Mechanismus des durch HLA-DM und kleine Moleküle vermittelten MHCII:Peptid-Austausch
Mechanismus des durch HLA-DM und kleine Moleküle vermittelten MHCII:Peptid-Austausch
批准号:
186308555
负责人:
Professor Dr. Christian Freund
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2011
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2010-12-31 至 2014-12-31
中文摘要
MHC-Klasse II(MHCII)Molekülen MIT Peptid-Fragmenten病原体Ursprungs and Deren Präsentation auf der Oberfläche抗原-Präsenerender Zellen(APC)gehört zu den wichtiggous Auslösern der Adaptiven免疫学字。MIT DEM Clip-Peptid vorbelrenen MHC Klasse II Proteine Treffen im Shoren Environmental Später Enososomaler Vesikel auf Fremde多肽。DAS蛋白人类白细胞抗原-DM(DM)katalysiert dot den Austausch von Clip gegen抗原肽MIT Höherer Affinität.我是Gegensatz zu den MHCII Molekülen,这是一名在Der Lage多肽Zu Binden中的人类白细胞抗原-DM(DM)患者。您的位置:我也知道>教育/科学>教育/科学>科学与技术>。Während DM auschlieülich im suren world ieu Enosomaler Vesikel aktivist,entforten viele der sgenannten“MHC Load Enhancer”(MLE)Ihre Wirkung unabhängig vom pH-Wert and allSpezifisch am auf der Zelloberfläche Präsenerten MHCII.我是MHCII肽的Rahman des Beantragten Projekts möchten wir den Machismus der MHCII Peptid-Beladung MIT Hilfe von NMR-Spektroskopie,or tsSpezifischer Mutagenese and Modellierung Dieses es Dynamischen Prozess Aufklären。我们将在Gegenwartvon DM bezieonggSweise von bereits bekannten kleinen Molekülen MIT MLE-Aktiität中使用Beladung des MHCII Allels HLA-DR1(DR1)CLIP多肽和Sowie Dessen Austausch gegen das höher affine Hämagoginin(HA)多肽。IsotOpen-Markierung der einzelnen Ketten Sowie Einiger Aminosäure-Typen des MHCII a/b杂二聚体的核磁共振共振谱。在CLIP/HA辅助实验中,我们对Verschiebung、Wasserstoff-Deurium-Austausch-Rten和NMR-Relaxationszeiten von Wichtigen Protein-and Peptid-Resonanzen进行了分析。这是一种新的运动方式、结构和动力,从开始到现在都是如此。我们的实验是这样的:一种动态的模拟,一种新的方式,一种方式。在Kombination MIT Einer突变中,分析了Ligter soll ssoohl der Machismus des natürlichen,DM vermittelten,ALS des duch kleine Moleküle Beschleunigten Peptidaustauschs Be MHCII Proteinen untersuht。在此之前,我们需要一名机械师,一名职业技术人员,以及一名职业技术人员。在此期间,我们将不再使用机械设备,也不再使用新的设备。
英文摘要
Die intrazelluläre Beladung von MHC Klasse II (MHCII) Molekülen mit Peptid- Fragmenten pathogenen Ursprungs und deren Präsentation auf der Oberfläche Antigen-präsentierender Zellen (APC) gehört zu den wichtigsten Auslösern der adaptiven Immunantwort. Die mit dem CLIP-Peptid vorbeladenen MHC Klasse II Proteine treffen im sauren Milieu später endosomaler Vesikel auf „fremde“ Peptide. Das Protein HLA-DM (DM) katalysiert dort den Austausch von CLIP gegen antigenes Peptid mit höherer Affinität. HLA-DM ist den MHC Klasse II Proteinen strukturell weitgehend homolog. Im Gegensatz zu den MHCII Molekülen, ist HLA-DM (DM) nicht in der Lage Peptide zu binden. Neben DM katalysieren auch einige kleine organische Moleküle die Peptid-Beladung. Während DM ausschließlich im sauren Milieu endosomaler Vesikel aktiv ist, entfalten viele der sogenannten „MHC Loading Enhancer“ (MLE) ihre Wirkung unabhängig vom pH-Wert und allelspezifisch am auf der Zelloberfläche präsentierten MHCII. Im Rahmen des beantragten Projekts möchten wir den Mechanismus der MHCII Peptid-Beladung mit Hilfe von NMR-Spektroskopie, ortsspezifischer Mutagenese und Modellierung dieses dynamischen Prozesses aufklären. Es wird die Beladung des MHCII Allels HLA-DR1 (DR1) mit dem CLIPPeptid sowie dessen Austausch gegen das höher affine Hämagglutinin (HA) Peptid in Gegenwart von DM beziehungsweise von bereits bekannten kleinen Molekülen mit MLE-Aktivität untersucht. Isotopen-Markierung der einzelnen Ketten sowie einiger Aminosäure-Typen des MHCII a/b Heterodimers wird zur NMR-Resonanzzuordnung strukturell wichtiger Regionen führen. In CLIP/HA Austauschexperimenten werden wir Änderungen der chemischen Verschiebung, der Wasserstoff-Deuterium-Austausch- Raten und NMR-Relaxationszeiten von wichtigen Protein- und