人工亜鉛フィンガーペプチドの創製、DNA認識および遺伝子制御

人工锌指肽的创建、DNA 识别和基因调控

• 批准号: 04F04435
• 负责人: 杉浦 幸雄
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: Doshisha Women's College of Liberal Arts (2005-2006)Kyoto University (2004)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-04F04435/
• 关键词: 亜鉛フィンガー; ペプチドデザイン; 分子設計; DNA認識; 遺伝子制御; 認識モチーフ; 人工ペプチド; ヘリックス構造; モチーフ

本研究においては、生物に普遍的に存在している亜鉛フィンガータンパク質の亜鉛元素の選択則や亜鉛フィンガーモチーフ構造と機能の相関性などを明らかにすることを目指した。本年度は亜鉛フィンガーモチーフ内部の疎水性コアの構造的・機能的役割について追究するため、野生型および種々の変異型GAGAファクターペプチドを設計・合成し、ヘリックス構造形成やDNA結合能に対する疎水性アミノ酸、特にフェニルアラニンの影響を調べた。その結果、GAGAペプチドにおけるアラニンやイソロイシンをフェニルアラニンに置換した変異体は、電子スペクトルおよびCDスペクトルから亜鉛配位や亜鉛フィンガーモチーフ構造形成に関しては、天然の野生型GAGAファクターのそれらと極めて類似した性質を示した。しかしながら、DNA結合性に関しては野生型ペプチドとは全く異なり、変異型ペプチドでは標的DNA配列には結合しなかった。この結果はカロリーメーター測定とも一致していた。簡単なエネルギー計算結果から、GAGAファクターのアラニンやイソロイシンのフェニルアラニンによる置換は、主に立体障害によってGAGAペプチドの亜鉛フィンガーモチーフの疎水環境を壊すことが示唆された。他方、Sp1やZif268などの多くの亜鉛フィンガーモチーフの疎水環境の形成には必須であることがエネルギー計算から支持された。本結果はGAGAファクターの亜鉛フィンガータンパク質における特異な位置付けを強く示している。さらに、GAGAファクターとTramtrackタンパク質との人工キメラ亜鉛フィンガータンパク質のDNA結合実験からは、リンカー配列の重要性が明らかにされるなど、幾つかの価値ある知見が本研究から得られた。

This study indicates that there is a wide range of biological elements in the world, such as lead, lead. This year, we will investigate the structural and functional characteristics of the water-soluble species in the wild type and wild type of GAGA. We will design, synthesize and adjust the structural characteristics of the water-soluble species in the wild type and wild type. As a result, GAGA has similar properties to those of natural wild-type GAGA, which are related to the formation of lead coordination structures. DNA binding is related to wild-type DNA binding and heterotypic DNA binding. The result is that the number of people who have died in the war is higher than the number of people who have died. The calculation results show that the GAGA has a good relationship with the water environment. The GAGA has a good relationship with the water environment. Other aspects, Sp1 and Zif268, are necessary for the formation of water environment. The results of this study demonstrate that GAGA has a unique position in the study. In addition, the importance of GAGA's Tramtrack alignment in DNA binding is clearly demonstrated.

项目成果

Biomolecular mirror-image recognition

生物分子镜像识别

• 发表时间: 2006
• 期刊: Chirality 18・4
• 作者: Qiu Y;Wang X. et al.;M.Dhanasekaran;S.Negi
• 通讯作者: S.Negi