標的遺伝子の選択的不活性化機能をもつアンチセンスDNAの設計と合成
標的遺伝子の選択的不活性化機能をもつアンチセンスDNAの設計と合成
批准号:
01540451
负责人:
関根 光雄
金额:
$1.15万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份:
1989
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1989 至 --
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アンチセンスDNAの化学合成に必要な新しい基礎反応を確立するため、まず5'および3'末端にメチル基を導入する反応を検討した。このメチル化反応は設計合成したアンチセンスDNAが標的DNA分子と結合し二重鎖DNAとなったとき、混在するDNA分解酵素から分解をうけないように5'および3'末端のヌクレオシドの糖水酸基をO-メチル化するものである。糖水酸基を選択的にO-メチル化するため、末端のヌクレオシドとしてチミジンを選び、これを一旦1,3-ベンゾジチオリリウムテトラフルオロボレ-トでピリジン中反応させ5'糖水酸基に1,3-ベンゾジチオ-ル-2-イル(BDT)基を導入し、つづけてラネ-ニッケルで還元し5'-O-トリチルチミジンを得た。3'-O-メチルチミジンの合成も5'-O-トリチルチミジンを同様な方法で反応させたのち脱トリチル化して得ることができた。アンチセンスDNAのオリゴタクレオチド部位の合成はフェニルチオ基をインタ-ヌクレオチド結合のリン酸基の保護基として活用し、上述した5'-O-メチルチミジンと3'-O-メチルチミジンをそれぞれ5'および3'末端ヌクレオシドとして組み込みトリの肉腫ウイルスSar遺伝子に相補的な18量体の保護体を合成した。最終的にすべての保護基を除去しアンチセンスDNA18量体を得た。次に、このアンチセンスDNAに機能性を付与するため、すなわち細胞膜透過性を向上させるため、リン酸基のかわりにエトキンカルボニルホスホニル基に置換したDNAオリゴマ-の合成を検討した。その結果、エトキシカルボニル基を最終的にアンモニア処理でカルバモイルホスホネ-ト基に変換する際一部DNA鎖が切断されてしまうことがわかった。そこで、DNA鎖切断の副反応を防止する目的で種々の一級アミンを用いてN-アルキルカルバモイルホスホネ-ト基に変換しその安定性について現在検討中である。
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J.MATSUZAKI et al.: "Bis(2,4,6-tribromophenyl)phosphorochloridate:A New Type of Condensing Reagent in Oligonucleotide Synthesis" Nucleosides & Nucleotides. 8. 367-382 (1989)
J.MATSUZAKI 等人:“双(2,4,6-三溴苯基)氯化磷酸酯:寡核苷酸合成中的新型缩合试剂”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
M.Sekine et al.: "General Method for the Preparation of N^3- and O^4-Substituted Uridine Derivatives by Phase-Transfer Reactions" J.Org.Chem.54. 2321-2326 (1989)
M.Sekine 等人:“通过相转移反应制备 N^3- 和 O^4-取代尿苷衍生物的通用方法”J.Org.Chem.54。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Mitsuo SEKINE et al.: "2-Methylthio)phenylthiomethyl(MPTM):A New Protecting Group of Hydroxyl Groups Capable of Conversion to a Methyl Group" J.Org.Chem.54. 5998-6000 (1989)
Mitsuo SEKINE 等人:“2-甲硫基)苯硫基甲基(MPTM):能够转化为甲基的新型羟基保护基团”J.Org.Chem.54。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
T.WADA et al.: "O-Alkyl O-Nucleoside 3'-Phosphonates as Novel Starting Materials for Oligonucleotide Synthesis" Nucleic Acids Res.,Symposium Series. 21. 27-28 (1989)
T.WADA 等人:“O-烷基 O-核苷 3-磷酸盐作为寡核苷酸合成的新型起始材料”核酸研究,研讨会系列。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Mitsuo SEKINE et al.: "Facile Synthesis of 3'-O-Methylthymidine and 3'-Deoxythymidine and Related Deoxygenated Thymidine Derivative:A New Method for Selective Deoxygenation of Secondary Hydroxyl Groups" J.Org.Chem.55. 924-928 (1990)
Mitsuo SEKINE 等人:“3-O-甲基胸苷和 3-脱氧胸苷及相关脱氧胸苷衍生物的简便合成:二级羟基选择性脱氧的新方法”J.Org.Chem.55。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
筋ジストロフィー治療薬を目指した新規人工核酸の合成
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批准号:25288074
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$9.07万
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财政年份:2013
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
二重分子識別原理に基づく新しい高精度DNA/RNA検出法
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批准号:16011219
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.14万
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财政年份:2004
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
二重分子識別原理に基づく新しい高精度DNA/RNA検出法
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批准号:15011215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.39万
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财政年份:2003
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
非天然型DNA2重らせんの創成
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批准号:15651091
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2003
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
抗C型肝炎ウイルス活性をもつ新しいヌクレオシド誘導体の合成と活性評価
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批准号:14021032
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.01万
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财政年份:2002
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
ベント構造を利用する新しい高精度DNA/RNA検出法
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批准号:14011216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.94万
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财政年份:2002
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
5’水酸基と3’リン酸基の同時保護法による核酸の化学合成
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批准号:11878106
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1999
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
ベント構造をもつ核酸の化学合成
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批准号:09878115
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
tRNAに存在する特異な構造モチーフの分子固定と構造解析
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批准号:09278209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
がん遺伝子に特異的に結合できるペプチド核酸を用いる新しいがん治療法
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批准号:07274224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.92万
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财政年份:1995
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
tRNAアンチコドン部位のコンホメーションの人工固定化およびその分子認識能
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批准号:07250206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1995
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
がん遺伝子に特異的に結合できるペプチド核酸を用いる新しいがん治療法-高ハイブリダイゼーション能力をもつ新素材分子の可能性-
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批准号:06282220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.05万
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财政年份:1994
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
tRNAアンチコドン部位のコンホメーションの人工的固定化およびその分子認識能
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批准号:06258204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1994
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
tRNAアンチコドン部位のコンホメーションの人工的固定化およびその分子認識能
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批准号:05265207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1993
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
特異な分岐構造をもつ核酸の化学合成と機能
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批准号:02250214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1990
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
投げなわ構造をもつRNA分子の2'-5'結合を含む環状RNAの構築反応
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批准号:63540421
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1988
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
ペプチド側鎖に共有結合したRNAオリゴマーの化学合成に関する基礎的研究
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批准号:62540402
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1987
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
DNA遺伝子の"純粋"化学合成に関する基礎的研究
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批准号:58740243
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1983
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
発ガン遺伝子の化学合成:共通塩基配列DNA30量体の合成
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批准号:57740260
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1982
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
遺伝子の化学合成:核酸フラグメントの合成に必要な実用性の高い強力な縮合剤の研究
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批准号:56740207
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.52万
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财政年份:1981
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负责人:関根 光雄
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依托单位:
海外基金