DNA-katalysierte Verknüpfungs-Cyclisierungs-Reaktionen: Entwicklung einer hochselektiven, signalamplifizierenden Methode für die Mutationsanalyse
DNA-katalysierte Verknüpfungs-Cyclisierungs-Reaktionen: Entwicklung einer hochselektiven, signalamplifizierenden Methode für die Mutationsanalyse
批准号:
36411985
负责人:
Professor Dr. Oliver Seitz
金额:
$0.0万
依托单位:
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2007
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2006-12-31 至 2011-12-31
中文摘要
Die DNA/RNA-kontrollierte chemische Ligation ist ein nützliches Werkzeug für die Nanowissenschaft,für die chemische Evolution und für die Nucleinsäureanalytik.如果产品质量不高,那么梅尔将为目标提供一个产品信号。Eine Amplifizierung durch chemische Katalyse wäre wünschenswert,z.B.在突变分析中,如果DNA/RNA在遗传学上存在差异。理想的方法是聚合物反应非常韦尔登。Zentral für die Erreichung eines katalytischen Templateffekts ist,dass die Templataffmität des Reaktionsprodukts nicht höher sein darf als die der Edukte.在这个项目中,将有一个新的产品开发项目,并将有一个全球性的产品信息化项目。Eine Cyclisierung,die erst nach der Verknüpfung möglich wird,soll die Affinität für das Templat herabsetzen und damit katalytischen Turnover ermöglichen.这也是一个需要对DNA进行”真实“突变分析的最高测序(4000个)PNA-Verknüpfung。随后韦尔登检测法开始使用,并在此基础上建立了实时PCR分析基因组DNA的方法。Weiterhin wird untersucht,ob eine templatgesteuerte Oligomerisierung eine Zählung repititiver Genabschnitte zulässt.
英文摘要
Die DNA/RNA-kontrollierte chemische Ligation ist ein nützliches Werkzeug für die Nanowissenschaft, für die chemische Evolution und für die Nucleinsäureanalytik. Üblicherweise verhindert Produktinhibierung, dass mehr als ein Produktsignal pro Target entsteht. Eine Amplifizierung durch chemische Katalyse wäre wünschenswert, z.B. in der Mutationsanalyse, wenn die nachzuweisende DNA/RNA in geringen Konzentrationen vorliegt. Idealerweise könnte auf eine Polymerasekettenreaktion verzichtet werden. Zentral für die Erreichung eines katalytischen Templateffekts ist, dass die Templataffmität des Reaktionsprodukts nicht höher sein darf als die der Edukte. In diesem Projekt wird eine neue Strategie verfolgt, die auf eine globale Änderung der Produktkonformation abzielt. Eine Cyclisierung, die erst nach der Verknüpfung möglich wird, soll die Affinität für das Templat herabsetzen und damit katalytischen Turnover ermöglichen. Es ist ausserdem die Absicht, die extrem hohe Sequenzspezifität (4000fach) der PNA-Verknüpfung für eine „reale" DNA-Einzelbasenmutationsanalyse nutzbar zu machen. Hierfür werden FRET-detektierte Verknüpfungsreaktionen entwickelt, die unter den herausfordernden Bedingungen der Realtime-PCR-Analyse genomischer DNA von statten gehen. Weiterhin wird untersucht, ob eine templatgesteuerte Oligomerisierung eine Zählung repititiver Genabschnitte zulässt.
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
The role of reactivity in DNA templated native chemical PNA ligation during PCR.
PCR 过程中 DNA 模板天然化学 PNA 连接反应活性的作用
DOI:
10.1016/j.bmc.2013.04.064
发表时间:
2013
期刊:
Bioorganic & medicinal chemistry
影响因子:
3.5
作者:
[A. Roloff, O. Seitz]
通讯作者:
O. Seitz
DOI:
10.1039/c2sc20961f
发表时间:
2013-01-01
期刊:
CHEMICAL SCIENCE
影响因子:
8.4
作者:
[Roloff, Alexander, Seitz, Oliver]
通讯作者:
Seitz, Oliver
Reducing Product Inhibition in Nucleic Acid‐Templated Ligation Reactions: DNA‐Templated Cycligation
减少核酸模板化连接反应中的产物抑制:DNA模板化环化
DOI:
10.1002/cbic.201300516
发表时间:
2013
期刊:
ChemBioChem
影响因子:
3.2
作者:
[A. Roloff, O. Seitz]
通讯作者:
O. Seitz
Brightness- and contrast-enhanced RNA hybridization probes for mRNA imaging and recognition of living cells
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批准号:429038820
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2019
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
High performance auxiliaries for a cysteine-tolerant native chemical ligation at arbitrary sites
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批准号:367109134
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2017
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
RNA-controlled synthesis of peptides via peptidyl transfer reactions with peptide-nucleic acid conugates
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批准号:225213878
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2012
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Basenlabile Auxiliare für die cysteinfreie Peptidverknüpfung
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批准号:162960495
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2009
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Eine allgemeine Methode zur Fmoc-basierten Festphasensynthese von Peptidthioestern über S>S-Acyltransfer
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批准号:117349398
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2009
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Energy transfer and enforced intercalation: Responsive as well as bright DNA-based high performance probes for RNA imaging in live cells
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批准号:52097295
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2007
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Selbstreinigende Synthese von Peptidthioestern zum Aufbau von Proteindomänen auf Arrays und auf Beads
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批准号:21521648
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2005
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Duplex-Oligodesoxynucleotide mit C-glycosidisch gebundenen Basensurrogaten zur Untersuchung des Basen-Ausklapp-Mechanismus und selektiven Inhibition von DNA-Methyltransferasen
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批准号:5439830
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2004
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
DNA-Templat-kontrollierte Verknüpfung von PNA-Aminosäurekonjugaten
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批准号:5384365
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项目类别:Heisenberg Fellowships
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2002
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Der Austausch von Nucleobasen durch Fluorophorsysteme. Parallele Synthese und biophysikalische Untersuchung intern fluoreszenzmarkierter Peptidnucleinsäuren
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批准号:5299942
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Steuerung und Katalyse der chemischen Verknüpfung von PNA-Konjugaten durch Oligonucleotid-Template
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批准号:5202102
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:1999
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Catalytically active high performance auxiliaries for the proximity-induced native chemical peptide ligation
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批准号:524247156
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Self-cleaving Molecular Beacons for amplified nucleic acid detection
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批准号:456693735
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
Bispecific DNA-Peptide Probes for Targeting and Modulating Oncogenic Receptor Pairs
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批准号:460369763
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Oliver Seitz
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依托单位:
海外基金