トランスクリプトーム解析とファルマインフォマティクスの統合ゲノム薬理学

转录组分析和药物信息学的综合基因组药理学

• 批准号: 14657616
• 负责人: 田中 利男
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: Mie University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14657616/
• 关键词: DNAマイクロアレイ; トランスクリプトーム; 遺伝子クラスター

ポストゲノムシークエンス時代における薬理学研究は、新しいゲノムテクノロジーを基盤に国際的に急激な展開が認められる。この中でも特に、DNAマイクロアレイやディファレンシャルディスプレイなどによる包括的遺伝子発現プロファイル(トランスクリプトーム)解析技術は、近い将来臨床現場で活用されると、臨床医学にパラダイムシフトが起ると思われる。我々は、経済産業省プロジェクトに参加し、トランスクリプトーム解析技術における多くの技術的問題を克服し、標準的プロトコールを確立した。このプロトコールを活用して、ヒト血管平滑筋DNAチップを作製し、DNAマイクロアレイによりヒト血管平滑筋細胞のトランスクリプトーム変化を解析した。具体的には臨床循環器薬(ACE阻害薬、β受容体遮断薬)をヒト血管平滑筋細胞へ作用させ、各循環器薬の治療関連遺伝子クラスターを明らかにした。また、公開データベースから、主要医薬品(約1200成分)と多因子疾患(1214種)に関連する遺伝子(11980種)クラスターと文献をすべてダウンロードして、独自のデータベースを構築した。各循環器薬により作用を受ける遺伝子クラスターの機能的意義を、独自に構築したデータベースを用いて明らかにした。今後、それぞれの適応症において発現が変動する遺伝子クラスターを明らかにし、独自の病態薬理データベースを構築することにより、循環器系のゲノム薬理学の基盤を確立する予定である。

In the new era, biological research is needed to develop an international model of rapid development. The analysis technology of DNA, including gene expression, will be used in clinical field in the near future. We aim to overcome the technical problems of participating in the technical analysis of the Ministry of Industry and establish a standard technical system. We will use this technology to make blood vessel smooth muscle DNA switches, and analyze the transformation of blood vessel smooth muscle cells in DNA switches. Specific aspects of the clinical circulatory system (ACE inhibitor, beta receptor inhibitor) include vascular smooth muscle cell function, and treatment-related factors of each circulatory system. There are 11980 related genes (1214 kinds) of major medical drugs (about 1200 components) and multifactorial diseases (1214 kinds). The function of each circulator is to construct the function of each circulator independently. In the future, the occurrence of various diseases in the circulation system will be discussed in detail, and the construction of individual pathological conditions will be discussed in detail.

项目成果

Matsumoto Y: "Identification of highly expressed genes in peripheral blood T cells from patients with atopic dermatitis"Int Arch Allergy Immunol. 129(4). 327-340 (2002)

Matsumoto Y：“特应性皮炎患者外周血 T 细胞中高表达基因的鉴定”Int Arch Allergy Immunol。

田中利男: "薬理ゲノミクスからのゲノム創薬/医療への展開"日薬理誌(Folia Pharmacol.Jpn.). 120. 141-148 (2002)

Toshio Tanaka：“药物基因组学的基因组药物发现/医疗保健的发展”Folia Pharmacol Jpn. 120. 141-148 (2002)

Imai Y: "Cloning and characterization of the highly expressed ETEA gene from blood cells of atopic dermatitis patients"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 297. 1282-1290 (2002)

Imai Y：“特应性皮炎患者血细胞高表达 ETEA 基因的克隆和表征”Biochem。

田中 利男: "薬理ゲノミクスとファルマインフォマティクス"共立出版. 185 (2002)

Toshio Tanaka：“药物基因组学和药物信息学”Kyoritsu Shuppan 185 (2002)。

M.Hayashi: "Genomic organization, chromosomal localization, and alternative splicing of the human phosphodiesterase 8B gene"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 297. 1253-1258 (2002)

M.Hayashi：“人类磷酸二酯酶 8B 基因的基因组组织、染色体定位和选择性剪接”Biochem。