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ポリA鎖長に概日リズムが見られるmRNAのゲノムワイド検索

ポリA鎖長に概日リズムが見られるmRNAのゲノムワイド検索
全基因组搜索具有多聚腺苷酸链长度昼夜节律的 mRNA
批准号：
22651072
负责人：
程 肇
金额：
$2.11万
依托单位：
Kanazawa University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22651072/
关键词：
概日リズム視交叉上核時計遺伝子Period1poly(A)翻訳制御

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项目成果

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生物には概日リズムとよばれる、約24時間周期の自律的な活動リズムが見られる。真核生物の概日リズム形成には、転写制御フィードバックループが一義的な機能を担うとされる。一方転写リズムがなくても、多数のタンパク質で発現概日リズムが見出され、タンパク質の時刻依存的濃度変化を構築する転写後制御機構(翻訳やタンパク質分解)も、概日振動ネットワークが機能するために重要であることが明らかとなった。本年度は我々が開発した新規ポリA鎖決定法の反応の最適化を図るとともに、ゲノムワイドに展開するための基盤整備、そしてmRNAポリA鎖長に概日リズムが見られる遺伝子をゲノムワイドに検索するパイロットプロジェクトを実施した。その結果、poly(A-T)鎖を効率的に捕捉増幅する酵素の選定と反応条件を決定し、新たに構築した遺伝子特異的プライマーのデザインツールを用いてヒト、マウス、ラットの全mRMAの3'末端に対するプライマーをデザインした。さらに、ポリA鎖長を測定するための自動電気泳動装置出力データをpoly(A)鎖長分布解析プログラムを開発した。そして、この方法の有効性を実際の実験で評価するために、これらの条件と方法を用いてラットの約500の遺伝子mRNAのポリA鎖長を測定した。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
The Uterus Sustains Stable Biological Clock during Pregnancy
DOI： 10.1620/tjem.221.287
发表时间： 2010-08-01
期刊： TOHOKU JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE
影响因子： 2.2
作者： [Akiyama, Shizuko, Ohta, Hidenobu, Yaegashi, Nobuo]
通讯作者： Yaegashi, Nobuo
Period1誘導化合物の位相前進作用の解明とそれを用いた内的脱同調モデルの構築
  • 批准号：
    23K27213
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $6.07万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    程 肇
  • 依托单位：
    Kanazawa University
Period1誘導化合物の位相前進作用の解明とそれを用いた内的脱同調モデルの構築
  • 批准号：
    23H02522
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $12.15万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    程 肇
  • 依托单位：
    Kanazawa University
視交叉上核由来細胞を用いた概日リズム形成ネットワークの同定とシミュレーション
視交叉上核由来細胞を用いた哺乳類概日リズム発振システムのシミュレーション
  • 批准号：
    18016033
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $5.25万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    程 肇
  • 依托单位：
    Mitsubishi Kagaku Institute of Life Sciences
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