直接的な原因となる。二重鎖切断は、相同組換えを経由したDNA修復経路によって速やかに修復されるが、そのメカニズムについては生化学的にも構造生物学的にも解析が進んでおらず、その分子機構の理解は不十分である。相同組換え反応の要の反応は相同的対合反応である。相同的対合反応の分子機構を明らかにするために、減数分裂期での相同対合反応の中心酵素であるヒトDmc1の立体構造解析をX線結晶回折法によって行い、Dmc1が8量体のリング構造を基本とする16量体のダブルリング構造を形成することを明らかにした。そして立体構造に立脚した変異体解析によって、Dmc1の16量体ダブルリングにおけるDNA結合部位を同定した。Dmc1ダブルリングの中央の穴は約30オングストロームの直径をもち、その中央の穴に糸を通すように二重鎖DNAを結合することが分かった。単鎖DNAは、ダブルリング構造の側面に存在する単鎖DNA専用の溝に結合することを変異体解析によって明らかにした。また、出芽酵母の遺伝学的解析より、Dmc1と機能的な相互作用が示唆されているTBPIP/Hop2に着目し、リコンビナントタンパク質として大量に精製する系を確立した。そして精製されたTBPIP/Hop2が、Dmc1によって触媒される相同的対合反応を著しく活性化することを見いだした。TBPIP/Hop2のドメイン解析を、欠失変異体作製法によって行った結果、TBPIP/Hop2はN末端領域にてDNAに結合するが、C末端領域はDmc1依存的な相同的対合反応の活性化に重要であることを明らかにした。
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DOI:
10.1074/jbc.m402481200
发表时间:
2004-08-20
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Enomoto, R, Kinebuchi, T, Yokoyama, S]
通讯作者:
Yokoyama, S
DOI:
10.1016/j.ymeth.2003.10.024
发表时间:
2004-05-01
期刊:
METHODS
影响因子:
4.8
作者:
[Tanaka, Y, Tawaramoto-Sasanuma, M, Yokoyama, S]
通讯作者:
Yokoyama, S
Location of tyrosine 315, a target for phosphorylation by cAbl tyrosine kinase, at the edge of the subunit-subunit interface
酪氨酸 315 的位置,cAbl 酪氨酸激酶磷酸化的靶标,位于亚基-亚基界面的边缘
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Journal of Molecular Biology 339
影响因子:
--
作者:
[Conilleau, S. et al.]
通讯作者:
S. et al.
DOI:
10.1016/s1097-2765(04)00218-7
发表时间:
2004-05-07
期刊:
MOLECULAR CELL
影响因子:
16
作者:
[Kinebuchi, T, Kagawa, W, Yokoyama, S]
通讯作者:
Yokoyama, S
Kurumizaka, H., et al.: "Region and amino acid residues required for Rad51C binding in the human Xrcc3 protein"Nucleic Acids Research. 31. 4041-4050 (2003)
Kurumizaka, H. 等人:“人类 Xrcc3 蛋白中 Rad51C 结合所需的区域和氨基酸残基”核酸研究。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 7 条
Structural studies for understanding the mechanism of DNA repair in chromatin
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批准号:23H05475
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$129.13万
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财政年份:2023
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
リーシュマニア寄生虫のヌクレオソーム構造解析
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批准号:15F15729
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
二重鎖切断修復に働く新規発がん防御因子の探索とその機能・構造解析
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批准号:20012049
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.46万
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财政年份:2008
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
染色体ダイナミクスの生化学・構造生物学的解析
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批准号:19038022
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.7万
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财政年份:2007
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
発がん防御に重要な新規二重鎖切断修復タンパク質の探索とその機能・構造解析
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批准号:18012046
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$6.27万
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财政年份:2006
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
発がんの原因となる二重鎖切断を正確に修復する相同組換え装置の機能・構造解析
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批准号:17013080
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2005
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
染色体ダイナミクスに関わるタンパク質の構造・機能解析
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批准号:17050021
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.78万
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财政年份:2005
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
単鎖DNA結合タンパク質の新規立体構造モチーフ解析とデータベースからの検索
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批准号:16013246
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2004
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
DNA組換え修復タンパク質群による発がん防御の分子機構
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批准号:16021251
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2004
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
DNA組換え修複による発がん防御の分子メカニズム
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批准号:15023263
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.69万
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财政年份:2003
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
特殊なDNA構造に結合する新規タンパク質の同定とその立体構造予測に関する研究
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批准号:15013261
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.01万
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财政年份:2003
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
ヒトDNA組換え修復装置による発がん防御の分子機構の解析
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批准号:14026060
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2002
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
がん化防御に重要なDNA組換え修復装置の構造および機能解析
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批准号:13214115
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.62万
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财政年份:2001
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
ヒトにおける相同DNA組換えの分子機構に関する研究
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批准号:12780523
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
染色体の安定維持に重要なヒトRad51ファミリータンパク質の構造、機能解析
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批准号:12213146
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2000
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
クロマチンDNAにおける相同的組換え機構に関する研究
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批准号:10780433
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位: