课题基金 / 基金详情

ベント構造を利用する新しい高精度DNA/RNA検出法

ベント構造を利用する新しい高精度DNA/RNA検出法
利用通风孔结构的新型高精度DNA/RNA检测方法
批准号：
14011216
负责人：
関根 光雄
金额：
$2.94万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2002 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14011216/
关键词：
2-チオウラシル塩基二重分子識別原理マイナーグルーブバインダーDNA検出法フェロセン電気化学的遺伝子検出法ハイブリダイセーション人工RNA

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本年度は、提案した二重分子識別原理に基づく新しい高精度DNA/RNA検出法の第一段階として、2-チオウラシル塩基をウラシル塩基の代わりに導入したRNAの化学合成をおこなった。この人工RNAの塩基識別能力を調べるために、相補鎖のRNAを合成し、ハイブリダイゼーション能力を示すTm値を測定した。同時に2-チオチミンを含むDNAを合成し、相補的なDNAやRNAとの2重らせんのTm値も測定し、その熱安定性を比較した。その結果、2-チオウラシル塩基や2-チオチミン塩基はRNA鎖に組み込まれたとき、最も精密な塩基識別能力を発揮することがわかった。また、RNA/RNA同士の2重らせんが最も安定になることも判明した。これらの知見を現在、RNAチップの合成を指向して研究を展開している。一方、電気化学的RNA検出法の開発のためマイナーグルーブバインダー分子をフェロセンに結合した分子の合成を検討した。フェロセンの2つの5員環にそれぞれDNAのマイナーグルーブに結合できるようにイミダゾールとピロール分子を連結させたものが、標的分子である。この分子を合成するために、まず、フェロセンジカルボン酸に選択的モノエステル化を行い、エステル化されていないカルボキシル基とマイナーグルーブバインダーの一本鎖を連結するため、もっとも有効なスペーサの検討をおこなった。その結果、グリシンスペーサーを用いるとフェロセン骨格とバイナーグルーブバインダー間に相互作用が起こり、分解しやすいことがわかった。そこで、現在、グリシンの代わりに少し鎖長が長いものをスペーサーとして用いることを検討している。
期刊论文(14)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Tomohisa Moriguchi et al.: "First Synthesis and Anti-Cancer Activity of Phosmidosine and Its Related Compounds"J.Org.Chem.. 67. 3290-3300 (2002)
Tomohisa Moriguchi 等人：“Phosmidosine 及其相关化合物的首次合成和抗癌活性”J.Org.Chem.. 67. 3290-3300 (2002)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Shun-ichi Kawahara et al.: "Kawahara, Shunichi ; Uchimaru, Tadafumi ; Taira, Kazunari ; Sekine, Mitsuo.An Ab Initio Study of the Hydrogen Bond Energy of Base Pairs Formed between Substituted 9-Methylguanine Derivatives and 1-Methylcytosine"J.Phys.Chem.(A)
Shun-ichi Kawahara 等人：“Kawahara，Shunichi；Uchimaru，Tadafumi；Taira，Kazunari；Sekine，Mitsuo。取代的 9-甲基鸟嘌呤衍生物和 1-甲基胞嘧啶之间形成的碱基对的氢键能的从头算研究”J
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Kazunori Takahashi et al.: "A Photochemical/Chemical Direct Method of Synthesizing High-Performance Deoxyribonucleic Acid Chips for Rapid and Parallel Gene Analysis"Sensors and Actuators, B.. B83. 67-76 (2002)
Kazunori Takahashi 等人：“用于快速并行基因分析的高性能脱氧核糖核酸芯片的光化学/化学直接合成方法”传感器和执行器，B.. B83。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Akio Kobori et al.: "A New Method for the Synthesis of Oligodeoxynucleotides Containing 4-N-Alkoxycarbonyldeoxycytidine Derivatives and Their Hybridization Property"J.Org.Chem.. 67. 476-485 (2002)
Akio Kobori 等：“合成含有 4-N-烷氧基羰基脱氧胞苷衍生物的寡脱氧核苷酸的新方法及其杂交特性”J.Org.Chem.. 67. 476-485 (2002)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 7 条
    筋ジストロフィー治療薬を目指した新規人工核酸の合成
    • 批准号：
      25288074
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $9.07万
    • 财政年份：
      2013
    • 负责人：
      関根 光雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    二重分子識別原理に基づく新しい高精度DNA/RNA検出法
    • 批准号：
      16011219
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.14万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      関根 光雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    二重分子識別原理に基づく新しい高精度DNA/RNA検出法
    • 批准号：
      15011215
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.39万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      関根 光雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    非天然型DNA2重らせんの創成
    • 批准号：
      15651091
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.54万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      関根 光雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    海外基金