非共有結合により四次構造を形成する人工DNA結合タンパク質の構築とその機能解析

通过非共价键形成四级结构的人工DNA结合蛋白的构建及其功能分析

• 批准号: 08219222
• 负责人: 森井 孝
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08219222/
• 关键词: 分子認識; ホストーゲスト; オリゴペプチド; 協同性; DNA認識; インディユ-ストフィット; ロイシンジッパータンパク質; αヘリックス

ロイシンジッパー型タンパク質(b-ZIP)は二量体を形成してDNAと塩基配列特異的に結合し、その二量体形成部位はロイシンが繰り返し存在するロイシンジッパーであり、DNA結合部位は塩基性アミノ酸が数多く存在するベーシック・リ-ジョンである。ベーシック・リ-ジョンとロイシンジッパーは連続したα-ヘリックス中に存在するため、ロイシンジッパーの構造変化は分子内で伝播してベーシック・リ-ジョンの構造に影響を与えると考えられる。ロイシンジッパー部分が安定なヘリックスを形成することにより、そのN末端側にあるベーシック・リ-ジョンはヘリックス構造を形成しやすくなっていることが考えられる。ロイシンジッパー部分の二量体形成にともなう構造変化がb-ZIPのDNA結合能および塩基配列選択性に与える影響を検討するために、(1)天然型GCN4ペプチド(56アミノ酸)、(2)二量体形成をコイルド・コイルではなく構造変化を伴わないホストーゲスト複合体によって形成したGCN4ベーシックリージョンペプチド、そして(3)コイルドコイルで二量体形成するが、ロイシンジッパー部位の構造変化がベーシックリージョンに伝播しないと考えられる、ロイシンジッパー部位とベーシックリージョンをジスルフィド結合でつないだペプチドについて、DNAとの結合を調べた。これらの結果からDNA結合部位の構造は、コイルドコイル構造によって安定化されており、ベーシックリージョンの構造が変化しやすいほど、そのDNA認識能が鋭敏さを増していることがわかった。

B-ZIP is a biome formation site that binds specifically to DNA and base alignment. The biome formation site is a biome formation site that exists in a number of basic acid binding sites. The structure of the molecular structure. Some of them are formed by the end of the N terminal. A Study of the Effects of Structural Change on the Formation of Binary Complexes in the B-ZIP Region,(1) Natural Type GCN4 (56 amino acids),(2) Binary Formation,(3) Structural Change,(4) Complex Formation,(5) Complex Formation,(6) Complex Formation,(7) Complex Formation,(8) Complex Formation,(9) Complex Formation (3) The structure of the two-dimensional structure of the U.S. dollar, the structure of the U.S. dollar, and the structure of the U.S. dollar. As a result, the structure of DNA binding site was stabilized, and the structure of DNA binding site was stabilized. The sensitivity of DNA binding site was increased.

项目成果

Takashi Morii他: "Factors Governing the Sequence-Selective DNA Binding of Geometrically Constrained Peptide Dimers" Journal of the American Chemical Society. 199(in press). (1997)

Takashi Morii 等人：“影响几何约束肽二聚体的序列选择性 DNA 结合的因素”美国化学会杂志 199（出版中）。

Takashi Morii他: "Cooperative Oligomerization Enhances Sequence-Selective DNA Binding by a Short Peptide" Journal of the American Chemical Society. 118. 10011-10017 (1996)

Takashi Morii 等人：“协同寡聚化通过短肽增强序列选择性 DNA 结合”美国化学会杂志 118. 10011-10017 (1996)。

Masako Okagami他: "DNA recognition by covalently constrained peptide dimers : roles of the constraints for sequence-selectivity" Nucleic Acids Symposium Series. No.35. 163-164 (1996)

Masako Okagami 等人：“共价约束肽二聚体的 DNA 识别：序列选择性约束的作用”核酸研讨会系列第 35 期（1996 年）。