アデノシルコバラミンの補酵素活性の発現と維持に関わる蛋白質の機能解析
アデノシルコバラミンの補酵素活性の発現と維持に関わる蛋白質の機能解析
批准号:
10129222
负责人:
虎谷 哲夫
金额:
$1.09万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 --
中文摘要
(1) B_<12>補酵素のジオールデヒドラターゼへの結合様式を明らかにするために、電子常磁性共鳴(EPR)を用いた実験を行った。酵素タンパク側を^<15>N標識してもEPRスペクトルの変化は見られなかったが、補酵素アナログの下方配位子を^<15>N標識すると超超微細分裂線が3本から2本に変化した。したがって、本酵素では、補酵素を"base-On"型で結合することが明らかになった。さらに、これらのアナログを用いた場合のEPRスペクトルの経時変化と反応性を比較することで、下方配位子のかさ高な塩基がラジカル中間体の安定化に寄与しており、ラジカル酵素反応の継続的な進行に重要な役割を果たしていることが明らかとなった。(2) ジオールデヒドラターゼとシアノコバラミンの複合体を結晶化し、結晶構造解析に適した2種類の結晶を得た。1つは斜方晶系、いま1つは単斜晶系に属し、それぞ2.2Å、3.0Å分解能の範囲までの回折像を与えた。重原子同型置換体を作成し、多重同型置換法により結晶構造解析を進めている。(3) 我々は以前に、Klebsiella oxytocaには不活性化されたB_<12>補酵素関与ジオールデヒドラーゼを再活性化する系が存在することを報告し、最近、2つの遺伝子を再活性化因子遺伝子として同定した。本年度は、その遺伝子産物を精製し、再活性化因子としての機能を確認した。大腸菌で高発現させた2つの蛋白質は共精製され、非変性条件下では複合体として存在した。この推定再活性化因子は、グリセロールやO_2で不活性化されたホロ酵素を再活性化することがin vitroで初めて示された。機構としては、不活性化の過程でアデニン部分を失った修飾補酵素が、再活性化因子とATP、Mg^<2+>存在下で酵素から解離し、生じたアポ酵素に遊離の補酵素すなわちアデニン部をもつコバラミンが結合することにより、活性なホロ酵素が再構成されることが明らかとなった。
英文摘要
(1) B_<12>補酵素のジオールデヒドラターゼへの結合様式を明らかにするために、電子常磁性共鳴(EPR)を用いた実験を行った。酵素タンパク側を^<15>N標識してもEPRスペクトルの変化は見られなかったが、補酵素アナログの下方配位子を^<15>N標識すると超超微細分裂線が3本から2本に変化した。したがって、本酵素では、補酵素を"base-On"型で結合することが明らかになった。さらに、これらのアナログを用いた場合のEPRスペクトルの経時変化と反応性を比較することで、下方配位子のかさ高な塩基がラジカル中間体の安定化に寄与しており、ラジカル酵素反応の継続的な進行に重要な役割を果たしていることが明らかとなった。(2) ジオールデヒドラターゼとシアノコバラミンの複合体を結晶化し、結晶構造解析に適した2種類の結晶を得た。1つは斜方晶系、いま1つは単斜晶系に属し、それぞ2.2Å、3.0Å分解能の範囲までの回折像を与えた。重原子同型置換体を作成し、多重同型置換法により結晶構造解析を進めている。(3) 我々は以前に、Klebsiella oxytocaには不活性化されたB_<12>補酵素関与ジオールデヒドラーゼを再活性化する系が存在することを報告し、最近、2つの遺伝子を再活性化因子遺伝子として同定した。本年度は、その遺伝子産物を精製し、再活性化因子としての機能を確認した。大腸菌で高発現させた2つの蛋白質は共精製され、非変性条件下では複合体として存在した。この推定再活性化因子は、グリセロールやO_2で不活性化されたホロ酵素を再活性化することがin vitroで初めて示された。機構としては、不活性化の過程でアデニン部分を失った修飾補酵素が、再活性化因子とATP、Mg^<2+>存在下で酵素から解離し、生じたアポ酵素に遊離の補酵素すなわちアデニン部をもつコバラミンが結合することにより、活性なホロ酵素が再構成されることが明らかとなった。
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T.Tobimatsu,et al.: "Molecular Cloning, Sequencing and Characterization of the Genes for Adenosylcobalamin dependent Diol Dehydratase of Klebsiella pneumoniae" Biosci.Biotechnal.Biochem.62(9). 1774-1777 (1998)
T.Tobimatsu 等人:“肺炎克雷伯菌腺苷钴胺依赖性二醇脱水酶基因的分子克隆、测序和表征”Biosci.Biotechnal.Biochem.62(9)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
J.Masuda,et al.: "Crystallization and Preliminary X-ray Study of Two Crystal Forms of Klebsiella oxytoca Diol Dehydratase-cyanocobalamin Complex" Acta Crystallographica D. in press. (1999)
J.Masuda 等人:“产酸克雷伯氏菌二醇脱水酶-氰钴胺复合物两种晶型的结晶和初步 X 射线研究”Acta Crystallographa D. 正在出版。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
M.Yamanishi,et al.: "Evidence for Axial Coordination of 5,6-Dimethylbenzimidazole to the Cobalt Atom of Adenosylcobalamin Bound to Diol Dehydratase" Biochemistry. 37(14). 4799-4803 (1998)
M.Yamanishi 等人:“5,6-二甲基苯并咪唑与与二醇脱水酶结合的腺苷钴胺素的钴原子轴向配位的证据”生物化学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
T.Toraya and K.Mori: "A Reactivating Factor for Coenzyme B_<12>-Dependent Diol Dehydratase" Journal of Biological Chemistry. 274(6). 3372-3377 (1999)
T.Toraya 和 K.Mori:“辅酶 B_12-依赖性二醇脱水酶的重新激活因子”生物化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
M. Yamanishi, et al.: "EPR Spectroscopic Evidence for the Mechanism-Based Inactivation of Adenosylcobalamin-Dependent Diol Dehydratase by Coenzyme Analogs"Journal of Biochemistry. 124(3). 598-601 (1998)
M. Yamanishi 等人:“辅酶类似物对腺苷钴胺素依赖性二醇脱水酶的基于机制的灭活的 EPR 光谱证据”生物化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
B12酵素とその分子シャペロン様再活性化因子との超分子複合体の立体構造解析
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批准号:18054023
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.1万
