课题基金 / 基金详情

B12酵素とその分子シャペロン様再活性化因子との超分子複合体の立体構造解析

B12酵素とその分子シャペロン様再活性化因子との超分子複合体の立体構造解析
B12酶与其类分子伴侣再激活剂超分子复合物的三维结构分析
批准号:
18054023
负责人:
虎谷 哲夫
金额:
$4.1万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007

项目摘要

项目成果

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我々は不活性化されたB_<12>補酵素関与ジオールデヒドラターゼ(DD)ホロ酵素を再活性化するDD再活性化因子(DDR)を発見し、生化学的および結晶構造学的解析を行って作用機作を明らかにしてきた。本研究では、DDおよびDDRの結晶構造解析の結果からDD-DDR複合体の形成に重要であると予測されるアミノ酸残基に変異を導入した変異型蛋白質の作成と機能解析、ATPアナログ結合型DDRの結晶構造解析、DD-DDR超分子複合体の結晶化、の3点について研究を行った。まず、変異型DDRと野生型DDを共発現した大腸菌の透過性菌体の系を用いて、グリセロールで不活性化されたDDの再活性化を調べた結果とDDおよびDDRの立体構造から、DD-DDR複合体中ではDDRのGluβ31に代わって、DDのGluβ97がMg^<2+>を介してDDRαサブユニットと相互作用し、DDRβサブユニットの解離が起こることが示唆された。また、グリセロールデヒドラターゼ(GD)およびGD再活性化因子(GDR)の精製蛋白質も用いて調べたところ、DDRはGDを再活性化できるが、GDRはDDを再活性化できないという再活性化因子の特異性は酵素との複合体形成能によって決定されていることが強く示唆された。これは立体構造に基づく両者の接触面積の計算結果からも支持された。よって、再活性化には安定な酵素一再活性化因子複合体の形成が不可欠であると結論できた。先に、ADP結合型DDRの立体構造を報告したが、再活性化の分子機構解明のためにはATP結合型の構造解析が必要である。今回は、ATP-y-S結合型DDRについて約3Åの分解能で結晶構造解析に成功した。さらに、DD-DDR超分子複合体の構造解析のために、複合体形成の過程で解離するDDRβサブユニットを系外へ除くことにより複合体を安定化し、結晶化を試みたが、結晶は得られなかった。
期刊论文(11)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1111/j.1742-4658.2007.06074.x
发表时间: 2007-11
期刊: The FEBS Journal
影响因子: --
作者: [H. Kajiura;K. Mori;N. Shibata;T. Toraya]
通讯作者: H. Kajiura;K. Mori;N. Shibata;T. Toraya
Survey of catalytic residues and essential roles of glutamate-α170 and aspartate-α335 in coenzyme B12-dependent diol dehydratase
谷氨酸-α170 和天冬氨酸-α335 在辅酶 B12 依赖性二醇脱水酶中的催化残基和重要作用的调查
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Journal of Biological Chemistry 281(27)
影响因子: --
作者: [H.Matsumura, H.Takahashi, T.Inoue, T.Yamamoto, H.Hashimoto, M.Nishioka, S.Fujiwara, M.Takagi, T.Imanaka, Y.Kai, Sakai T, Kawata M]
通讯作者: Kawata M
DOI: 10.3177/jnsv.53.102
发表时间: 2007-04
期刊: Journal of nutritional science and vitaminology
影响因子: 1.6
作者: [T. Sakai;A. Yamasaki;Satoshi Toyofuku;Tsuneo Nishiki;Michio Yunoki;Noriaki Komoto;T. Tobimatsu;T. Toraya]
通讯作者: T. Sakai;A. Yamasaki;Satoshi Toyofuku;Tsuneo Nishiki;Michio Yunoki;Noriaki Komoto;T. Tobimatsu;T. Toraya
Histidine-a143 Assists 1,2-Hydroxyl Group Migration and Protects Radical Intermediates in Coenzyme B12-Dependent Diol Dehydratase
组氨酸-a143 协助 1,2-羟基迁移并保护辅酶 B12 依赖性二醇脱水酶中的自由基中间体
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: Biochemistry 47(10)
影响因子: --
作者: [Kinoshita K, Kawata M, Ogura K, Yamasaki A, Watanabe T, Komoto N, Hieda N, Yamanishi M, Tobimatsu T, Toraya T]
通讯作者: Toraya T
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    アデノシルコバラミンの補酵素活性の発現と維持に関わる蛋白質の機能解析
    • 批准号:
      10129222
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
    • 资助金额:
      $1.09万
    • 财政年份:
      1998
    • 负责人:
      虎谷 哲夫
    • 依托单位:
    アデノシルコバラミンの補酵素活性の発現と維持に関わる蛋白質の機能解析
    • 批准号:
      09235221
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.34万
    • 财政年份:
      1997
    • 负责人:
      虎谷 哲夫
    • 依托单位:
    アデノシルコバラミンの補酵素活性の発現と維持に関わる蛋白質の機能解析
    • 批准号:
      08249226
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.28万
    • 财政年份:
      1996
    • 负责人:
      虎谷 哲夫
    • 依托单位:
    アポ酵素との複合体形成によるビタミンB_<12>補酵素の活性化と機能発現
    • 批准号:
      07229234
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.34万
    • 财政年份:
      1995
    • 负责人:
      虎谷 哲夫
    • 依托单位:
    海外基金