GFP蛍光による線虫RNA結合蛋白質の網羅的発現部位解析手法の確立
GFP蛍光による線虫RNA結合蛋白質の網羅的発現部位解析手法の確立
批准号:
08878114
负责人:
坂本 博
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
1996
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1996 至 --
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英文摘要
本研究においては、蓄積しつつあるデータベースを利用して線虫ゲノムに存在するRRM型のRNA結合蛋白質遺伝子を網羅的に検索し、そのプロモーターを含む上流域を予測し、green fluorescent protein(GFP)との融合遺伝子を作製し、蛍光観察による発現部位解析手法の確立を試みた。この方法論を確立するために、検索された20種類以上のRRM型遺伝子の中から3種類を選び、GFPをレポーターとする方法とLacZをレポーターとする従来法の両方の発現解析を行い、その結果を比較検討した結果、以下のような知見が得られた。1.ヒトのスプライシング因子SRP20と類似の線虫C33H5.12蛋白質は、主に卵と特定の筋肉細胞で発現していること、2.神経細胞に特異的に発現するヒトのHuD蛋白質と類似のF35H8.5蛋白質は、予想されたように特定の神経細胞で発現していること、3.XenopusのNrp1-Bと類似のR10E9.1蛋白質は、一部腸細胞でも発現が認められたが、F35H8.5蛋白質と同様に主に神経細胞において発現していること、などが明らかになった。上記2及び3の結果は、高等動物における両相同蛋白質の発現様式にきわめて類似するものであり、今後線虫を用いた発現調節様式や機能解析がその他の生物についても充分適用できるものであることを強く示唆した。さらに、上記1の結果のようにSRP20と類似の線虫C33H5.12蛋白質がスプライシング基本因子と推定されるにもかかわらず組織特異的発現を示したことは、高等動物におけるスプライシング制御機構解明に新たな知見を与えるものとして重要であると考えられる。また、LacZとGFPの解析結果が必ずしも完全に一致しないことも明らかになり、GFPによる解析法をさらに改良するためのいくつかの問題点の検討も行った。
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会议论文
線虫の発生分化過程におけるRNA結合蛋白質機能の網羅的解析
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批准号:13202037
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$4.22万
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财政年份:2001
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负责人:坂本 博
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依托单位:
RNA結合蛋白質Huの機能特異性を決定するアミノ酸残基の解析
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批准号:12029215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2000
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负责人:坂本 博
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依托单位:
線虫の発生分化過程におけるRNA結合蛋白質機能の網羅的解析
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批准号:12202026
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:坂本 博
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依托单位:
神経特異的HuD蛋白質の細胞内シャトリングシグナルの解析
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批准号:11155217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:坂本 博
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依托单位:
神経特異的RNA結合蛋白質Huによる細胞分化誘導機構の解析
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批准号:10174222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1998
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负责人:坂本 博
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依托单位:
神経特異的Hu蛋白質の機能ドメイン構造の解析
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批准号:09278221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1997
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负责人:坂本 博
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依托单位:
ショウジョウバエSxl蛋白質のRNA結合特異性と蛋白質間相互作用
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批准号:07250213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.11万
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财政年份:1995
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负责人:坂本 博
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依托单位:
ショウジョウバエS×l遺伝子における性特異的スプライシング機構
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批准号:06258212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.92万
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财政年份:1994
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负责人:坂本 博
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依托单位:
スプライシングに関与するRNAヘリカーゼ遺伝子のクローニング
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批准号:05680593
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1993
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负责人:坂本 博
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依托单位:
ショウジョウバエSxl遺伝子における性特異的スプライシング機構
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批准号:05265216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:1993
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负责人:坂本 博
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依托单位:
デ-タベ-スと人工知能を用いたRNAスプライス部位選択に関する研究
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批准号:03266208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.79万
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财政年份:1991
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负责人:坂本 博
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依托单位:
ショウジョウバエのdsx遺伝子における性特異的スプライシング機構の研究
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批准号:03680219
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1991
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负责人:坂本 博
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依托单位:
海外基金