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視交叉上核由来細胞を用いた概日リズム形成ネットワークの同定とシミュレーション

視交叉上核由来細胞を用いた概日リズム形成ネットワークの同定とシミュレーション
使用视交叉上核来源细胞识别和模拟昼夜节律形成网络
批准号：
20016030
负责人：
程 肇
金额：
$4.48万
依托单位：
Kanazawa University (2009)Mitsubishi Kagaku Institute of Life Sciences (2008)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20016030/
关键词：
概日リズム視交叉上核時計遺伝子シミュレーション

项目摘要

项目成果

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SCN由来細胞内mRNAレベルが示す振動性及び動的反応性をトランスクリプトーム解析により包括的に解析した。明期性の振動を示す二つのクラスターに含まれる遺伝子のプロモータ構造にはCRE及びE boxが高い頻度で存在した。この結果は明期性の振動の維持と迅速な位相シフトにはこの二つのシスエレメントが機能していることを示す。さらに、リズムのロバストネスに寄与する新たな暗期性の転写フィードバックループを予測した。実際このループに含まれる2つの遺伝子の変異体を用いた行動解析を行ったところ、行動リズム異常という表現型が得られた。次に位相後退時に特異的に誘導される遺伝子群の中でSNARE複合体に含まれる-因子を支配するSnap25に着目した。この遺伝子の変異体について調べたところ、細胞の振動体間同調異常に起因すると考えられる行動リズムの異常を示した。さらに哺乳類概日時計中枢細胞におけるリズムのロバストネスに寄与する新たな暗期性の転写フィードバックループと、細胞間同調に関する経路を含む概日転写リズム形成のネットワークをそれぞれモデル化した。現在このモデルに含まれる、それぞれの細胞内パラメータ(mRNA、タンパク質濃度、それぞれの合成及び分解速度)を測定して用いた詳細なシミュレーションを実施した。そして、予測された概日リズム形成の中心的役割を担う遺伝子の機能欠損型変異体を作製した。これらの変異体について、電気生理学的解析や行動などの生理学的解析を行い、実際に暗期転写フィードバックに必要な新たな経路を見出した。
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Maternal Feeding Controls Fetal Biological Clock
DOI： 10.1371/journal.pone.0002601
发表时间： 2008-07-02
期刊： PLOS ONE
影响因子： 3.7
作者： [Ohta, Hidenobu, Xu, Shanhai, Okamura, Kunihiro]
通讯作者： Okamura, Kunihiro
Ontogeny of circadian organization in the rat.
大鼠昼夜节律组织的个体发育。
DOI： 10.1177/0748730408328438
发表时间： 2009-02
期刊： JOURNAL OF BIOLOGICAL RHYTHMS
影响因子： 3.5
作者： [Yamazaki, Shin, Yoshikawa, Tomoko, Biscoe, Elizabeth W., Numano, Rika, Gallaspy, Lauren M., Soulsby, Stacy, Papadimas, Evagelia, Pezuk, Pinar, Doyle, Susan E., Tei, Hajime, Sakaki, Yoshiyuki, Block, Gene D., Menaker, Michael]
通讯作者： Menaker, Michael
Reorganization of the suprachiasmatic nucleus coding for day length
DOI： 10.1177/0748730408314572
发表时间： 2008-04-01
期刊： JOURNAL OF BIOLOGICAL RHYTHMS
影响因子： 3.5
作者： [Naito, Emiko, Watanabe, Tsuyoshi, Ebihara, Shizufumi]
通讯作者： Ebihara, Shizufumi
Period-phase map : two-dimensional selection of circadian rhythm-related genes
周期相位图：昼夜节律相关基因的二维选择
DOI： --
发表时间： 2009
期刊： IET System Biology 3(6)
影响因子： --
作者： [Morioka R, Arita M, Sakamoto K, Kawaguchi S, Tei H, Horimoto K]
通讯作者： Horimoto K
共 6 条
    Period1誘導化合物の位相前進作用の解明とそれを用いた内的脱同調モデルの構築
    • 批准号：
      23K27213
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $6.07万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      程 肇
    • 依托单位：
      Kanazawa University
    Period1誘導化合物の位相前進作用の解明とそれを用いた内的脱同調モデルの構築
    • 批准号：
      23H02522
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $12.15万
    • 财政年份：
      2023
    • 负责人：
      程 肇
    • 依托单位：
      Kanazawa University
    ポリA鎖長に概日リズムが見られるmRNAのゲノムワイド検索
    • 批准号：
      22651072
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.11万
    • 财政年份：
      2010
    • 负责人：
      程 肇
    • 依托单位：
      Kanazawa University
    視交叉上核由来細胞を用いた哺乳類概日リズム発振システムのシミュレーション
    • 批准号：
      18016033
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.25万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      程 肇
    • 依托单位：
      Mitsubishi Kagaku Institute of Life Sciences
    海外基金