课题基金 / 基金详情

ベント構造をもつ核酸の化学合成

ベント構造をもつ核酸の化学合成
弯曲结构核酸的化学合成
批准号：
09878115
负责人：
関根 光雄
金额：
$1.34万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
1997
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1997 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09878115/
关键词：
ベント構造コンホメーション3'-endoシクロウリジル酸立体異性体tRNA固相合成リン酸トリエステル

项目摘要

项目成果

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本研究は、核酸分子を人為的に折り曲げる新しい手法を開発することを目的とするものである。まず、核酸に、ベント構造を組み込むため、ベントする位置にコンホメーションを固定したヌクレオチドユニットの合成が必要である。そのため、tRNAの三次元構造からヒントを得て、ウリジル酸の塩基部位の5位と5'リン酸基との間にリンカーを導入し、最もリボース部位がRNA型のC3'endo型に固定した環状ウリジル酸とその上流にさらに2'-O-メチルウリジンを縮合させ、環状構造を下流のウリジンに存在するUmpUm誘導体を合成した。この2量体にはリン酸トリエステル構造が生じるため、Rp体とSp体のジアステレオマ-が得られた。これらの立体異性体は各々分離精製することができた。それぞれの立体異性体の2量体の3'末端にアミダイト基を導入し、Rp体とSp体の2量体のアミダイト合成ユニットを合成した。このリン酸エステル結合の立体が固定された合成ユニットを通常のオリゴヌクレオチドの固相合成に用いることによって、デカチミジル酸とデカウリジル酸の真ん中の位置に導入し、Rp体とSp体の立体をもつデカチミジル酸とデカウリジル酸をそれぞれ合成することができた。相補的なdA_<10>とA_<10>とハイブリダイゼーション能力を調べる、その安定性比較することによって、Rp体とSp体の立体を決定した。この結果、Sp体の立体をもつオリゴヌクレオチドが核酸を曲げることのできる立体をもつことがわかった。
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会议论文
H.Tsuruoka, K.Shohda, T.Wada, M.Sekine: "Kinetics and Mechanism of Facile and Selective Dephosphorylation of 2′-Phosphorylated and 2′-Thiophosphorylated Dinucleotides" Journal of Organic chemistry. 62・9. 2813-2822 (1997)
H.Tsuruoka、K.Shohda、T.Wada、M.Sekine：“2′-磷酸化和 2′-硫代磷酸化二核苷酸的轻松和选择性去磷酸化的动力学和机制”有机化学杂志 62・9。 1997）
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
K.Seio, O.Kurasawa, T.Wada, M.Sekine, et al: "Synthesis and Properties of Conformationally Rigid Cyclouridylic Acids Having Covalent Bond Between the Uracil 5-Position and the 5'-Phosphate Group" Nucleoside Nucleotides. 16・7-9. 1023-1032 (1997)
K.Seio、O.Kurasawa、T.Wada、M.Sekine 等人：“尿嘧啶 5 位和 5-磷酸基团之间具有共价键的构象刚性环尿苷酸的合成和性质”核苷核苷酸 16・。 7-9。1023-1032（1997）
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
T.Wada, F.Honda, Y.Sato, S.Kawahara, M.Sekine: "Chemical Synthesis of H-Phosphonate DNA without Using N-Protecting Groups" Nucleic Acids Symposium Series. 37. 19-20 (1997)
T.Wada、F.Honda、Y.Sato、S.Kawahara、M.Sekine：“不使用 N 保护基团的 H-磷酸 DNA 的化学合成”核酸研讨会系列。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
T.Wada, Y.Sato, F.Honda, S.Kawahara, M.Sekine: "Chemical Synthesis of Oligodeoxyribonucleotides Using N-Unprotected H-Phosphonate Monomers and Carbonium and Phosphoniun Condensing Reagents" Journal of American Chemical Society. 119・52. 12710-12721 (1997)
T.Wada、Y.Sato、F.Honda、S.Kawahara、M.Sekine：“使用 N-未保护的 H-磷酸酯单体和碳和膦缩合试剂化学合成寡脱氧核糖核苷酸”美国化学会杂志 119・52。 12710-12721 (1997)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 6 条
    筋ジストロフィー治療薬を目指した新規人工核酸の合成
    • 批准号：
      25288074
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $9.07万
    • 财政年份：
      2013
    • 负责人：
      関根 光雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    二重分子識別原理に基づく新しい高精度DNA/RNA検出法
    • 批准号：
      16011219
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.14万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      関根 光雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    二重分子識別原理に基づく新しい高精度DNA/RNA検出法
    • 批准号：
      15011215
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.39万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      関根 光雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    非天然型DNA2重らせんの創成
    • 批准号：
      15651091
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.54万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      関根 光雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    海外基金