Prediction of Response to Preoperative Chemoradiotherapy in Rectal Cancer By Gene expression Analysis

通过基因表达分析预测直肠癌术前放化疗的反应

基本信息

  • 批准号:
    21390383
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 10.4万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2009
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2009 至 2011
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Based on the gene expression of rectal cancer, we aimed to build a predictive model for response to chemoradiotherapy. Using 46 samples as a training set, we examined gene expression by microarray and RT-PCR. We finally selected 4 genes that were used for predictive model. The accuracy rate of prediction was 89.1% among a training set. In an independent test set of 16 samples, we validated the accuracy of a predictive model and the accuracy rate of the predictive model was 81.3%.
基于直肠癌的基因表达,我们的目的是建立一个预测模型的化疗和放疗的反应。使用46个样本作为训练集,我们通过微阵列和RT-PCR检测基因表达。我们最终选择了4个基因用于预测模型。训练集的预测准确率为89.1%。在16个样本的独立测试集中,我们验证了预测模型的准确性,预测模型的准确率为81.3%。

项目成果

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Predicting Ulcerative Colitis-Associated Colorectal Cancer Using Reverse-Transcription Polymerase Chain Reaction Analysis
  • DOI:
    10.1016/j.clcc.2011.03.011
  • 发表时间:
    2011-06-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Watanabe, Toshiaki;Kobunai, Takashi;Nagawa, Hirokazu
  • 通讯作者:
    Nagawa, Hirokazu
Chromosome 18q deletion as a novel molecular predictor for colorectal cancer with simultaneous hepatic metastasis
染色体 18q 缺失作为结直肠癌并发肝转移的新型分子预测因子
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tanaka T;Watanabe T;Kitayama J;Kazama Y;Tanaka J;Kanazawa T;Kazama S;Nagawa H.
  • 通讯作者:
    Nagawa H.
RUNX3 copy number predicts the development of UC-associated colorectal cancer.
  • DOI:
    10.3892/ijo_00000839
  • 发表时间:
    2010-11
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Toshiaki Watanabe;T. Kobunai;H. Ikeuchi;Yoko Yamamoto;K. Matsuda;S. Ishihara;K. Nozawa;H. Iinuma;T. Kanazawa;Toshiaki Tanaka;T. Yokoyama;T. Konishi;K. Eshima;Y. Ajioka;T. Hibi;Mamoru Watanabe;T. Muto;H. Nagawa
  • 通讯作者:
    Toshiaki Watanabe;T. Kobunai;H. Ikeuchi;Yoko Yamamoto;K. Matsuda;S. Ishihara;K. Nozawa;H. Iinuma;T. Kanazawa;Toshiaki Tanaka;T. Yokoyama;T. Konishi;K. Eshima;Y. Ajioka;T. Hibi;Mamoru Watanabe;T. Muto;H. Nagawa
Prognostic Value of Peritoneal Cytology and the Combination of Peritoneal Cytology and Peritoneal Dissemination in Colorectal Cancer
  • DOI:
    10.1007/dcr.0b013e3181b4c46e
  • 发表时间:
    2009-12-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Nishikawa, Takeshi;Watanabe, Toshiaki;Nagawa, Hirokazu
  • 通讯作者:
    Nagawa, Hirokazu
Differential gene expression signatures between colorectal cancers with and without KRAS mutations: Crosstalk between the KRAS pathway and other signaling pathways
有和没有 KRAS 突变的结直肠癌之间的差异基因表达特征:KRAS 通路与其他信号通路之间的串扰
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Watanabe T;Kobunai T;Yamamoto Y;Matsuda K;Ishihara S;Nozawa K;Iinuma H;Ikeuchi H;Eshima K
  • 通讯作者:
    Eshima K
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    2007
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    2007
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  • 批准号:
    06J03285
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 10.4万
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 10.4万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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  • 批准号:
    17780116
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 10.4万
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    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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    2005
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    $ 10.4万
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    2005
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    05F05636
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 10.4万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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知道了