時計タンパク質複合体のX線結晶構造解析と複合体形成のダイナミクス
時計タンパク質複合体のX線結晶構造解析と複合体形成のダイナミクス
批准号:
13033017
负责人:
石浦 正寛
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002
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多くの生物において、様々な生理現象の活性が24時間の周期で変動することが知られており、我々はこの細胞内のリズム発振分子機構を「生物時計」と呼んでいる。この生物時計は、地球の自転に伴い24時間周期で繰り返される光や温度などの外部環境の変化に適応するための機構と考えられている。我々は藍色細菌で生物時計の中核遺伝子クラスターkaiABCを同定し、その発現機構を分子遺伝学的に詳細に解析した。今後は生物時計を非常に精巧な分子装置である「生物時計装置」と捉え、生物時計装置を構築する時計タンパク質、時計関連タンパク質の諸性質・物性を生化学的・生物物理化学的・構造生物学的手法を用いて解明する。タンパク質科学の研究に適した耐熱性タンパク質を利用するために、日本の温泉から単離され、既に幾つかのタンパク質のX線結晶構造解析で成果をあげている好熱性藍色細菌Thermosynechococcus elongatus BP-1由来のタンパク質を用いて生物時計の実験系を構築した。これまでに、KaiBの結晶から良好な回折像を得ることができ、現在位相決定を行っている。KaiAについて、生化学的解析の積み重ねから完全長のKaiAは結晶化し難いと判断した。同時にKaiAは三つのドメイン構造(N末端ドメイン、uzドメイン、C末端ドメイン)からなること、C末端ドメインにKaiAの主要な機能が存在することを見いだした。そこで、C末端ドメインの結晶構造解析に臨んだところ、良好な回折点を示す結晶を得ることができた。現在位相の決定を行っている。KaiC、Pexとも結晶は得られているが、結晶サイズの問題、結晶化の再現性の問題、回折点が得られない問題に直面している。これら問題を引き起こす原因を生化学的・生物物理化学的解析から見いだすことができた。現在、新たに変異タンパク質を調製し、結晶化をはじめている。
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Aoki S, Kondo T, Ishiura M: "A promoter-trap vector for clock-controlled genes in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803"J. Microbiol. Methods. (in press).
Aoki S、Kondo T、Ishiura M:“蓝藻集胞藻 PCC 6803 中时钟控制基因的启动子捕获载体”J。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Taniguchi Y et al.: "Two KaiA-binding domains of cyanobacterial circadian clock protein KaiC"FEBS Letters. 496. 86-90 (2001)
Taniguchi Y 等人:“蓝藻生物钟蛋白 KaiC 的两个 KaiA 结合域”FEBS Letters。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Ronald Brudler: "Identification of a new cryptochrome class : structure, function and evolution"Molecular Cell. 11. 59-67 (2003)
罗纳德·布鲁德勒:“新隐花色素类的鉴定:结构、功能和进化”分子细胞。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Fumio Hayashi: "ATP-induced Hexamer formation and structure of the cyanobacterial circadian clock protein KaiC"Genes to Cells. 8・3. 287-296 (2003)
Fumio Hayashi:“ATP 诱导的蓝藻生物钟蛋白 KaiC 的六聚体形成和结构”Genes to Cells 287-296 (2003)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
生物発光リズムデータの解析とデーターベースの構築
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批准号:20016010
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.25万
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财政年份:2008
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
生物時計ナノ装置の原子レベルでの解明
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批准号:19037014
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.58万
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财政年份:2007
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
時計タンパク質の核移行と核におけるリズム発振機構の解析
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批准号:19038010
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.99万
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财政年份:2007
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
時系列データ統合解析プログラムの開発とこれによる生物時計ネットワークの網羅的解析
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批准号:18016010
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.12万
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财政年份:2006
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
生物時計装置作動の可視化
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批准号:17657063
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
時計タンパク質KaiCの一生
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批准号:17028025
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.42万
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财政年份:2005
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
好熱性藍色細菌のDNAマイクロアレイの開発と生物時計研究への応用
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批准号:16013216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.48万
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财政年份:2004
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
生物時計装置の一分子測定
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批准号:16657056
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
好熱性藍色細菌のDNAマイクロアレイの開発と生物時計研究への応用
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批准号:15013223
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2003
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
生物時計装置の原子レベルでの解明
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批准号:15657047
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2003
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
生物時計に関与する分子シャペロンとATP依存性プロテアーゼの同定とその作用機構
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批准号:15032220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.38万
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财政年份:2003
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
好熱性藍色細菌のDNAマイクロアレイの開発と生物時計研究への応用
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批准号:14014215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.48万
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财政年份:2002
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
生物時計に関与する分子シャペロンとATP依存性プロテアーゼの同定とその作用機構
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批准号:14037227
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2002
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
藍色細菌のDNAチップの開発と生物時計研究への応用
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批准号:13206030
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2001
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
藍藻における概日リズムの分子機構の解明
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批准号:13024235
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2001
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
クラミドモナスの遺伝子発現のリアルタイムモニタリング
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批准号:13878146
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2001
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
始原菌の生物時計タンパク質KaiCの構造と機能
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批准号:11877048
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1999
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
始原菌の藍色細菌生物時計遺伝子KaiCホモローグの機能
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批准号:10877047
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
藍色細菌時計遺伝子ホモローグの真核主物での探索
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批准号:09874158
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
バクテリア界における生物時計の進化
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批准号:08877053
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:石浦 正寛
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依托单位:
海外基金