Dynamics of intrinsically disordered proteins and their functional roles
Dynamics of intrinsically disordered proteins and their functional roles
批准号:
20227009
负责人:
NISHIMURA Yoshifumi
金额:
$79.87万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2012
中文摘要
在这里,我们用核磁共振和质谱仪研究了异染色质相关蛋白Chp1和Swi6以及组蛋白多聚体的动态结构。异染色质相关蛋白Chp1的色域(CD)具有新的RNA结合活性和组蛋白H3K9me3结合活性。核磁共振显示Chp1CD与组蛋白H3K9me3结合的N端外区存在一个小螺旋。CenRNA的加入导致了Chp1CD中该螺旋和C末端螺旋中残基的酰胺质子的化学位移变化。此外,我们还揭示了H_2A/H_2B及其与组蛋白伴侣蛋白NAP1的C端无序酸性结构域的络合物的溶液结构。
英文摘要
Here, we have examined dynamical structures of intrinsically disordered proteins including heterochromatin-related proteins, Chp1 and Swi6 in addition to histone multimers by NMR and MS. The chromodomain (CD) of a heterochromatin-related protein, Chp1, possesses novel RNA-binding activity as well as histone H3K9me3-binding activity. NMR revealed that the presence of a small helix in the N-terminal outside region of Chp1 CD bound to histone H3K9me3. Addition of cenRNA led to chemical shift changes of amide protons for residues within this helix and a C-terminal helix in Chp1 CD. In addition we revealed the solution structure of H2A/H2B and its complex with the C-terminal disordered acidic domain of histone chaperone Nap1.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
試料分析講座タンパク質分析、日本分析化学会編5.3タンパク質複合体のネイティブ質量分析
样品分析课程《蛋白质分析》,日本分析化学会编 5.3 蛋白质复合物的天然质谱分析
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Naohiro Kodama, Yuuka Hirao, Nonyuki Iwasaki, Yoshiyuki Itoh, Yoshifumi Nishimwa, Satoko Akastu, 明石知子, 明石知子, 明石知子, 明石知子]
通讯作者:
明石知子
The nature of the TRAP-Anti-TRAP complex.
TRAP-Anti-TRAP 复合物的性质。
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Proc Natl Acad Sci U S A. 106(7)
影响因子:
--
作者:
[Watanabe M, Heddle JG, Kikuchi K, Unzai S, Akashi S, Park SY, Tame JR.]
通讯作者:
Tame JR.
クロマチン上での基本転写因子、転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学
染色质上基本转录因子、转录调节因子和组蛋白修饰剂的结构生物学
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[西村善文, 西村 善文・長土居 有隆・奥田 昌彦, 西村善文・長土居有隆・奥田昌彦, 西村 善文, 西村善文, 永倉 慎二郎・山本 誠二・大熊 芳明・西村 善文・明石 知子, 明石 知子・西村 善文, 西村 善文]
通讯作者:
西村 善文
Impact of Protein Oxidation on their Ion Mobility for Protein Footprinting Applications
蛋白质氧化对其离子淌度在蛋白质足迹应用中的影响
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Simin Maleknia, Satoko Akashi, Kevin Downard]
通讯作者:
Kevin Downard
The structure of the N-terminal regulatory domain of a plant NADPH oxidase and its functional implications
植物NADPH氧化酶N端调控域的结构及其功能意义
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
J Biol Chem
影响因子:
4.8
作者:
[Oda T, Hashimoto H, Kuwabara N, Akashi S, Hayashi K, Kojima C, Wong HL, Kawasaki T, Shimamoto K, Sato M, Shimizu T]
通讯作者:
Shimizu T
共 108 条
Developmental and clinical characteristics of collage techniques
-
批准号:20530652
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
-
资助金额:$2.91万
-
财政年份:2008
-
负责人:NISHIMURA Yoshifumi
-
依托单位:
Basic research on double-stranded DNA-binding proteins
-
批准号:17370058
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
-
资助金额:$8.99万
-
财政年份:2005
-
负责人:NISHIMURA Yoshifumi
-
依托单位:
Structural analyses of transcriptional regulation in stress response
-
批准号:13480222
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
-
资助金额:$7.17万
-
财政年份:2001
-
负责人:NISHIMURA Yoshifumi
-
依托单位:
Drug design for transcription factors
-
批准号:11358012
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
-
资助金额:$21.44万
-
财政年份:1999
-
负责人:NISHIMURA Yoshifumi
-
依托单位:
Analyses of Signal Transduction Mechanisms based on Protein Structures
-
批准号:06276103
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$288.58万
-
财政年份:1994
-
负责人:NISHIMURA Yoshifumi
-
依托单位:
Roles of Protein Structures on the DNA Recognition
-
批准号:06276104
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$72.7万
-
财政年份:1994
-
负责人:NISHIMURA Yoshifumi
-
依托单位:
海外基金