Peptid-Resonanzen analysieren. Auf diese Weise können kinetische, strukturelle und dynamische Veränderungen, die den Peptid-Austausch begleiten, auf atomarer Ebene verfolgt werden. Diese experimentellen Daten fließen in Moleküldynamiksimulationen ein, die zum Ziel haben, den Austauschprozess im Detail abzubilden sowie strukturelle Hypothesen zu generieren, die dann experimentell überprüft werden. In Kombination mit einer Mutationsanalyse beteiligter Reste soll sowohl der Mechanismus des natürlichen, DM vermittelten, als auch des durch kleine Moleküle beschleunigten Peptidaustauschs bei MHCII Proteinen untersucht werden. Hohe Priorität hat die Aufklärung molekularer Mechanismen, die zur Bildung und Auflösung des MHCII/DM Komplexes entscheidend beitragen. Die durch DM beeinflussten Konformationen des zum Peptidaustausch befähigten MHCII sind Ausgangspunkt weiterführender Untersuchungen sowohl zur Aufklärung des Wirkmechanismus bekannter MLE als auch zur Entwicklung neuer, effizienter, selektiv wirksamer MLE.
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.4049/jimmunol.1401389
发表时间:
2015-01-15
期刊:
JOURNAL OF IMMUNOLOGY
影响因子:
4.4
作者:
[Alvaro-Benito, Miguel, Wieczorek, Marek, Freund, Christian]
通讯作者:
Freund, Christian
Susceptibility to HLA-DM Protein Is Determined by a Dynamic Conformation of Major Histocompatibility Complex Class II Molecule Bound with Peptide*
对 HLA-DM 蛋白的敏感性由与肽结合的主要组织相容性复合物 II 类分子的动态构象决定*
DOI:
10.1074/jbc.m114.585539
发表时间:
2014
期刊:
The Journal of Biological Chemistry
影响因子:
--
作者:
[Wieczorek, Sticht, Bylsma, Mellins, Freund]
通讯作者:
Freund
Peptide linkage to the α-subunit of MHCII creates a stably inverted antigen presentation complex.
与 MHCII α 亚基的肽连接创建稳定的反向抗原呈递复合物
DOI:
10.1016/j.jmb.2012.07.008
发表时间:
2012
期刊:
Journal of molecular biology
影响因子:
5.6
作者:
[Schlundt, Günther, Sticht, Wieczorek, Heinemann, Freund]
通讯作者:
Freund
Dynamic properties of MHC class II allotypes
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批准号:389623510
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2017
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负责人:Professor Dr. Christian Freund
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依托单位:
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批准号:283011643
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项目类别:Priority Programmes
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2015
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负责人:Professor Dr. Christian Freund
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批准号:35756281
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项目类别:Research Units
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2007
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负责人:Professor Dr. Christian Freund
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批准号:24981824
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2006
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负责人:Professor Dr. Christian Freund
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依托单位:
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批准号:20026493
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2006
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负责人:Professor Dr. Christian Freund
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依托单位:
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批准号:5396692
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2002
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负责人:Professor Dr. Christian Freund
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依托单位:
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批准号:528514500
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Christian Freund
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依托单位:
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