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希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明

希土類イオンと核酸の錯体形成メカニズムの解明
阐明稀土离子与核酸之间的复合物形成机制
批准号：
06241279
负责人：
杉本 直己
金额：
$1.6万
依托单位：
Konan University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1994
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1994 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-06241279/
关键词：
希土類イオン核酸リボザイム構造予測RNADNA最近接塩基対モデル最近接塩基対パラメータ二次構造安定性

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项目成果

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本年度は希土類イオンと核酸の相互作用を研究する前段階として,RNA/DNAハイブリッド構造の安定性を,通常のカチオン存在下で予測できる手法の開発を試みた。まず,構造安定性の予測モデルとして最近接塩基対モデル(nearest‐neighbor model)を提案し,このモデルから予測されるRNA/DNAハイブリッドの融解挙動と実験結果を比較することによって,このモデルの妥当性を検討した。その結果,同一の最近接塩基対の組み合わせからなるr(CACGGCUC)/d(GAGCCGTG)とr(CUCACGGC)/d(GCCGTGAG)の融解挙動は,同じ濃度においては同一であり,融解温度も各々44.3℃,45.4℃と実験誤差範囲内で一致した。これに対して,配列は似ているが異なる最近接塩基対からなるr(AAGCGUAG)/d(CTACGCTT)とd(AAGCGTAG)/r(CUACGCUU)は融解挙動が大きく異なることが示された。これらの結果から,RNA/DNAハイブリッドの安定性を求めるのに最近接塩基対モデルを適用することは妥当であると考えられる。この結論は,同一の最近接塩基対の組み合わせからなっている他のハイブリッドでの結果や熱力学的諸量,円二色性(CD)測定およびゲル電気泳動の結果からも支持された。今後は,最近接塩基対パラメータ及び構造と反応に寄与する希土類イオンと他のイオンの協同効果を考察する予定である。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Naoki SUGIMOTO: "Thermodynamic Study of RNA/DNA Hybrids,(rA)_8(dT)_8 and (dA)_8(rU)_8" Rep.Prog.Poly.Phys.Jpn.37. 819-822 (1994)
Naoki SUGIMOTO：“RNA/DNA 杂交体的热力学研究，(rA)_8(dT)_8 和 (dA)_8(rU)_8”Rep.Prog.Poly.Phys.Jpn.37。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Naoki Sugimoto: "Effect of Na^+ and K^+ Ions on the Stability of DNAG-quartet" Rep.Prog.Poly.Phys.Jpn.37. 823-824 (1994)
Naoki Sugimoto：“Na^ 和 K^ 离子对 DNAG 四重奏稳定性的影响”Rep.Prog.Poly.Phys.Jpn.37。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Naoki SUGIMOTO: "Application of the Thermodynamic Parameters of DNA Stability Prediction to Couble-Helix Formation of Deoxyribooligonucleotides" Nucleosides&Nucleotides. 13. 1311-1317 (1994)
Naoki SUGIMOTO：“DNA 稳定性预测的热力学参数在脱氧核糖寡核苷酸双螺旋形成中的应用”
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Naoki SUGIMOTO: "Dynamic Behaviors of DNA Double Helix Containing a Bulged Nucleotide" Nucleic Acids Res.Symp.Ser.31. 301-302 (1994)
Naoki SUGIMOTO：“含有凸出核苷酸的 DNA 双螺旋的动态行为”核酸 Res.Symp.Ser.31。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 6 条
    Quantitative prediction of nucleic acid structures and functions affected by spaciotemporal environmental factors in cells
    • 批准号：
      22H04975
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
    • 资助金额：
      $126.3万
    • 财政年份：
      2022
    • 负责人：
      杉本 直己
    • 依托单位：
      Konan University
    Quantitative analysis of rRNA foding triggered by specific molecular crowding in nucleolus
    • 批准号：
      19F19337
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.41万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      杉本 直己
    • 依托单位：
      Konan University
    Analysis and regulation of non-canonical nucleic acids under intracellular conditions
    • 批准号：
      18KK0164
    • 项目类别：
      Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
    • 资助金额：
      $11.4万
    • 财政年份：
      2018
    • 负责人：
      杉本 直己
    • 依托单位：
      Konan University
    Development of tunable aptamers derived from natural riboswitches for making genetic control devices
    • 批准号：
      15F15345
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.47万
    • 财政年份：
      2015
    • 负责人：
      杉本 直己
    • 依托单位：
      Konan University
    国内基金
    海外基金
    CRISPR驱动的自维持催化核酸网络用于AFB1的高保真检测
    • 批准号：
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      李香芝
    • 依托单位：
      湖南农业大学
    人类免疫缺陷病毒（HIV）总核酸检测试剂盒
    仿生型核酸传递系统用于克服异质性肿瘤耐药的研究
    • 批准号：
      JCZRQNB202600598
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
    • 依托单位：
      武汉轻工大学
    基于功能框架核酸的钙网蛋白膜转位成像及相关肿瘤免疫调控研究
    • 批准号：
      2026JJ50011
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      郑晶
    • 依托单位：
      湖南大学