ヒトDNA組換え修復装置による発がん防御の分子機構の解析
ヒトDNA組換え修復装置による発がん防御の分子機構の解析
批准号:
14026060
负责人:
胡桃坂 仁志
金额:
$2.5万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 --
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染色体DNAが放射線や抗がん剤などによって受ける二重鎖DNA切断は、相同組換えを経由して速やかに修復される。この相同組換え機構の欠損が癌化の直接の原因となることが、近年報告されている。相同組換えの過程で、二重鎖切断を受けたDNA部位は、無傷の染色体DNAの中から相同な配列を探し出して対合する。この過程を相同的対合反応という。これまでに我々は、真核生物においてバクテリアRecAのホモログであるRad51とDmc1に加えて、ヒトRad52が、Rad51非存在下で相同的対合反応を触媒することを見出した。今回、Rad52の相同的対合反応触媒ドメインの高次構造を、X線結晶構造解析により決定した。その結果、ヒトRad52の相同的対合ドメインであるRad52_<1-212>は、11分子集まって安定なリング構造を形成することが分かった。次に、Rad52_<1-212>の表面電荷よりDNA結合領域を予想した。そしてその領域に存在するLys、Arg、およびTyr残基をそれぞれアラニンに置換した変異体を作成し、これらのDNA結合活性を調べた。そして、単鎖および二重鎖DNA結合にそれぞれ重要な残基が、予想されたDNA結合領域に局在することが明らかになった。さらに興味深いことに、分析超遠心法によって、全長のRad52は、Rad52_<1-212>とは異なり7量体のリング構造を形成することが明らかになった。この7量体リングは、Rad52_<1-212>の11量体リングと電子顕微鏡下では区別できないほど似ていた。そこで、Rad52_<1-212>の立体構造を用いて7量体リング構造のモデルを構築したところ、Rad52のC末端領域がモノマー間の領域の形成に関与することが予想された。これらの結果から、Rad52_<1-212>の11量体リング構造は、Rad52よりむしろRad52のN末端側と高い相同性を示す酵母のRad59や、N末端領域の約200アミノ酸からなるヒトRad52のsplicing variantの立体構造を反映していると結論された。そして、Rad52のホモログの間で、7量体と11量体の2種類のリング構造が存在することが明らかになった。
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Kurumizaka, H., Ikawa, S., Nakada, M., Enomoto, R., Kagawa, W., Kinebuchi, T., Yamazoe, M., Yokoyama, S., Shibata, T.: "Homologous-pairing, and ring-and filament-structure formation activities of the human Xrcc2-Rad51D complex"Journal of Biological Chemis
Kurumizaka, H.、Ikawa, S.、Nakada, M.、Enomoto, R.、Kakawa, W.、Kinebuchi, T.、Yamazoe, M.、Yokoyama, S.、Shibata, T.:“同源配对,
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Kagawa, W., Kurumizaka, H., Ishitani, R., Fukai, S., Nureki, O., Shibata, T., Yokoyama, S.: "Crystal structure of the homologous-pairing domain from the human Rad52 recombinase in the undecameric form"Molecular Cell. 10. 359-371 (2002)
Kakawa, W.、Kurumizaka, H.、Ishitani, R.、Fukai, S.、Nureki, O.、Shibata, T.、Yokoyama, S.:“来自人类 Rad52 重组酶的同源配对结构域的晶体结构
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Yokoyama, H., Kurumizaka, H., Ikawa, S., Yokoyama, S., Shibata, T.: "Holliday junction binding activity of the human Rad51 B protein"Journal of Biological Chemistry. (in press). (2003)
Yokoyama, H.、Kurumizaka, H.、Ikawa, S.、Yokoyama, S.、Shibata, T.:“人 Rad51 B 蛋白的霍利迪连接体结合活性”生物化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Tanaka, K., Kagawa, Kinebuchi, T., Kurumizaka, H., Miyagawa, K.: "Human Rad54B is a double-stranded DNA-dependent ATPase and has biochemical properties different from its structural homolog in yeast, Tid1/Rdh54"Nucleic Acids Research. 30. 1346-1353 (2002)
Tanaka, K.、Kakawa、Kinebuchi, T.、Kurumizaka, H.、Miyakawa, K.:“Human Rad54B 是一种双链 DNA 依赖性 ATP 酶,其生化特性不同于酵母中的结构同源物 Tid1/Rdh54”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Structural studies for understanding the mechanism of DNA repair in chromatin
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批准号:23H05475
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$129.13万
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财政年份:2023
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
リーシュマニア寄生虫のヌクレオソーム構造解析
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批准号:15F15729
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
二重鎖切断修復に働く新規発がん防御因子の探索とその機能・構造解析
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批准号:20012049
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.46万
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财政年份:2008
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
染色体ダイナミクスの生化学・構造生物学的解析
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批准号:19038022
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.7万
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财政年份:2007
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
発がん防御に重要な新規二重鎖切断修復タンパク質の探索とその機能・構造解析
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批准号:18012046
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$6.27万
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财政年份:2006
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
発がんの原因となる二重鎖切断を正確に修復する相同組換え装置の機能・構造解析
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批准号:17013080
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2005
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
染色体ダイナミクスに関わるタンパク質の構造・機能解析
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批准号:17050021
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.78万
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财政年份:2005
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
単鎖DNA結合タンパク質の新規立体構造モチーフ解析とデータベースからの検索
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批准号:16013246
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2004
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
DNA組換え修復タンパク質群による発がん防御の分子機構
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批准号:16021251
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2004
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
DNA組換え修複による発がん防御の分子メカニズム
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批准号:15023263
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.69万
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财政年份:2003
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
特殊なDNA構造に結合する新規タンパク質の同定とその立体構造予測に関する研究
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批准号:15013261
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.01万
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财政年份:2003
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
ヒトDNA組換え装置サブユニットの高次構造と機能に関する研究
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批准号:15770076
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2003
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
がん化防御に重要なDNA組換え修復装置の構造および機能解析
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批准号:13214115
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.62万
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财政年份:2001
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
ヒトにおける相同DNA組換えの分子機構に関する研究
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批准号:12780523
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2000
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
染色体の安定維持に重要なヒトRad51ファミリータンパク質の構造、機能解析
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批准号:12213146
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2000
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
クロマチンDNAにおける相同的組換え機構に関する研究
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批准号:10780433
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:胡桃坂 仁志
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依托单位:
海外基金