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遺伝的メカニズムにより生じた欠失染色体の切断末端の塩基配列決定

由遗传机制引起的缺失染色体断裂末端的测序

基本信息

批准号：
08874102
负责人：
遠藤隆
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
1996
资助国家：
日本
起止时间：
1996 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08874102/
关键词：
パンコムギ染色体欠失 PCR テロメアトランスポゾン

项目摘要

本研究の代表者である遠藤は、パンコムギに染色体切断を誘発する遺伝的なシステムを確立し、多数のパンコムギ染色体欠失系統を育成した。本研究は、欠失染色体の切断点のDNA塩基配列を明らかにし、このような染色体切断の分子的メカニズムの解明を目指した。実験材料として任意にパンコムギ染色体欠失系統を50選び、それら及び対照としての正常パンコムギから抽出したDNAをテンプレートとしたPolymerase Chain Reaction(PCR)を行った。その際、PCRのプライマーとして、一方はテロメアの配列から設計したものを用い、他方にrDNAの配列及びランダムプライマーを用いた。この結果、ある一つのランダムプライマーで、欠失系統に特異的なDNAの増幅が見られた。しかも、この増幅はほとんどの欠失系統で見られた。この事実は、プライマーと欠失系統の特定の組合わせでDNA増幅が起こるという当初の予想とは異なり、染色体切断が特定の塩基配列のところで起こっている可能性を示唆した。現在、このPCRによるDNA増幅が、本当に欠失染色体と関連しているかどうかを確かめるため、欠失染色体がテヘロ接合の個体に正常パンコムギを交配した子孫での調査を行っている。また、もう一つのランダムプライマーでは、テロメアプライマーと組み合わさなくても、約70%の欠失系統で特異的な約7kbのDNA増幅が起こった。欠失系統を育成した元の2C染色体(Aegilops cylindrica由来)添加系統ではこのプライマーによる同じサイズのDNA増幅が起こるが、正常系統では起こらないという事実は、トランスポゾン様のDNA断片が欠失系統に移入されていることを示唆している。現在、このDNA断片の塩基配列を解読中である。本研究は、当初の目的を超え、一気に染色体切断のメカニズム迫ることができるような展開を見せている。

Representatives of this research include Keno Endo, the founder of the Chromosome Cutting System, and the Chromosome Deletion System, the Chromosome Deletion System. This study is based on the DNA base alignment of the chromosome cutting point and the DNA molecular structure of the chromosome cutting point.実験 Materials: としてarbitrary にパンコムギchromosome loss system を50 selected び, それら and び対光としてのnormal DNA extraction したDNAをテンプレートとしたPolymerase Chain Reaction(PCR)を行った.その记, PCRのプライマーとして, 一方はテロメアの配arrayからDesignしたものを用い, にrDNAのalignment of other parties and びランダムプライマーを用いた.このRESULT, ある一つのランダムプライマーで, なDNA Amplification が见られた which is specific to the missing system.しかも、このincreasing width はほとんどの无码不卡で见られた. The specific combination of the missing system and the original DNA extension I think about the possibility of different chromosome cutting and specific chromosome ligation. Now, what is the DNA amplification of the PCR, what is the missing chromosome and the relationship between it and the correct one?ため、The individuals who lacked chromosomes are joined together and the individuals are mated normally and the descendants are investigated and carried out.また、もう一つのランダムプライマーでは、テロメアプライマーとgroup み合わさAbout 70% of the DNA is missing from the system and is specific to the system. About 7kb of DNA has been amplified. Aegilops cylindrica origin) add system ではこのプライマーによる同じサイズのDNA Amplification が出こるが, normal systemでは起こらないという事実は、トランスポゾン様のDN A fragment of the missing system has been moved into the system. Now, the solution of the DNA fragment's base arrangement is the same. The original purpose of this study was to develop a chromosome cutting system and a chromosome cutting system.