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3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼのX線構造解析

3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼのX線構造解析
3-甲基腺嘌呤DNA糖基化酶的X射线结构分析
批准号：
06235210
负责人：
山縣 ゆり子
金额：
$1.02万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1994
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1994 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-06235210/
关键词：
DNA修復酵素3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼ酵素反応機構

项目摘要

项目成果

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大腸菌の3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼIIは、強力な突然変異、致死作用を有するアルキル化剤によるDNA損傷のうち、主にN-アルキルプリン塩基を除去するDNA修復酵素である。本研究では、X線結晶構造解析法で3次元構造を決定し、本酵素のアルキル化DNA塩基の認識機構を原子レベルで解明するとともに、ラウエ法で酵素反応機構を解明するための基礎的データをえることを目的とし、本年度は以下の研究成果を得た。本年度は、まず、昨年度作成した2.8A分解能の電子密度図(4種の重原子誘導体を用いた多重同型置換法に基づく)をもとに本蛋白質の3次元立体構造モデルを構築した。引き続き、2.3A分解能データを用いてプログラムX-PLORで構造の精密化を行ない、R値20.6%を得た。本グリコシラーゼは、α+β型のドメイン1、allα型のドメイン2と3の3つのドメインから構成されている。枯草菌や酵母の3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼのアミノ酸配列と相同性の高い領域すべてが、酸化ピリミジンのグリコシラーゼのアミノ酸配列と相同性の高い領域すべてが、酸化ピリミジンのグリコシラーゼでもある大腸菌のエンドヌクレアーゼIIIと同一構造型であるドメイン2と3の間の溝に面していることから、この溝が活性に重要な部位と推定された。現在、この付近で3者間で保存されている残基の変異遺伝子を作成、アルキル化剤に対する感受性の変化を調べているが、ドメイン2と3の溝深くにあるAsp238が活性残基であることが示唆されている。ドメイン1は、TATAボックス結合蛋白質の対称的な2つのドメインと同一構造なので、DNAとの結合にかかわっている可能性が考えられる。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Y.Yamagata: "Conformation of 3-Substituted Purine Nucleoside Studied by X-Ray Crystallography and Theoretical Calculations" Nucleosides and Nucleotides. 13. 1327-1335 (1994)
Y.Yamagata：“通过X射线晶体学和理论计算研究3-取代嘌呤核苷的构象”核苷和核苷酸。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
S.Asano: "Reaction of 9-Substituted 1-Aminoadenienes with Nucleophiles and Syntheses of 3-Substituted 3H-Imidazo[4,5-e][1,2,4]triazolo[1,5-c][1,2,3]triazines" Nucleosides and Nucleotides. 13. 1453-1465 (1994)
S.Asano：“9-取代的 1-氨基腺烯与亲核试剂的反应以及 3-取代的 3H-咪唑并[4,5-e][1,2,4]三唑并[1,5-c][1,2”的合成
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Y.Yamagata: "Model for a Recognition of 3-Methyadenine by 3-Methyladenine DNA Glycosylase" Chem.Pharm.Bull.42. 2385-2387 (1994)
Y.Yamagata：“3-甲基腺嘌呤 DNA 糖基化酶识别 3-甲基腺嘌呤的模型”Chem.Pharm.Bull.42。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
S.Fujii: "Novel Molecular Conformation of(R,S)-Hesperetin in Anhydrous Crystal" Chem.Pharm.Bull.42. 1143-1145 (1994)
S.Fujii：“无水晶体中（R，S）-橙皮素的新型分子构象”Chem.Pharm.Bull.42。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 6 条
    膜に関わる蛋白質の構造生物学的研究
    • 批准号：
      19036023
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.84万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      山縣 ゆり子
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    自然突然変異抑制に働く8-oxo-dGTPaseの加水分解機構の解明
    • 批准号：
      18031029
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $7.49万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      山縣 ゆり子
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    がん化に関わる蛋白質の立体構造に基づく機能制御
    • 批准号：
      18011007
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $7.68万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      山縣 ゆり子
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    がん化に関わる転写因子の立体構造に基づく機能解明と阻害剤の接計
    • 批准号：
      17012019
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.63万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      山縣 ゆり子
    • 依托单位：
      Kumamoto University
    海外基金