Dynamics of intrinsically disordered proteins and their functional roles

本质无序蛋白质的动力学及其功能作用

基本信息

  • 批准号:
    20227009
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 79.87万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
  • 财政年份:
    2008
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2008 至 2012
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Here, we have examined dynamical structures of intrinsically disordered proteins including heterochromatin-related proteins, Chp1 and Swi6 in addition to histone multimers by NMR and MS. The chromodomain (CD) of a heterochromatin-related protein, Chp1, possesses novel RNA-binding activity as well as histone H3K9me3-binding activity. NMR revealed that the presence of a small helix in the N-terminal outside region of Chp1 CD bound to histone H3K9me3. Addition of cenRNA led to chemical shift changes of amide protons for residues within this helix and a C-terminal helix in Chp1 CD. In addition we revealed the solution structure of H2A/H2B and its complex with the C-terminal disordered acidic domain of histone chaperone Nap1.
在这里,我们已经研究了动力学结构的内在无序的蛋白质,包括异染色质相关的蛋白质,Chp 1和Swi 6除了组蛋白多聚体通过NMR和MS。的chromodomain(CD)的异染色质相关的蛋白质,Chp 1,具有新的RNA结合活性,以及组蛋白H3 K9 me 3结合活性。NMR显示Chp 1 CD的N-末端外侧区域存在一个小螺旋,与组蛋白H3 K9 me 3结合。cenRNA的添加导致Chp 1 CD中该螺旋和C-末端螺旋内残基的酰胺质子的化学位移变化。此外,我们还揭示了H2 A/H2 B的溶液结构及其与组蛋白伴侣Nap 1的C-末端无序酸性结构域的复合物。

项目成果

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专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
試料分析講座タンパク質分析、日本分析化学会編5.3タンパク質複合体のネイティブ質量分析
样品分析课程《蛋白质分析》,日本分析化学会编 5.3 蛋白质复合物的天然质谱分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Naohiro Kodama;Yuuka Hirao;Nonyuki Iwasaki;Yoshiyuki Itoh;Yoshifumi Nishimwa;Satoko Akastu;明石知子;明石知子;明石知子;明石知子
  • 通讯作者:
    明石知子
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Watanabe M;Heddle JG;Kikuchi K;Unzai S;Akashi S;Park SY;Tame JR.
  • 通讯作者:
    Tame JR.
Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esa1 presumed chromodomain.
  • DOI:
    10.1016/j.jmb.2008.03.021
  • 发表时间:
    2008-05
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    H. Shimojo;N. Sano;Yoshihito Moriwaki;M. Okuda;M. Horikoshi;Y. Nishimura
  • 通讯作者:
    H. Shimojo;N. Sano;Yoshihito Moriwaki;M. Okuda;M. Horikoshi;Y. Nishimura
クロマチン上での基本転写因子、転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学
染色质上基本转录因子、转录调节因子和组蛋白修饰剂的结构生物学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西村善文;西村 善文・長土居 有隆・奥田 昌彦;西村善文・長土居有隆・奥田昌彦;西村 善文;西村善文;永倉 慎二郎・山本 誠二・大熊 芳明・西村 善文・明石 知子;明石 知子・西村 善文;西村 善文
  • 通讯作者:
    西村 善文
Side-chain conformational changes of transcription factor PhoB upon DNA binding: a population-shift mechanism.
  • DOI:
    10.1021/ja103218x
  • 发表时间:
    2010-08
  • 期刊:
  • 影响因子:
    15
  • 作者:
    T. Yamane;Hideyasu Okamura;Y. Nishimura;A. Kidera;M. Ikeguchi
  • 通讯作者:
    T. Yamane;Hideyasu Okamura;Y. Nishimura;A. Kidera;M. Ikeguchi
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  • 通讯作者:
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  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 79.87万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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  • 财政年份:
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  • 资助金额:
    $ 79.87万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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