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高等植物の葉緑体ゲノムの比較解析

高等植物の葉緑体ゲノムの比較解析
高等植物叶绿体基因组的比较分析
批准号：
01618506
负责人：
杉浦 昌弘
金额：
$1.28万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1989
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1989 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-01618506/
关键词：
クロマツ葉緑体DNA塩基配列進化偽遺伝子イントロン

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高等植物の葉緑体ゲノムは、120〜160kbpの環状DNAより成り150個程の遺伝子を含む。高等植物間の系統関係を葉緑体ゲノムを用いて最も良い精度で明らかにするためには、同ゲノムの全塩基配列デ-タが要求される。本計画では、裸子植物のクロマツの葉緑体DNA(約120kbp)の塩基配列決定とゲノムの比較解析を行う。1)クロマツ葉緑体DNAの約20%の塩基配列をサンガ-法で決定した。その配列のうちに32kdタンパクなど20種の遺伝子を同定した。コ-ド領域の配列は、タバコの対応する配列と相同性が高かったが、遺伝子配列では大きな違いも見られた。特にpsbA遺伝子とtrnI遺伝子の配位は単・双子葉植物と異なっていた。2)すでに全塩基配列を決定した、単子葉のイネと双子葉のタバコのそれぞれの葉緑体ゲノムにつき詳細な比較解析を行ったところ、両者でいくつかの違いを見出した。逆位反復配列はイネの方が長く伸び、多くの遺伝子を含んでいた。大単一配列では大きな反転がみられ、イネのこの反転の両末端にはtRNA遺伝子の偽遺伝子や短い反復配列が見られた。これらのことからtRNA遺伝子が進化の過程でゲノムの再編成にかかわっているという仮説を立てた。tRNA遺伝子以外に、リボソ-ムタンパク遺伝子の偽遺伝子を3種見出した。分割遺伝子のrps12のイントロンと相同な配列がゲノムの2ケ所に存在しているが、この挿入についての説明はない。このような偽遺伝子は双子葉のタバコにはみられないことから、イネあるには単子葉に特徴的といえる。
期刊论文(16)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
姚文彪: "An additional promoter within the protein-coding region of the psbD-psbC gene cluster in tobacco chloroplast DNA." Nucleic Acids Research. 17. 9583-9591 (1989)
姚文彪：“烟草叶绿体 DNA 中 psbD-psbC 基因簇的蛋白质编码区中的一个附加启动子。” 17. 9583-9591 (1989)。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
杉浦 昌弘 (編集): "植物バイオテクノロジ- 実験マニュアル クロ-ニングとシ-クエンス" 農村文化社, 314 (1989)
Masahiro Sugiura（编辑）：“植物生物技术 - 实验手册克隆和测序” Rural Bunkasha，314（1989）
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
島田 浩章: "Pseudogenes and short repeated sequences in the rice chloroplast genome." Current Genetics. 16. 293-301 (1989)
Hiroaki Shimada：“水稻叶绿体基因组中的假基因和短重复序列。”《当代遗传学》16. 293-301 (1989)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
平塚純造: "The complete sequence of the rice(Oryza sativa)chloro-Plast genome:Intermolecular recombination between distinct tRNA genes accounts for a major plastid DNA inversion during the evolution of the cereals" Molecular and General Genetics. 217. 185-194
Junzo Hiratsuka：“水稻（Oryza sativa）叶绿体基因组的完整序列：不同 tRNA 基因之间的分子间重组是谷物进化过程中主要质体 DNA 倒置的原因”《分子与普通遗传学》217. 185-194。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 8 条
    葉緑体から核への遺伝子移行を説明する翻訳不適合説の実験的検証
    • 批准号：
      19657072
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.86万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    植物in vitro RNAスプライシング系の開発
    • 批准号：
      16657017
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.79万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    RNAエディティングによるゲノム情報の変換システム - 葉緑体ゲノムでの網羅的解析
    • 批准号：
      16011251
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $4.16万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    RNAエディティングによるゲノム情報の変換システム-葉緑体ゲノムでの解析-
    • 批准号：
      15011101
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.84万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      杉浦 昌弘
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    海外基金