Dynamics of intrinsically disordered proteins and their functional roles
Dynamics of intrinsically disordered proteins and their functional roles
批准号:
20227009
负责人:
NISHIMURA Yoshifumi
金额:
$79.87万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2012
中文摘要
在这里,我们已经研究了动力学结构的内在无序的蛋白质,包括异染色质相关的蛋白质,Chp 1和Swi 6除了组蛋白多聚体通过NMR和MS。的chromodomain(CD)的异染色质相关的蛋白质,Chp 1,具有新的RNA结合活性,以及组蛋白H3 K9 me 3结合活性。NMR显示Chp 1 CD的N-末端外侧区域存在一个小螺旋,与组蛋白H3 K9 me 3结合。cenRNA的添加导致Chp 1 CD中该螺旋和C-末端螺旋内残基的酰胺质子的化学位移变化。此外,我们还揭示了H2 A/H2 B的溶液结构及其与组蛋白伴侣Nap 1的C-末端无序酸性结构域的复合物。
英文摘要
Here, we have examined dynamical structures of intrinsically disordered proteins including heterochromatin-related proteins, Chp1 and Swi6 in addition to histone multimers by NMR and MS. The chromodomain (CD) of a heterochromatin-related protein, Chp1, possesses novel RNA-binding activity as well as histone H3K9me3-binding activity. NMR revealed that the presence of a small helix in the N-terminal outside region of Chp1 CD bound to histone H3K9me3. Addition of cenRNA led to chemical shift changes of amide protons for residues within this helix and a C-terminal helix in Chp1 CD. In addition we revealed the solution structure of H2A/H2B and its complex with the C-terminal disordered acidic domain of histone chaperone Nap1.
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DOI:
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发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
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作者:
[Naohiro Kodama, Yuuka Hirao, Nonyuki Iwasaki, Yoshiyuki Itoh, Yoshifumi Nishimwa, Satoko Akastu, 明石知子, 明石知子, 明石知子, 明石知子]
通讯作者:
明石知子
The nature of the TRAP-Anti-TRAP complex.
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DOI:
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发表时间:
2009
期刊:
Proc Natl Acad Sci U S A. 106(7)
影响因子:
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作者:
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通讯作者:
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クロマチン上での基本転写因子、転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学
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2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
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通讯作者:
西村 善文
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DOI:
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发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
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作者:
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通讯作者:
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植物NADPH氧化酶N端调控域的结构及其功能意义
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发表时间:
2010
期刊:
J Biol Chem
影响因子:
4.8
作者:
[Oda T, Hashimoto H, Kuwabara N, Akashi S, Hayashi K, Kojima C, Wong HL, Kawasaki T, Shimamoto K, Sato M, Shimizu T]
通讯作者:
Shimizu T
共 108 条
Developmental and clinical characteristics of collage techniques
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批准号:20530652
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2008
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负责人:NISHIMURA Yoshifumi
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依托单位:
Basic research on double-stranded DNA-binding proteins
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批准号:17370058
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$8.99万
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财政年份:2005
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负责人:NISHIMURA Yoshifumi
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依托单位:
Structural analyses of transcriptional regulation in stress response
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批准号:13480222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.17万
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财政年份:2001
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负责人:NISHIMURA Yoshifumi
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依托单位:
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批准号:11358012
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$21.44万
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财政年份:1999
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负责人:NISHIMURA Yoshifumi
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负责人:NISHIMURA Yoshifumi
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财政年份:1994
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负责人:NISHIMURA Yoshifumi
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依托单位:
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