3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼの反応機構

3-甲基腺嘌呤DNA糖基化酶的反应机理

基本信息

  • 批准号:
    08214208
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.96万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    1996
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1996 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

大腸菌の3-メチルアデニンDNAグリコシラーゼII(AlKA)は、強力な突然変異、致死作用を有するアルキル化剤によるDNA損傷の主生成物の一つ、3-メチルアデニンを除去し、生命の維持に働くDNA修復酵素である。申請者は本酵素のX線構造解析を行ない、2.3A分解能の3次元構造を得、活性部位を推定、変異酵素を用いた活性実験から活性残基を示した。本研究の最終目的は、本酵素とアルキル化DNA基質アナログ複合体のX線構造解析を行ない、アルキル化DNA基質認識機構を解明すること、並びに、ラウエ法を用いてグリコシラーゼ反応機構を解明することである。本年度は以下の研究成果を得た。(1)AlKAの3次元構造からアルキル化DNAとの複合体結晶作成にふさわしい鎖長をコンピューターグラフィックスで検討した。基質であるアルキル化DNAオリゴマーは化学合成が不可能なので、幾つかの合成可能な基質アナログを含む適当な鎖長のDNAオリゴマーを用いてAlKAとの相互作用を調べているが、現在のところ複合体結晶化に有効な修飾DNAオリゴマーを得られていない。引き続きAlKAと相互作用の強い修飾DNAオリゴマーの検索を行なう。(2)AlKAと活性が減少した変異蛋白質について、ラウエ法で酵素反応機構を解明する上で基礎となる酵素反応の速度論的解析を行なった。明らかになったKcatの値からAlKAの反応は、数分のオーダであること、変異型の反応はさらに遅いことがわかり、ラウエ法に加え、LTO(Large-angle Oscillation Technique)も利用できることが示唆された。(3)また、同様に求めたKm値からTrp218がアルキル化DNA基質認識に関与していることが示唆された。
Coliform 3-mer DNA Fragment II(AlKA) is a potent, mutagenic, lethal agent for DNA damage and DNA repair enzymes for the maintenance of life. The applicant has performed X-ray structural analysis of the enzyme, obtained the three-dimensional structure of 2.3A decomposition energy, estimated the active site, and indicated the active residue of the enzyme. The ultimate goal of this study is to analyze the X-ray structure of the DNA matrix complex, and to understand the mechanism of DNA matrix recognition by using the enzyme. The following research results were obtained during the year. (1)AlKA's three-dimensional structure is composed of complex DNA crystals. The matrix is composed of DNA molecules that are chemically synthesized, but not chemically synthesized. The matrix is composed of DNA molecules that are appropriately locked. The interaction between AlKA and DNA molecules is modulated. The crystallization of the complex is modified by DNA molecules. Alka interaction and strong modification of DNA (2)AlKA activity is reduced and different proteins are analyzed. The enzyme reaction mechanism is analyzed on the basis of enzyme reaction rate theory. Alka's anti-vibration, multi-minute anti-vibration, LTO(Large-angle Oscillation Technique), etc. (3)This is the first time that we've seen this.

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
N.Nishizono et al.,: "Nucleosides and Nucleotides.159.Synthesis of Thietane Nucleosides Via the Pummerer Reaction as a Key Step" Tetrahedron Lett.,. 37. 7569-7572 (1996)
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  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
J.Funahashi et al.,: "The Structure,Stability,and Folding Process of Amyloidogenic Mutant Human Lysozyme" J.Biochem.,. 120. 1216-1223 (1996)
J.Funahashi 等人,:“淀粉样变突变体人溶菌酶的结构、稳定性和折叠过程”J.Biochem.,。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
S.Asano et al.,: "Reaction of 9-Substituted 1-Aminoadenine with Hydrazine" J.Heterocyclic Chem.,. 33. 1151-1121 (1996)
S.Asano 等人,:“9-取代的 1-氨基腺嘌呤与肼的反应”J.Heterocycl Chem.,。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Y.Yamagata et al.,: "Three-dimensional Structure of a DNA Repair Enzyme,3-Methyl-adenine DNA Glycosylase II,from Escherichia coli" Cell. 86. 311-319 (1996)
Y.Yamagata 等人:“DNA 修复酶的三维结构,来自大肠杆菌的 3-甲基-腺嘌呤 DNA 糖基化酶 II”细胞。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
K.Takano et al.,: "Contribution of the Hydrophobic Effect to the Stability of Human Lysozyme:" Biochemistry. 36. 688-698 (1997)
K.Takano 等人:“疏水效应对人类溶菌酶稳定性的贡献:”生物化学。
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  • 发表时间:
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  • 通讯作者:
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山縣 ゆり子其他文献

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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    山縣 ゆり子
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  • 发表时间:
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  • 作者:
    平 大輔;北村 龍史;中村 照也;山縣 ゆり子;古川 憲治;藤井 隆夫
  • 通讯作者:
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作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了