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配列特異的ＤＮＡ脱メチル化を促す非コードＲＮＡによる哺乳類神経分化制御機構の解明

阐明非编码RNA控制哺乳动物神经分化的机制，促进序列特异性DNA去甲基化

基本信息

批准号：
12J01544
负责人：
山本直樹
金额：
$ 1.92万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2015-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本課題は、ラットPC12細胞の不可逆的な神経分化に関わるローカルなエピジェネティック制御因子 promoter-associated noncoding RNA（pancRNA）の同定と作用機序の解明を目的としている。本年度は前年度に行ったPC12のダイレクショナルRNA-seq解析結果を元に、PC12の不可逆分化に関わる領域特異的エピゲノム制御因子である機能的非コードRNAであるpancNusap1を同定し、研究目標を達成した。RNA-seqデータの解析より、不可逆的に分化に関わるpancRNAとそのmRNAのペアとして、M期進行にかかわる遺伝子Nusap1とそのプロモーターから発現しているpancRNA、pancNusap1のペアに着目した。Nusap1とpancNusap1の発現状態はプロモーターのヒストンのアセチル化変化を伴って正に相関しており、細胞の増殖が活発なほど発現が高く、不可逆分化後は強く発現抑制されていた。レンチウィルスを用いたpancNusap1の人為的な発現抑制は、Nusap1遺伝子の発現抑制とNusap1プロモーター領域のヒストンアセチル化レベルの低下、細胞周期の停止を引き起こした。逆に、不可逆分化PC12におけるpancNusap1の人為的な過剰発現は、転写方向特異的に、Nusap1の発現上昇、Nusap1プロモーターのヒストンアセチル化レベルの上昇、さらには可逆的な分化状態への転換を促した。これらの事実から、PC12細胞の不可逆的分化過程では、cAMP依存的にpancNusap1の発現が抑制され、その結果Nusap1プロモーター領域のヒストンアセチル化レベルの低下を引き起こし、Nusap1の発現と細胞増殖がエピジェネティックに抑制された結果、不可逆的な分化を引き起こしているということが考えられる。

In this topic, the PC12 cell is irreversible. The control factor promoter-associated noncoding RNA (pancRNA) is the same as the sequence of action mechanism to explain the purpose. In the previous year, we conducted the analysis of the results of the analysis of the RNA-seq of the previous year, the results of the RNA-seq analysis, the irreversible differentiation of the PC12, the controlling factor of the special field, the non-linear RNA of the mechanism, and the target of the study. The RNA-seq data analysis, the irreversible differentiation, the pancRNA response, the mRNA response, and the phase M analysis show that the pancRNA and the pancNusap1 are in good condition. Nusap1