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财政年份:2006
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
アデノシルコバラミンの補酵素活性の発現と維持に関わる蛋白質の機能解析
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批准号:09235221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
アデノシルコバラミンの補酵素活性の発現と維持に関わる蛋白質の機能解析
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批准号:08249226
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
アポ酵素との複合体形成によるビタミンB_<12>補酵素の活性化と機能発現
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批准号:07229234
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1995
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
アポ酵素との複合体形成によるビタミンB_<12>補酵素の活性化と機能発現
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批准号:06240237
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1994
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
酵素によるビタミンB12補酵素の構造認識と補酵素機能の発現
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批准号:04220227
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1992
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
酵素によるビタミンB_<12>補酵素の構造認識と補酵素機能の発現
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批准号:03236229
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1991
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
酵素によるビタミンB_<12>補酵素の構造認識と補酵素機能の発現
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批准号:02250108
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1990
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
酵素反応におけるビタミンB_<12>補酵素の炭素-コバルト結合活性化の機構
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批准号:62215018
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1987
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
酵素反応におけるビタミンB∋⊆補酵素の炭素-コバルト結合活性化の機構
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批准号:61225013
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1986
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
モリブデン補酵素のプテリジン成分の構造決定
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批准号:58580110
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1983
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
ビタミンB12補酵素の構造と機能の関係
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批准号:56580108
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.88万
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财政年份:1981
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
ビタミンB_<12>酵素の自殺的不活性化剤に関する研究
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批准号:X00210----579098
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.55万
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财政年份:1980
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
ビタミンB12酵素の基質による不活性化とその細胞内修復機構
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批准号:X00210----479134
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.38万
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财政年份:1979
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
ビタミンB_<12>関与ジオール脱水酵素の作用機作とサブユニット構造の研究
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批准号:X00210----078042
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.16万
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财政年份:1975
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
生体内におけるビタミンB_<12>族化合物相互の酵素的転換とその生理的意義
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批准号:X00210----978042
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.19万
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财政年份:1974
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负责人:虎谷 哲夫
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依托单位:
海外基金