Development of genetic statistics verification base in effect of breeding based on allele analysis

基于等位基因分析的育种效果遗传统计验证库开发

• 批准号: 23580055
• 负责人: FUJII Hiroshi
• 金额: $ 3.66万
• 依托单位: National Agriculture and Food Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23580055/
• 关键词: アレル; カンキツ; カロテノイド; 遺伝統計学; SNP; 育種; 遺伝子; ゲノム; βークリプトキサンチン; アリル; 多型

Carotenoids have healthy functionality. The high content of carotenoids in citrus fruit is an important breeding objective. The content of the carotenoid is different in each cultivar. However the dominant cultivars in Japnan originates in the ancestral cultivar of 14. Therefore, the number of allele is limited to 28. The purpose of this study is that the allele type of 28 is shown in eight carotenoid metabolic enzyme genes and three transcription factor candidate genes that control them, and the allele combination related to the high content of carotenoids is clarified.Consequently, the sequences of 11 genes related to the content of the carotenoid was decided in the ancestral cultivar of 14. The allele type was decided by the SNP analysis.

类胡萝卜素具有健康的功能。 柑橘类胡萝卜素含量高是柑橘育种的重要目标。不同品种的类胡萝卜素含量不同。 然而，日本的优势品种起源于祖先品种14。因此，等位基因的数量被限制为28。本研究的目的是在8个类胡萝卜素代谢酶基因和3个调控它们的转录因子候选基因中显示28的等位基因类型，明确与高类胡萝卜素含量相关的等位基因组合，从而确定了14个祖先品种中与类胡萝卜素含量相关的11个基因的序列。通过SNP分析确定等位基因类型。

项目成果

eQTLによるUDP-グルコース：リモノイド糖転移酵素遺伝子の発現に関与する転写因子候補の探索

使用 eQTL 的 UDP-葡萄糖：搜索参与柠檬苦素糖基转移酶基因表达的候选转录因子

• 发表时间: 2014
• 作者: 大澤啓志;嶺田拓也;山田晋;北川淑子;楠本良延;大久保悟;石丸恵;杉山愛子，原田健太郎，島田武彦，藤井浩，遠藤朋子，喜多正幸，吉岡照高，生駒吉識，大村三男
• 通讯作者: 杉山愛子，原田健太郎，島田武彦，藤井浩，遠藤朋子，喜多正幸，吉岡照高，生駒吉識，大村三男

High-throughput genotyping in citrus accessions using an SNP genotyping array

• DOI: 10.1007/s11295-012-0542-3
• 发表时间: 2013-02-01
• 期刊: TREE GENETICS & GENOMES
• 影响因子: 2.4
• 作者: Fujii, Hiroshi;Shimada, Takehiko;Omura, Mitsuo
• 通讯作者: Omura, Mitsuo

QTLによるUDP-グルコース:リモノイド糖転移酵素遺伝子の発現に関与する転写因子候補の探索

使用 QTL 搜索参与 UDP-葡萄糖：柠檬苦素糖基转移酶基因表达的候选转录因子

• 发表时间: 2014
• 作者: 杉山愛子;原田健太郎;島田武彦;藤井浩;遠藤朋子;喜多正幸;吉岡照高;生駒吉識;大村三男
• 通讯作者: 大村三男